More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2586 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  100 
 
 		 588 aa  1218    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  72.87 
 
 		 589 aa  900    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  48.9 
 
 		 597 aa  555  1e-157  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  48.99 
 
 		 596 aa  558  1e-157  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  48.99 
 
 		 596 aa  558  1e-157  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  49.16 
 
 		 596 aa  556  1e-157  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  48.48 
 
 		 596 aa  550  1e-155  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  48.31 
 
 		 596 aa  549  1e-155  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  48.31 
 
 		 596 aa  549  1e-155  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  48.31 
 
 		 596 aa  549  1e-155  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  48.31 
 
 		 596 aa  549  1e-155  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  47.7 
 
 		 598 aa  534  1e-150  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  46.29 
 
 		 596 aa  530  1e-149  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  47.37 
 
 		 593 aa  531  1e-149  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  48.05 
 
 		 598 aa  528  1e-149  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  48.83 
 
 		 589 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  45.93 
 
 		 591 aa  512  1e-144  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  44.33 
 
 		 589 aa  501  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  43.72 
 
 		 596 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  43.43 
 
 		 596 aa  486  1e-136  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  44.44 
 
 		 596 aa  483  1e-135  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  43.2 
 
 		 596 aa  483  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  43.28 
 
 		 583 aa  476  1e-133  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  46.98 
 
 		 598 aa  396  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  43.43 
 
 		 597 aa  367  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  41.7 
 
 		 502 aa  349  8e-95  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  41.08 
 
 		 925 aa  337  5e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  38.74 
 
 		 457 aa  332  1e-89  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  41.08 
 
 		 504 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  40.96 
 
 		 608 aa  327  5e-88  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3495  flavocytochrome c  40.22 
 
 		 925 aa  325  1e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  40.32 
 
 		 599 aa  322  1.9999999999999998e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2558  flavocytochrome c  37.86 
 
 		 926 aa  321  3e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2625  flavocytochrome c  39.81 
 
 		 957 aa  320  6e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809387  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  39.41 
 
 		 464 aa  311  2e-83  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  39.49 
 
 		 609 aa  303  5.000000000000001e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  36.85 
 
 		 465 aa  302  1e-80  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  37.55 
 
 		 582 aa  279  9e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  37.5 
 
 		 586 aa  278  2e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4620  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  37.12 
 
 		 582 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  39.68 
 
 		 591 aa  273  6e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  36.32 
 
 		 584 aa  271  2e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  36.48 
 
 		 586 aa  270  4e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  36.91 
 
 		 582 aa  269  1e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4193  flavocytochrome c  37.34 
 
 		 582 aa  268  2e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4325  flavocytochrome c  37.34 
 
 		 582 aa  268  2e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  34.69 
 
 		 517 aa  248  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13640  flavocytochrome c  35.94 
 
 		 650 aa  246  9.999999999999999e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  33.99 
 
 		 637 aa  242  1e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  35.26 
 
 		 519 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0107  flavocytochrome c  37.56 
 
 		 605 aa  237  4e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  34.47 
 
 		 519 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  34.52 
 
 		 510 aa  233  5e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  33.55 
 
 		 515 aa  233  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13430  flavocytochrome c  33.49 
 
 		 616 aa  231  2e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01543  hypothetical fumarate reductase (Eurofung)  33.55 
 
 		 627 aa  228  2e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000554356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10160  flavocytochrome c  36.32 
 
 		 603 aa  228  2e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  0.0211586 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2653  flavocytochrome c  34.57 
 
 		 631 aa  228  2e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.123058 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51720  fumarate reductase flavoprotein  34.3 
 
 		 668 aa  226  8e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.744935  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  34.05 
 
 		 517 aa  224  4.9999999999999996e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27122  predicted protein  33.68 
 
 		 587 aa  223  6e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0188056 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52061  predicted protein  33.68 
 
 		 587 aa  223  6e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  33.55 
 
 		 519 aa  223  6e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  34.05 
 
 		 517 aa  223  6e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2432  flavocytochrome c  34.31 
 
 		 517 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77876  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3960  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  34.03 
 
 		 577 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000052594  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00140  fumarate reductase (NADH), putative  32.97 
 
 		 635 aa  219  7.999999999999999e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0434389  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0136  flavocytochrome c flavin subunit  33.01 
 
 		 517 aa  218  2e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.584631  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0488  flavocytochrome c  34.62 
 
 		 606 aa  217  5e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.203471 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0913  flavocytochrome c  33.84 
 
 		 483 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.387235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0270  flavocytochrome c flavin subunit  32.99 
 
 		 511 aa  213  9e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1861  flavocytochrome c  33.33 
 
 		 515 aa  211  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2096  flavocytochrome c  32.93 
 
 		 515 aa  210  5e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148795  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10296  FAD dependent oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05070)  34.18 
 
 		 484 aa  209  8e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1782  flavocytochrome c  33.13 
 
 		 515 aa  209  1e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_10064  predicted protein  32.22 
 
 		 561 aa  208  2e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.14351 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2933  flavocytochrome c  31.12 
 
 		 521 aa  205  2e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1444  flavocytochrome c  31.49 
 
 		 512 aa  201  3.9999999999999996e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  32.82 
 
 		 470 aa  200  7e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0002  flavocytochrome c flavin subunit  32.16 
 
 		 518 aa  199  1.0000000000000001e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000401985  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3768  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  32.89 
 
 		 460 aa  199  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0086  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  34.1 
 
 		 515 aa  198  3e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2381  NADH:flavin oxidoreductase/fumarate reductase, flavoprotein subunit, putative  30.62 
 
 		 1005 aa  197  4.0000000000000005e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0139  radical SAM domain-containing protein  31.73 
 
 		 511 aa  197  6e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45689  fumarate reductase flavoprotein subunit  31.6 
 
 		 478 aa  196  9e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0049  fumarate reductase flavoprotein subunit  33.42 
 
 		 616 aa  196  1e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00375543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2089  flavocytochrome c  31.67 
 
 		 519 aa  194  5e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.455233  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05539  oxidoreductase  32.61 
 
 		 1004 aa  191  2.9999999999999997e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3301  flavocytochrome c flavin subunit  29.29 
 
 		 499 aa  189  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53948  Osmotic growth protein  31.28 
 
 		 659 aa  189  1e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.621591 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0340  flavocytochrome c  28.51 
 
 		 500 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2401  flavocytochrome c flavin subunit  32.29 
 
 		 505 aa  183  9.000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1803  FAD binding domain-containing protein  30.06 
 
 		 521 aa  181  2.9999999999999997e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000300511  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3897  flavocytochrome c  30.6 
 
 		 506 aa  180  7e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.513243  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2084  flavocytochrome c  30.95 
 
 		 520 aa  179  1e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1037  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  34.26 
 
 		 463 aa  178  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.192722  normal  0.0849595 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0256  flavocytochrome c  30.11 
 
 		 506 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0273  flavocytochrome c  30.13 
 
 		 506 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188956 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3536  flavocytochrome c  30.54 
 
 		 506 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0275  flavocytochrome c  29.85 
 
 		 506 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000326146 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>