166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1043 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2085  putative FAD-binding dehydrogenase  70.62 
 
 
558 aa  748    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.376668  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1043  putative FAD-binding dehydrogenase  100 
 
 
558 aa  1112    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0883  putative FAD-binding dehydrogenase  63.92 
 
 
552 aa  679    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.237453  normal  0.672197 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5200  putative FAD-binding dehydrogenase  72.07 
 
 
556 aa  782    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0957  putative FAD-binding dehydrogenase  85.3 
 
 
558 aa  941    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1140  putative FAD-binding dehydrogenase  64.69 
 
 
573 aa  639    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.196555  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4560  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  61.94 
 
 
557 aa  662    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.935324  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5288  putative FAD-binding dehydrogenase  72.07 
 
 
556 aa  782    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.918325  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0163  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  61.29 
 
 
548 aa  668    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5580  putative FAD-binding dehydrogenase  71.71 
 
 
556 aa  777    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.684507  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3668  putative FAD-binding dehydrogenase  62.09 
 
 
552 aa  671    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114123  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6214  putative FAD-binding dehydrogenase  60.32 
 
 
551 aa  644    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2532  putative FAD-binding dehydrogenase  63.65 
 
 
551 aa  646    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.608155 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3994  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  61.01 
 
 
571 aa  639    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.542255  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2248  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  64.22 
 
 
555 aa  635    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.826896  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2713  putative FAD-binding dehydrogenase  63.57 
 
 
551 aa  654    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0401801  hitchhiker  0.00069854 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1725  putative FAD-binding dehydrogenase  61.31 
 
 
551 aa  647    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.64226  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1896  putative FAD-binding dehydrogenase  60.83 
 
 
557 aa  629  1e-179  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06450  predicted oxidoreductase  60.54 
 
 
559 aa  629  1e-179  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3745  putative FAD-binding dehydrogenase  58.89 
 
 
549 aa  626  1e-178  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3775  putative FAD-binding dehydrogenase  60.26 
 
 
553 aa  625  1e-178  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10800  putative FAD-binding dehydrogenase  58.7 
 
 
566 aa  623  1e-177  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1621  putative FAD-binding dehydrogenase  58.59 
 
 
545 aa  619  1e-176  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4333  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  60.96 
 
 
597 aa  619  1e-176  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08090  predicted oxidoreductase  62.45 
 
 
549 aa  616  1e-175  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0173464  normal  0.283602 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0741  putative FAD-binding dehydrogenase  59.96 
 
 
555 aa  607  9.999999999999999e-173  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5132  putative FAD-binding dehydrogenase  56.65 
 
 
555 aa  606  9.999999999999999e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3223  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  60.19 
 
 
550 aa  601  1e-170  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0670  putative FAD-binding dehydrogenase  60.55 
 
 
551 aa  597  1e-169  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0628  putative FAD-binding dehydrogenase  60.55 
 
 
551 aa  593  1e-168  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0675  putative FAD-binding dehydrogenase  58.96 
 
 
552 aa  587  1e-166  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.935742  normal  0.139475 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0191  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  55.75 
 
 
550 aa  543  1e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1100  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  55.5 
 
 
551 aa  536  1e-151  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000939173 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1344  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  53.61 
 
 
559 aa  515  1.0000000000000001e-145  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.543603  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0214  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  49.19 
 
 
558 aa  492  9.999999999999999e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2414  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  52.17 
 
 
571 aa  494  9.999999999999999e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0440095  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2343  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  36.96 
 
 
552 aa  322  9.000000000000001e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  39.89 
 
 
537 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.223151  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4675  putative fumarate reductase flavoprotein  35.96 
 
 
533 aa  294  3e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.572233  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0870  putative fumarate reductase flavoprotein  35.54 
 
 
549 aa  292  1e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2809  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  36.31 
 
 
537 aa  287  4e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3510  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  34.58 
 
 
541 aa  278  2e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3486  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  35.77 
 
 
537 aa  278  2e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.664087  normal  0.809041 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1003  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.97 
 
 
522 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03960  FAD dependent oxidoreductase  63.16 
 
 
98 aa  98.2  3e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.933434  normal  0.205844 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1029  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.02 
 
 
509 aa  78.6  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0795  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.71 
 
 
509 aa  78.2  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.820864  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  21.96 
 
 
597 aa  78.6  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  21.59 
 
 
608 aa  77  0.0000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3301  flavocytochrome c flavin subunit  29.58 
 
 
499 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  22.73 
 
 
502 aa  74.7  0.000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_10064  predicted protein  24.52 
 
 
561 aa  73.6  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.14351 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22640  aspartate oxidase  28.4 
 
 
623 aa  70.9  0.00000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.73746 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27122  predicted protein  23.79 
 
 
587 aa  68.9  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0188056 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52061  predicted protein  23.79 
 
 
587 aa  68.9  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4178  flavocytochrome c flavin subunit  24.96 
 
 
500 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.630459 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51720  fumarate reductase flavoprotein  23.82 
 
 
668 aa  68.6  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.744935  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3181  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.73 
 
 
523 aa  67  0.0000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.357921  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2930  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.33 
 
 
512 aa  66.6  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  21.94 
 
 
465 aa  66.6  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0945  Succinate dehydrogenase  23.08 
 
 
511 aa  65.5  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04200  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  27.78 
 
 
481 aa  64.7  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.906237  normal  0.517886 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3252  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.91 
 
 
523 aa  62.8  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.556116  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  22.4 
 
 
504 aa  63.2  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01543  hypothetical fumarate reductase (Eurofung)  23.51 
 
 
627 aa  62  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000554356  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3897  flavocytochrome c  24.16 
 
 
506 aa  60.8  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.513243  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  22.72 
 
 
464 aa  58.2  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3056  tricarballylate dehydrogenase  24.16 
 
 
482 aa  58.2  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4061  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  24.6 
 
 
476 aa  57.4  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02520  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  26.18 
 
 
527 aa  56.2  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.152988  normal  0.211132 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  29.88 
 
 
510 aa  55.8  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2825  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  21.38 
 
 
498 aa  56.2  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0275  flavocytochrome c  29.85 
 
 
506 aa  55.8  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000326146 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0208  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  21.33 
 
 
534 aa  55.5  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177  normal  0.616185 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  21.01 
 
 
457 aa  54.7  0.000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  25.41 
 
 
519 aa  54.7  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  29.54 
 
 
517 aa  54.7  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26410  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  21.07 
 
 
546 aa  54.3  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.991458  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00140  fumarate reductase (NADH), putative  21.98 
 
 
635 aa  53.1  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0434389  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2826  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.99 
 
 
543 aa  53.1  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3939  flavocytochrome c  29.35 
 
 
506 aa  52.8  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  27.9 
 
 
591 aa  53.5  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1851  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  25.13 
 
 
532 aa  52.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4658  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.16 
 
 
492 aa  52.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0273  flavocytochrome c  30.77 
 
 
506 aa  52.8  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000188956 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2153  flavocytochrome c  29.17 
 
 
506 aa  52  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0615938 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1580  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  24.52 
 
 
550 aa  51.2  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  38.67 
 
 
515 aa  51.2  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1803  FAD binding domain-containing protein  25.82 
 
 
521 aa  50.8  0.00006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000300511  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  31.25 
 
 
589 aa  50.4  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  25.44 
 
 
519 aa  50.8  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0256  flavocytochrome c  27.91 
 
 
506 aa  50.4  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2230  flavocytochrome c  27.91 
 
 
506 aa  50.4  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2046  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  37.89 
 
 
571 aa  50.4  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.302213  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2731  putative flavoprotein subunit of a reductase  23.1 
 
 
507 aa  50.4  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.620849  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1444  flavocytochrome c  41.67 
 
 
512 aa  50.4  0.00009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1545  putative flavocytochrome c flavin subunit  24.23 
 
 
447 aa  50.4  0.00009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  37.84 
 
 
637 aa  49.7  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3624  flavocytochrome c flavin subunit  37.97 
 
 
494 aa  49.3  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  21.9 
 
 
589 aa  49.7  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>