254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2248 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3994  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  66.55 
 
 		 571 aa  677    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.542255  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0670  putative FAD-binding dehydrogenase  63.32 
 
 		 551 aa  647    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6214  putative FAD-binding dehydrogenase  70.2 
 
 		 551 aa  756    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0163  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  74.54 
 
 		 548 aa  810    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4560  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  66.37 
 
 		 557 aa  703    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.935324  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1043  putative FAD-binding dehydrogenase  63.73 
 
 		 558 aa  677    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0883  putative FAD-binding dehydrogenase  68.03 
 
 		 552 aa  723    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.237453  normal  0.672197 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3745  putative FAD-binding dehydrogenase  60.51 
 
 		 549 aa  644    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4333  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  64.63 
 
 		 597 aa  646    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10800  putative FAD-binding dehydrogenase  69.49 
 
 		 566 aa  731    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0675  putative FAD-binding dehydrogenase  66.54 
 
 		 552 aa  659    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.935742  normal  0.139475 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1896  putative FAD-binding dehydrogenase  63.5 
 
 		 557 aa  662    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5200  putative FAD-binding dehydrogenase  63.7 
 
 		 556 aa  670    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0741  putative FAD-binding dehydrogenase  65.45 
 
 		 555 aa  672    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3223  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  73.58 
 
 		 550 aa  729    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08090  predicted oxidoreductase  70.96 
 
 		 549 aa  696    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0173464  normal  0.283602 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0957  putative FAD-binding dehydrogenase  60.97 
 
 		 558 aa  644    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3775  putative FAD-binding dehydrogenase  64.13 
 
 		 553 aa  684    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1140  putative FAD-binding dehydrogenase  73.93 
 
 		 573 aa  723    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.196555  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2713  putative FAD-binding dehydrogenase  70.8 
 
 		 551 aa  714    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0401801  hitchhiker  0.00069854 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2085  putative FAD-binding dehydrogenase  65.07 
 
 		 558 aa  677    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.376668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3668  putative FAD-binding dehydrogenase  66.42 
 
 		 552 aa  718    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114123  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2248  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  100 
 
 		 555 aa  1099    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.826896  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5288  putative FAD-binding dehydrogenase  63.7 
 
 		 556 aa  670    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.918325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5132  putative FAD-binding dehydrogenase  68.92 
 
 		 555 aa  722    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5580  putative FAD-binding dehydrogenase  64.07 
 
 		 556 aa  673    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.684507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1621  putative FAD-binding dehydrogenase  69.84 
 
 		 545 aa  728    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2532  putative FAD-binding dehydrogenase  69.9 
 
 		 551 aa  712    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.608155 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1725  putative FAD-binding dehydrogenase  72.44 
 
 		 551 aa  771    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.64226  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0628  putative FAD-binding dehydrogenase  63.13 
 
 		 551 aa  644    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06450  predicted oxidoreductase  64.16 
 
 		 559 aa  670    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1100  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  62.84 
 
 		 551 aa  617  1e-175  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000939173 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0191  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  60.93 
 
 		 550 aa  586  1e-166  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1344  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  59.38 
 
 		 559 aa  580  1e-164  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.543603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2414  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  56.38 
 
 		 571 aa  547  1e-154  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0440095  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0214  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  52.11 
 
 		 558 aa  528  1e-149  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2343  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  38.53 
 
 		 552 aa  333  5e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  41.58 
 
 		 537 aa  329  9e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.223151  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0870  putative fumarate reductase flavoprotein  35.38 
 
 		 549 aa  326  8.000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3510  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  36.23 
 
 		 541 aa  311  2e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4675  putative fumarate reductase flavoprotein  37.36 
 
 		 533 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.572233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2809  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  36.67 
 
 		 537 aa  296  6e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3486  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  36.67 
 
 		 537 aa  293  5e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.664087  normal  0.809041 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1003  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.16 
 
 		 522 aa  162  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03960  FAD dependent oxidoreductase  70 
 
 		 98 aa  104  5e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.933434  normal  0.205844 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  23.44 
 
 		 597 aa  88.6  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  23.79 
 
 		 608 aa  84.7  0.000000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3301  flavocytochrome c flavin subunit  30.2 
 
 		 499 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  23.53 
 
 		 504 aa  74.7  0.000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02520  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  23.39 
 
 		 527 aa  72  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.152988  normal  0.211132 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.89 
 
 		 519 aa  70.1  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4061  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  25.28 
 
 		 476 aa  68.9  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3056  tricarballylate dehydrogenase  24.02 
 
 		 482 aa  67.8  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1444  flavocytochrome c  23.94 
 
 		 512 aa  66.2  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  23.45 
 
 		 465 aa  66.2  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0945  Succinate dehydrogenase  22.45 
 
 		 511 aa  66.2  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1029  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.11 
 
 		 509 aa  66.2  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  25.3 
 
 		 502 aa  65.1  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04200  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  34.97 
 
 		 481 aa  65.5  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.906237  normal  0.517886 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  28.95 
 
 		 519 aa  65.5  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  33.75 
 
 		 510 aa  64.7  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  26.34 
 
 		 519 aa  64.7  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  29.54 
 
 		 517 aa  63.9  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  23.64 
 
 		 584 aa  62  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0003  flavocytochrome c flavin subunit  22.52 
 
 		 508 aa  62  0.00000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000666036  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  26.02 
 
 		 519 aa  62  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0208  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.38 
 
 		 534 aa  61.2  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177  normal  0.616185 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3181  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.16 
 
 		 523 aa  60.8  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.357921  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  27.59 
 
 		 598 aa  60.5  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2826  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.74 
 
 		 543 aa  60.8  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  28.21 
 
 		 598 aa  59.7  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13450  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  23.28 
 
 		 600 aa  60.1  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  25.2 
 
 		 598 aa  58.9  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22640  aspartate oxidase  25 
 
 		 623 aa  59.3  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.73746 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  22.83 
 
 		 589 aa  58.5  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  38.75 
 
 		 515 aa  58.2  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0270  flavocytochrome c flavin subunit  26.61 
 
 		 511 aa  57.8  0.0000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2511  flavocytochrome c  27.6 
 
 		 507 aa  57.4  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.842513  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0795  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.36 
 
 		 509 aa  57.4  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.820864  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4178  flavocytochrome c flavin subunit  25.86 
 
 		 500 aa  57.4  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.630459 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51720  fumarate reductase flavoprotein  23.67 
 
 		 668 aa  56.6  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.744935  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2933  flavocytochrome c  41.56 
 
 		 521 aa  56.2  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  26.1 
 
 		 596 aa  56.6  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_10064  predicted protein  42.67 
 
 		 561 aa  56.2  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.14351 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  24.68 
 
 		 586 aa  56.2  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0340  flavocytochrome c  28.28 
 
 		 500 aa  55.8  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4550  hypothetical protein  31.55 
 
 		 482 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.288577 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2432  flavocytochrome c  26.34 
 
 		 517 aa  56.2  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77876  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  28.51 
 
 		 588 aa  55.1  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  25.27 
 
 		 609 aa  55.1  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2731  putative flavoprotein subunit of a reductase  22.45 
 
 		 507 aa  55.1  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.620849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2825  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.32 
 
 		 498 aa  55.1  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1643  FAD binding domain-containing protein  29.91 
 
 		 491 aa  54.7  0.000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  26.12 
 
 		 517 aa  54.3  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  26.34 
 
 		 517 aa  54.3  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0136  flavocytochrome c flavin subunit  41.89 
 
 		 517 aa  53.9  0.000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.584631  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3846  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  43.68 
 
 		 486 aa  53.9  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13430  flavocytochrome c  39.24 
 
 		 616 aa  53.1  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3252  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.63 
 
 		 523 aa  53.5  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.556116  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4075  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  24.39 
 
 		 484 aa  53.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>