245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1621 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0163  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  67.34 
 
 
548 aa  716    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3994  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  62.36 
 
 
571 aa  644    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.542255  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0883  putative FAD-binding dehydrogenase  66.11 
 
 
552 aa  694    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.237453  normal  0.672197 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3668  putative FAD-binding dehydrogenase  62.75 
 
 
552 aa  671    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114123  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1725  putative FAD-binding dehydrogenase  63.99 
 
 
551 aa  664    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.64226  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6214  putative FAD-binding dehydrogenase  63.44 
 
 
551 aa  661    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08090  predicted oxidoreductase  66.67 
 
 
549 aa  644    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0173464  normal  0.283602 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5200  putative FAD-binding dehydrogenase  60.94 
 
 
556 aa  645    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2248  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  69.85 
 
 
555 aa  677    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.826896  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3223  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  68.11 
 
 
550 aa  689    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2085  putative FAD-binding dehydrogenase  62.45 
 
 
558 aa  660    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.376668  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5288  putative FAD-binding dehydrogenase  60.94 
 
 
556 aa  645    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.918325  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5132  putative FAD-binding dehydrogenase  95.21 
 
 
555 aa  1007    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10800  putative FAD-binding dehydrogenase  79.74 
 
 
566 aa  850    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5580  putative FAD-binding dehydrogenase  61.3 
 
 
556 aa  647    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.684507  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1621  putative FAD-binding dehydrogenase  100 
 
 
545 aa  1090    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2532  putative FAD-binding dehydrogenase  64.82 
 
 
551 aa  655    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.608155 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4560  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  64 
 
 
557 aa  662    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.935324  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2713  putative FAD-binding dehydrogenase  65.45 
 
 
551 aa  653    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0401801  hitchhiker  0.00069854 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1140  putative FAD-binding dehydrogenase  65.7 
 
 
573 aa  634  1e-180  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.196555  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06450  predicted oxidoreductase  61.81 
 
 
559 aa  630  1e-179  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3745  putative FAD-binding dehydrogenase  59.12 
 
 
549 aa  620  1e-176  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0741  putative FAD-binding dehydrogenase  61.43 
 
 
555 aa  619  1e-176  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1043  putative FAD-binding dehydrogenase  58.59 
 
 
558 aa  618  1e-176  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3775  putative FAD-binding dehydrogenase  59.67 
 
 
553 aa  615  1e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0675  putative FAD-binding dehydrogenase  63.62 
 
 
552 aa  608  9.999999999999999e-173  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.935742  normal  0.139475 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0957  putative FAD-binding dehydrogenase  57.79 
 
 
558 aa  607  9.999999999999999e-173  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4333  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  60.19 
 
 
597 aa  605  9.999999999999999e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1896  putative FAD-binding dehydrogenase  59.38 
 
 
557 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0670  putative FAD-binding dehydrogenase  60.5 
 
 
551 aa  600  1e-170  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0628  putative FAD-binding dehydrogenase  60.5 
 
 
551 aa  600  1e-170  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0191  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  60.04 
 
 
550 aa  584  1.0000000000000001e-165  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1100  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  59.81 
 
 
551 aa  584  1.0000000000000001e-165  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000939173 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1344  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  56.44 
 
 
559 aa  550  1e-155  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.543603  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2414  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  55.24 
 
 
571 aa  536  1e-151  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0440095  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0214  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  53.12 
 
 
558 aa  532  1e-150  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2343  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  39.19 
 
 
552 aa  341  2e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4675  putative fumarate reductase flavoprotein  39.19 
 
 
533 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.572233  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3510  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  37.66 
 
 
541 aa  319  9e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  40.94 
 
 
537 aa  318  1e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.223151  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0870  putative fumarate reductase flavoprotein  37.32 
 
 
549 aa  312  9e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2809  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  37.8 
 
 
537 aa  308  2.0000000000000002e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3486  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  37.62 
 
 
537 aa  303  8.000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.664087  normal  0.809041 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1003  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.51 
 
 
522 aa  176  7e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  25.23 
 
 
608 aa  101  3e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03960  FAD dependent oxidoreductase  65.38 
 
 
98 aa  99.8  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.933434  normal  0.205844 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0945  Succinate dehydrogenase  23.75 
 
 
511 aa  87  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  23.85 
 
 
504 aa  86.7  9e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3181  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.78 
 
 
523 aa  84.3  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.357921  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2933  flavocytochrome c  25.53 
 
 
521 aa  83.2  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1029  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.95 
 
 
509 aa  82.8  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3252  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.61 
 
 
523 aa  82.8  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.556116  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_10064  predicted protein  24.06 
 
 
561 aa  82.4  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.14351 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  23.22 
 
 
597 aa  80.5  0.00000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4061  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  27.17 
 
 
476 aa  79.7  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0795  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.78 
 
 
509 aa  80.1  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.820864  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  24.95 
 
 
589 aa  79  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0003  flavocytochrome c flavin subunit  25.36 
 
 
508 aa  77.8  0.0000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000666036  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01543  hypothetical fumarate reductase (Eurofung)  25.72 
 
 
627 aa  74.7  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000554356  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13430  flavocytochrome c  25.68 
 
 
616 aa  70.5  0.00000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  24.3 
 
 
637 aa  70.1  0.00000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  23.85 
 
 
588 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  23.15 
 
 
591 aa  67  0.0000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3301  flavocytochrome c flavin subunit  28.33 
 
 
499 aa  66.2  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02520  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  22.94 
 
 
527 aa  65.5  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.152988  normal  0.211132 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.61 
 
 
519 aa  65.1  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  26.35 
 
 
586 aa  65.5  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22640  aspartate oxidase  25.55 
 
 
623 aa  64.7  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.73746 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1444  flavocytochrome c  28.63 
 
 
512 aa  64.3  0.000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  25.63 
 
 
586 aa  63.5  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  24.45 
 
 
609 aa  62.8  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0488  flavocytochrome c  23.9 
 
 
606 aa  61.2  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.203471 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1037  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  25.7 
 
 
463 aa  61.2  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.192722  normal  0.0849595 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0270  flavocytochrome c flavin subunit  27.41 
 
 
511 aa  60.5  0.00000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03720  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  22.22 
 
 
558 aa  58.9  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  25.56 
 
 
519 aa  59.3  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21320  fumarate reductase/succinate dehyfrogenase, flavoprotein subunit  26.19 
 
 
514 aa  58.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.22533  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  29.84 
 
 
598 aa  58.5  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00140  fumarate reductase (NADH), putative  24.42 
 
 
635 aa  58.2  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0434389  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2533  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.73 
 
 
555 aa  57.4  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1005  hypothetical protein  49.43 
 
 
555 aa  56.6  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0143655 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  22.77 
 
 
589 aa  56.2  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04200  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  24.32 
 
 
481 aa  56.6  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.906237  normal  0.517886 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4075  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  25.05 
 
 
484 aa  56.6  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53948  Osmotic growth protein  24.25 
 
 
659 aa  56.6  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.621591 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1643  FAD binding domain-containing protein  28.28 
 
 
491 aa  55.5  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1658  FMN-binding domain protein  22.16 
 
 
715 aa  55.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1064  tricarballylate dehydrogenase  27.87 
 
 
505 aa  55.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3056  tricarballylate dehydrogenase  24.02 
 
 
482 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03140  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  22.86 
 
 
594 aa  56.2  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  30.3 
 
 
517 aa  55.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4550  hypothetical protein  26.76 
 
 
482 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.288577 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27122  predicted protein  24.85 
 
 
587 aa  55.8  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0188056 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52061  predicted protein  24.85 
 
 
587 aa  55.8  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2826  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.64 
 
 
543 aa  55.1  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01540  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  22.34 
 
 
501 aa  55.1  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0190007 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  21.72 
 
 
502 aa  55.1  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4077  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  25.23 
 
 
491 aa  55.1  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51720  fumarate reductase flavoprotein  22.46 
 
 
668 aa  55.1  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.744935  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0139  radical SAM domain-containing protein  26.07 
 
 
511 aa  54.3  0.000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>