192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6214 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0883  putative FAD-binding dehydrogenase  62.92 
 
 		 552 aa  677    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.237453  normal  0.672197 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1725  putative FAD-binding dehydrogenase  63.77 
 
 		 551 aa  695    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.64226  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1043  putative FAD-binding dehydrogenase  60.32 
 
 		 558 aa  643    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3223  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  68.87 
 
 		 550 aa  695    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0741  putative FAD-binding dehydrogenase  70.05 
 
 		 555 aa  741    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08090  predicted oxidoreductase  66.02 
 
 		 549 aa  659    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0173464  normal  0.283602 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0957  putative FAD-binding dehydrogenase  60.14 
 
 		 558 aa  638    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1140  putative FAD-binding dehydrogenase  65.37 
 
 		 573 aa  644    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.196555  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2248  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  69.66 
 
 		 555 aa  702    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.826896  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1344  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  64.25 
 
 		 559 aa  646    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.543603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5132  putative FAD-binding dehydrogenase  62.89 
 
 		 555 aa  659    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0163  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  68.19 
 
 		 548 aa  727    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1100  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  66.61 
 
 		 551 aa  676    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000939173 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1621  putative FAD-binding dehydrogenase  63.44 
 
 		 545 aa  661    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3668  putative FAD-binding dehydrogenase  60.95 
 
 		 552 aa  656    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114123  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2532  putative FAD-binding dehydrogenase  62.69 
 
 		 551 aa  653    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.608155 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0191  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  65.11 
 
 		 550 aa  637    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6214  putative FAD-binding dehydrogenase  100 
 
 		 551 aa  1094    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10800  putative FAD-binding dehydrogenase  62.52 
 
 		 566 aa  655    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2713  putative FAD-binding dehydrogenase  63.75 
 
 		 551 aa  657    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0401801  hitchhiker  0.00069854 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2414  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  62.68 
 
 		 571 aa  630  1e-179  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0440095  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0675  putative FAD-binding dehydrogenase  63.5 
 
 		 552 aa  627  1e-178  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.935742  normal  0.139475 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4560  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  59.31 
 
 		 557 aa  627  1e-178  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.935324  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06450  predicted oxidoreductase  62.36 
 
 		 559 aa  622  1e-177  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2085  putative FAD-binding dehydrogenase  59.27 
 
 		 558 aa  620  1e-176  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.376668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5200  putative FAD-binding dehydrogenase  58.33 
 
 		 556 aa  613  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4333  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  60.19 
 
 		 597 aa  612  9.999999999999999e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5288  putative FAD-binding dehydrogenase  58.33 
 
 		 556 aa  613  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.918325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3775  putative FAD-binding dehydrogenase  59.59 
 
 		 553 aa  613  9.999999999999999e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0670  putative FAD-binding dehydrogenase  61.01 
 
 		 551 aa  608  9.999999999999999e-173  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5580  putative FAD-binding dehydrogenase  58.15 
 
 		 556 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.684507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0628  putative FAD-binding dehydrogenase  60.82 
 
 		 551 aa  604  1.0000000000000001e-171  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3994  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  58.88 
 
 		 571 aa  593  1e-168  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.542255  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1896  putative FAD-binding dehydrogenase  58.35 
 
 		 557 aa  591  1e-167  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3745  putative FAD-binding dehydrogenase  55.05 
 
 		 549 aa  574  1.0000000000000001e-162  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0214  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  51.38 
 
 		 558 aa  516  1.0000000000000001e-145  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2343  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  39.42 
 
 		 552 aa  344  2e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3510  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  39.82 
 
 		 541 aa  330  6e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0870  putative fumarate reductase flavoprotein  36.13 
 
 		 549 aa  324  2e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  40.33 
 
 		 537 aa  319  7e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.223151  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4675  putative fumarate reductase flavoprotein  38.24 
 
 		 533 aa  317  3e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.572233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2809  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  38.29 
 
 		 537 aa  307  3e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3486  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  38.1 
 
 		 537 aa  304  3.0000000000000004e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.664087  normal  0.809041 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1003  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.02 
 
 		 522 aa  154  4e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03960  FAD dependent oxidoreductase  71.05 
 
 		 98 aa  102  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.933434  normal  0.205844 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  24.45 
 
 		 589 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01543  hypothetical fumarate reductase (Eurofung)  25.05 
 
 		 627 aa  70.9  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000554356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3056  tricarballylate dehydrogenase  25.74 
 
 		 482 aa  70.9  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  24.35 
 
 		 588 aa  70.1  0.00000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3301  flavocytochrome c flavin subunit  30.29 
 
 		 499 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  24.5 
 
 		 593 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1029  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.1 
 
 		 509 aa  63.5  0.000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0795  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.2 
 
 		 509 aa  61.6  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.820864  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  23.63 
 
 		 596 aa  60.8  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  23.81 
 
 		 596 aa  60.1  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53948  Osmotic growth protein  23.23 
 
 		 659 aa  59.7  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.621591 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  24.1 
 
 		 637 aa  59.7  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  30.04 
 
 		 598 aa  59.7  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  23.81 
 
 		 596 aa  59.3  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2894  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.96 
 
 		 529 aa  58.9  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0165292  hitchhiker  0.000448653 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  23.87 
 
 		 586 aa  59.3  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  34.21 
 
 		 515 aa  58.5  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27122  predicted protein  23.57 
 
 		 587 aa  58.5  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0188056 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52061  predicted protein  23.57 
 
 		 587 aa  58.5  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2933  flavocytochrome c  37.62 
 
 		 521 aa  57.8  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  33.33 
 
 		 517 aa  57.4  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  22.75 
 
 		 596 aa  57.4  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  29.31 
 
 		 519 aa  56.6  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0945  Succinate dehydrogenase  22.3 
 
 		 511 aa  56.6  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  30.13 
 
 		 519 aa  56.2  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  23.26 
 
 		 596 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  21.83 
 
 		 504 aa  56.2  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  23.26 
 
 		 596 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  23.26 
 
 		 596 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  29.61 
 
 		 598 aa  55.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  23.26 
 
 		 596 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02520  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  23.21 
 
 		 527 aa  56.2  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.152988  normal  0.211132 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0340  flavocytochrome c  27.92 
 
 		 500 aa  55.5  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22640  aspartate oxidase  27.04 
 
 		 623 aa  54.7  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.73746 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1543  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein, N-terminal:FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 584 aa  54.7  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.603101  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  23.96 
 
 		 583 aa  54.3  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0671  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.49 
 
 		 581 aa  53.9  0.000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.745903 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04200  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  28.49 
 
 		 481 aa  53.5  0.000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.906237  normal  0.517886 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2358  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.49 
 
 		 581 aa  53.5  0.000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.479481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  22.19 
 
 		 502 aa  53.1  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  29.49 
 
 		 519 aa  53.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3686  hypothetical protein  38.53 
 
 		 484 aa  53.1  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  30.97 
 
 		 517 aa  52.4  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  32.28 
 
 		 510 aa  52.4  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1444  flavocytochrome c  30.52 
 
 		 512 aa  52.8  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  23.08 
 
 		 597 aa  52.4  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0302  hypothetical protein  26.48 
 
 		 534 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.947471  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  22.82 
 
 		 598 aa  52  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0312  hypothetical protein  26.48 
 
 		 534 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.337711 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  32.94 
 
 		 599 aa  51.6  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  27.39 
 
 		 596 aa  52  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0270  flavocytochrome c flavin subunit  30.53 
 
 		 511 aa  51.6  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1803  FAD binding domain-containing protein  22.4 
 
 		 521 aa  52  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000300511  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2127  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  47.69 
 
 		 582 aa  51.2  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0086  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.49 
 
 		 515 aa  51.6  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>