54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_03960 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_03960  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 98 aa  192  2e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.933434  normal  0.205844 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1100  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  73.81 
 
 		 551 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000939173 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2414  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  69.14 
 
 		 571 aa  110  9e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0440095  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1344  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  69.14 
 
 		 559 aa  107  8.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.543603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5580  putative FAD-binding dehydrogenase  67.11 
 
 		 556 aa  107  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.684507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5200  putative FAD-binding dehydrogenase  67.11 
 
 		 556 aa  106  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5288  putative FAD-binding dehydrogenase  67.11 
 
 		 556 aa  106  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.918325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06450  predicted oxidoreductase  73.97 
 
 		 559 aa  105  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2085  putative FAD-binding dehydrogenase  68.06 
 
 		 558 aa  103  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.376668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0883  putative FAD-binding dehydrogenase  66.67 
 
 		 552 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.237453  normal  0.672197 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6214  putative FAD-binding dehydrogenase  71.05 
 
 		 551 aa  102  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0163  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  69.74 
 
 		 548 aa  101  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5132  putative FAD-binding dehydrogenase  60.92 
 
 		 555 aa  100  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1621  putative FAD-binding dehydrogenase  65.38 
 
 		 545 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  66.23 
 
 		 537 aa  99.8  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.223151  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0957  putative FAD-binding dehydrogenase  63.16 
 
 		 558 aa  99.4  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3994  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  62.65 
 
 		 571 aa  98.2  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.542255  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1043  putative FAD-binding dehydrogenase  63.16 
 
 		 558 aa  98.2  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0741  putative FAD-binding dehydrogenase  64.1 
 
 		 555 aa  96.3  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4560  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  62.03 
 
 		 557 aa  95.5  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.935324  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0214  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  67.11 
 
 		 558 aa  95.5  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3745  putative FAD-binding dehydrogenase  62.67 
 
 		 549 aa  95.9  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3775  putative FAD-binding dehydrogenase  60.81 
 
 		 553 aa  94.7  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0675  putative FAD-binding dehydrogenase  72.29 
 
 		 552 aa  94.4  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.935742  normal  0.139475 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10800  putative FAD-binding dehydrogenase  63.29 
 
 		 566 aa  93.6  8e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3668  putative FAD-binding dehydrogenase  62.34 
 
 		 552 aa  92.4  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114123  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3223  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  77.05 
 
 		 550 aa  91.3  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3510  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  57.33 
 
 		 541 aa  90.1  9e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4333  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  62.82 
 
 		 597 aa  89.7  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2248  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  70 
 
 		 555 aa  87.8  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.826896  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1896  putative FAD-binding dehydrogenase  57.69 
 
 		 557 aa  87.4  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2343  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  54.67 
 
 		 552 aa  86.7  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1725  putative FAD-binding dehydrogenase  69.74 
 
 		 551 aa  85.9  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.64226  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08090  predicted oxidoreductase  70.91 
 
 		 549 aa  84.7  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0173464  normal  0.283602 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0191  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  67.27 
 
 		 550 aa  79.3  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2713  putative FAD-binding dehydrogenase  74 
 
 		 551 aa  76.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0401801  hitchhiker  0.00069854 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2532  putative FAD-binding dehydrogenase  74 
 
 		 551 aa  76.6  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.608155 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0670  putative FAD-binding dehydrogenase  63.64 
 
 		 551 aa  75.1  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0628  putative FAD-binding dehydrogenase  63.64 
 
 		 551 aa  75.1  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2809  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  48.68 
 
 		 537 aa  74.3  0.0000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1140  putative FAD-binding dehydrogenase  70 
 
 		 573 aa  72.4  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.196555  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4675  putative fumarate reductase flavoprotein  47.44 
 
 		 533 aa  72  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.572233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3486  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  47.37 
 
 		 537 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.664087  normal  0.809041 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0870  putative fumarate reductase flavoprotein  42.86 
 
 		 549 aa  67  0.00000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  34.78 
 
 		 515 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2579  FAD dependent oxidoreductase  67.5 
 
 		 431 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.612583  normal  0.495768 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0264  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  26.67 
 
 		 174 aa  44.7  0.0004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1003  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  36.36 
 
 		 522 aa  44.3  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2933  flavocytochrome c  38.24 
 
 		 521 aa  42  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  33.33 
 
 		 517 aa  41.6  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04200  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  32.39 
 
 		 481 aa  41.6  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.906237  normal  0.517886 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0085  L-amino-acid oxidase  46.75 
 
 		 536 aa  40.8  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4903  FAD dependent oxidoreductase  53.19 
 
 		 429 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.667356 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3463  FAD dependent oxidoreductase  53.19 
 
 		 429 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>