230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10800 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4560  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  64.91 
 
 
557 aa  670    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.935324  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0883  putative FAD-binding dehydrogenase  64.62 
 
 
552 aa  681    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.237453  normal  0.672197 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5200  putative FAD-binding dehydrogenase  61.15 
 
 
556 aa  643    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2085  putative FAD-binding dehydrogenase  62.09 
 
 
558 aa  655    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.376668  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3223  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  66.48 
 
 
550 aa  662    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1140  putative FAD-binding dehydrogenase  66.02 
 
 
573 aa  645    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.196555  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5288  putative FAD-binding dehydrogenase  61.15 
 
 
556 aa  643    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.918325  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5132  putative FAD-binding dehydrogenase  79.78 
 
 
555 aa  849    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3668  putative FAD-binding dehydrogenase  62.11 
 
 
552 aa  657    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114123  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6214  putative FAD-binding dehydrogenase  62.52 
 
 
551 aa  655    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5580  putative FAD-binding dehydrogenase  61.33 
 
 
556 aa  643    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.684507  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1621  putative FAD-binding dehydrogenase  79.74 
 
 
545 aa  849    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2532  putative FAD-binding dehydrogenase  65.97 
 
 
551 aa  666    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.608155 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3994  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  62.41 
 
 
571 aa  635    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.542255  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0163  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  66.73 
 
 
548 aa  709    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2248  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  69.35 
 
 
555 aa  684    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.826896  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1725  putative FAD-binding dehydrogenase  63.75 
 
 
551 aa  665    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.64226  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10800  putative FAD-binding dehydrogenase  100 
 
 
566 aa  1139    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2713  putative FAD-binding dehydrogenase  66.42 
 
 
551 aa  667    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0401801  hitchhiker  0.00069854 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0741  putative FAD-binding dehydrogenase  62.39 
 
 
555 aa  633  1e-180  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3745  putative FAD-binding dehydrogenase  59.67 
 
 
549 aa  628  1e-178  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06450  predicted oxidoreductase  60.51 
 
 
559 aa  625  1e-178  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08090  predicted oxidoreductase  63.74 
 
 
549 aa  627  1e-178  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0173464  normal  0.283602 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3775  putative FAD-binding dehydrogenase  60.89 
 
 
553 aa  621  1e-177  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0957  putative FAD-binding dehydrogenase  58.98 
 
 
558 aa  622  1e-177  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1043  putative FAD-binding dehydrogenase  58.7 
 
 
558 aa  622  1e-177  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1896  putative FAD-binding dehydrogenase  61.17 
 
 
557 aa  619  1e-176  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4333  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  60.19 
 
 
597 aa  608  1e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0670  putative FAD-binding dehydrogenase  60.62 
 
 
551 aa  603  1.0000000000000001e-171  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0628  putative FAD-binding dehydrogenase  60.62 
 
 
551 aa  604  1.0000000000000001e-171  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0675  putative FAD-binding dehydrogenase  62.26 
 
 
552 aa  598  1e-169  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.935742  normal  0.139475 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1100  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  59.02 
 
 
551 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000939173 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0191  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  58.95 
 
 
550 aa  566  1e-160  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0214  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  52.88 
 
 
558 aa  540  9.999999999999999e-153  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1344  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  54.74 
 
 
559 aa  536  1e-151  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.543603  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2414  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  54.61 
 
 
571 aa  524  1e-147  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0440095  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2343  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  39.12 
 
 
552 aa  337  3.9999999999999995e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0870  putative fumarate reductase flavoprotein  36.78 
 
 
549 aa  314  3.9999999999999997e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  40.04 
 
 
537 aa  309  1.0000000000000001e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.223151  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4675  putative fumarate reductase flavoprotein  38.09 
 
 
533 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.572233  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2809  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  37.17 
 
 
537 aa  302  9e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3486  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  37.17 
 
 
537 aa  297  3e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.664087  normal  0.809041 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3510  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  36.59 
 
 
541 aa  296  7e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1003  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.65 
 
 
522 aa  162  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  23.43 
 
 
608 aa  95.1  3e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03960  FAD dependent oxidoreductase  63.29 
 
 
98 aa  93.6  9e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.933434  normal  0.205844 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  24.1 
 
 
597 aa  89.7  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0945  Succinate dehydrogenase  24.5 
 
 
511 aa  83.6  0.000000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  22.08 
 
 
502 aa  83.6  0.000000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  25.36 
 
 
589 aa  81.3  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1029  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.44 
 
 
509 aa  77  0.0000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_10064  predicted protein  24.28 
 
 
561 aa  75.1  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.14351 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  24.08 
 
 
598 aa  75.1  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3181  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.53 
 
 
523 aa  74.3  0.000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.357921  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1444  flavocytochrome c  23.49 
 
 
512 aa  73.9  0.000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0795  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.28 
 
 
509 aa  72.8  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.820864  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3252  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.7 
 
 
523 aa  71.6  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.556116  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  23.51 
 
 
504 aa  71.6  0.00000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  23.61 
 
 
591 aa  71.6  0.00000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4061  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  22.72 
 
 
476 aa  71.2  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27122  predicted protein  23.8 
 
 
587 aa  70.9  0.00000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0188056 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52061  predicted protein  23.8 
 
 
587 aa  70.9  0.00000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51720  fumarate reductase flavoprotein  23.68 
 
 
668 aa  70.5  0.00000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.744935  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21320  fumarate reductase/succinate dehyfrogenase, flavoprotein subunit  26.9 
 
 
514 aa  70.5  0.00000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.22533  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3301  flavocytochrome c flavin subunit  28.76 
 
 
499 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04200  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  23.92 
 
 
481 aa  63.9  0.000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.906237  normal  0.517886 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2731  putative flavoprotein subunit of a reductase  24.21 
 
 
507 aa  62.8  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.620849  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1037  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  26.19 
 
 
463 aa  62.8  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.192722  normal  0.0849595 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2894  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.77 
 
 
529 aa  62  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0165292  hitchhiker  0.000448653 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4075  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  22.6 
 
 
484 aa  61.6  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  21.54 
 
 
519 aa  61.6  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  23.77 
 
 
589 aa  60.8  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22640  aspartate oxidase  24.7 
 
 
623 aa  58.9  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.73746 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0508  putative dehydrogenase flavoprotein  24.56 
 
 
560 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.890159  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2930  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.43 
 
 
512 aa  59.3  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  26.46 
 
 
586 aa  58.5  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0270  flavocytochrome c flavin subunit  26.98 
 
 
511 aa  58.5  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2826  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.9 
 
 
543 aa  57.8  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01543  hypothetical fumarate reductase (Eurofung)  49.23 
 
 
627 aa  57.4  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000554356  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0340  flavocytochrome c  29.54 
 
 
500 aa  57.8  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  23.64 
 
 
609 aa  57.4  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  24.32 
 
 
596 aa  57.4  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  24.64 
 
 
596 aa  57.4  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53948  Osmotic growth protein  23.99 
 
 
659 aa  57.4  0.0000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.621591 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  24.01 
 
 
596 aa  57.4  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  39.36 
 
 
588 aa  57  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  26.84 
 
 
598 aa  57  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  27.07 
 
 
598 aa  56.2  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  39.24 
 
 
515 aa  56.6  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0003  flavocytochrome c flavin subunit  29.79 
 
 
508 aa  55.5  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000666036  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3826  hypothetical protein  42.31 
 
 
91 aa  55.8  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3056  tricarballylate dehydrogenase  25.28 
 
 
482 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  25 
 
 
493 aa  56.2  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000784469 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13430  flavocytochrome c  38 
 
 
616 aa  56.2  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0264  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  38.57 
 
 
174 aa  55.8  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1005  hypothetical protein  46.51 
 
 
555 aa  55.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0143655 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1064  tricarballylate dehydrogenase  21.28 
 
 
505 aa  55.5  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  34.58 
 
 
457 aa  55.1  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0136  flavocytochrome c flavin subunit  40.28 
 
 
517 aa  55.5  0.000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.584631  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2825  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  21.34 
 
 
498 aa  55.1  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>