231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1100 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0741  putative FAD-binding dehydrogenase  65.57 
 
 
555 aa  642    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2414  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  69.65 
 
 
571 aa  674    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0440095  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1100  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  100 
 
 
551 aa  1070    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000939173 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1344  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  74.46 
 
 
559 aa  732    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.543603  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6214  putative FAD-binding dehydrogenase  66.61 
 
 
551 aa  691    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0163  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  60.26 
 
 
548 aa  620  1e-176  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3668  putative FAD-binding dehydrogenase  58.5 
 
 
552 aa  610  1e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114123  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3223  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  63.09 
 
 
550 aa  608  1e-173  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1621  putative FAD-binding dehydrogenase  59.81 
 
 
545 aa  599  1e-170  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2248  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  63.13 
 
 
555 aa  594  1e-168  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.826896  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06450  predicted oxidoreductase  62.59 
 
 
559 aa  592  1e-168  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0883  putative FAD-binding dehydrogenase  58.67 
 
 
552 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.237453  normal  0.672197 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5132  putative FAD-binding dehydrogenase  59.23 
 
 
555 aa  590  1e-167  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10800  putative FAD-binding dehydrogenase  59.02 
 
 
566 aa  589  1e-167  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08090  predicted oxidoreductase  63.16 
 
 
549 aa  587  1e-166  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0173464  normal  0.283602 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1725  putative FAD-binding dehydrogenase  57.91 
 
 
551 aa  583  1.0000000000000001e-165  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.64226  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4560  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  56.93 
 
 
557 aa  579  1e-164  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.935324  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2713  putative FAD-binding dehydrogenase  59.58 
 
 
551 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0401801  hitchhiker  0.00069854 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0191  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  60.89 
 
 
550 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1140  putative FAD-binding dehydrogenase  61.75 
 
 
573 aa  565  1e-160  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.196555  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2532  putative FAD-binding dehydrogenase  59.39 
 
 
551 aa  566  1e-160  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.608155 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4333  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  56.67 
 
 
597 aa  559  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3775  putative FAD-binding dehydrogenase  55.66 
 
 
553 aa  558  1e-158  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3994  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  56.17 
 
 
571 aa  553  1e-156  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.542255  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3745  putative FAD-binding dehydrogenase  54.86 
 
 
549 aa  550  1e-155  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2085  putative FAD-binding dehydrogenase  55.8 
 
 
558 aa  550  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.376668  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1043  putative FAD-binding dehydrogenase  55.5 
 
 
558 aa  551  1e-155  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0670  putative FAD-binding dehydrogenase  55.98 
 
 
551 aa  547  1e-154  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1896  putative FAD-binding dehydrogenase  55.74 
 
 
557 aa  545  1e-154  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0628  putative FAD-binding dehydrogenase  56.18 
 
 
551 aa  547  1e-154  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0957  putative FAD-binding dehydrogenase  54.41 
 
 
558 aa  544  1e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0675  putative FAD-binding dehydrogenase  58.24 
 
 
552 aa  540  9.999999999999999e-153  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.935742  normal  0.139475 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5200  putative FAD-binding dehydrogenase  55.35 
 
 
556 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5288  putative FAD-binding dehydrogenase  55.35 
 
 
556 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.918325  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5580  putative FAD-binding dehydrogenase  55.35 
 
 
556 aa  538  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.684507  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0214  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  50.73 
 
 
558 aa  476  1e-133  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2343  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  39.16 
 
 
552 aa  325  1e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3510  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  39.05 
 
 
541 aa  318  1e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  42.65 
 
 
537 aa  311  2e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.223151  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0870  putative fumarate reductase flavoprotein  36.55 
 
 
549 aa  309  6.999999999999999e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2809  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  39.27 
 
 
537 aa  306  5.0000000000000004e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4675  putative fumarate reductase flavoprotein  39.31 
 
 
533 aa  306  7e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.572233  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3486  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  39.24 
 
 
537 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.664087  normal  0.809041 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1003  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.62 
 
 
522 aa  165  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03960  FAD dependent oxidoreductase  73.81 
 
 
98 aa  112  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.933434  normal  0.205844 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  24.04 
 
 
597 aa  96.7  9e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  24.54 
 
 
589 aa  92.4  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1029  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.55 
 
 
509 aa  80.9  0.00000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  24.86 
 
 
598 aa  78.2  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  23.2 
 
 
457 aa  77.8  0.0000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0795  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.79 
 
 
509 aa  77.8  0.0000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.820864  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4061  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  27.19 
 
 
476 aa  77.4  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  22.5 
 
 
502 aa  76.3  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  25.23 
 
 
598 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  23.81 
 
 
588 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  23.85 
 
 
589 aa  75.5  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0945  Succinate dehydrogenase  23.91 
 
 
511 aa  74.7  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02520  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  24.39 
 
 
527 aa  74.7  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.152988  normal  0.211132 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  23.38 
 
 
504 aa  74.3  0.000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  23.83 
 
 
637 aa  74.3  0.000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_10064  predicted protein  24.77 
 
 
561 aa  74.3  0.000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.14351 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  25.8 
 
 
517 aa  73.9  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0270  flavocytochrome c flavin subunit  22.14 
 
 
511 aa  73.6  0.00000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1444  flavocytochrome c  24.87 
 
 
512 aa  72.8  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  21.97 
 
 
596 aa  72  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0124  Succinate dehydrogenase  23.91 
 
 
497 aa  70.9  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  23.26 
 
 
596 aa  70.5  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  25.36 
 
 
582 aa  70.1  0.00000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.74 
 
 
519 aa  69.7  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  25.37 
 
 
519 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  23.44 
 
 
596 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  22.86 
 
 
599 aa  69.3  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  22.22 
 
 
596 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4620  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  24.01 
 
 
582 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  25.98 
 
 
517 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  23.26 
 
 
596 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0086  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.5 
 
 
515 aa  68.6  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  22.22 
 
 
596 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  24.37 
 
 
582 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  23.08 
 
 
596 aa  67.4  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  23.08 
 
 
596 aa  67.4  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  23.08 
 
 
596 aa  67.4  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27122  predicted protein  23.88 
 
 
587 aa  67.4  0.0000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0188056 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52061  predicted protein  23.88 
 
 
587 aa  67.4  0.0000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  23.08 
 
 
596 aa  67.4  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  23.08 
 
 
596 aa  67  0.0000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  22.03 
 
 
583 aa  66.6  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  23.16 
 
 
597 aa  66.6  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  23.57 
 
 
593 aa  65.9  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  25.31 
 
 
519 aa  65.1  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  21.65 
 
 
596 aa  65.1  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13430  flavocytochrome c  23.66 
 
 
616 aa  64.3  0.000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4193  flavocytochrome c  23.6 
 
 
582 aa  63.5  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4325  flavocytochrome c  23.6 
 
 
582 aa  63.5  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  21.88 
 
 
591 aa  60.8  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2780  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  27.76 
 
 
564 aa  60.8  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.386374  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  23.33 
 
 
925 aa  60.1  0.00000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4178  flavocytochrome c flavin subunit  24.79 
 
 
500 aa  60.1  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.630459 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51720  fumarate reductase flavoprotein  22.8 
 
 
668 aa  59.7  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.744935  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2933  flavocytochrome c  44.59 
 
 
521 aa  60.1  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>