234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2343 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2809  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  76.7 
 
 
537 aa  794    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3510  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  69.27 
 
 
541 aa  749    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2343  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  100 
 
 
552 aa  1142    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3486  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  76.52 
 
 
537 aa  790    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.664087  normal  0.809041 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4675  putative fumarate reductase flavoprotein  74.67 
 
 
533 aa  801    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.572233  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0870  putative fumarate reductase flavoprotein  53.96 
 
 
549 aa  533  1e-150  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  46.44 
 
 
537 aa  412  1e-114  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.223151  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5132  putative FAD-binding dehydrogenase  40 
 
 
555 aa  345  1e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6214  putative FAD-binding dehydrogenase  39.05 
 
 
551 aa  342  8e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3668  putative FAD-binding dehydrogenase  37.52 
 
 
552 aa  340  2.9999999999999998e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114123  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1621  putative FAD-binding dehydrogenase  39.19 
 
 
545 aa  339  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5200  putative FAD-binding dehydrogenase  39.21 
 
 
556 aa  339  7e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5288  putative FAD-binding dehydrogenase  39.21 
 
 
556 aa  339  7e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.918325  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3745  putative FAD-binding dehydrogenase  38.8 
 
 
549 aa  339  8e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4560  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  38.38 
 
 
557 aa  338  9.999999999999999e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.935324  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2085  putative FAD-binding dehydrogenase  38.18 
 
 
558 aa  338  1.9999999999999998e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.376668  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5580  putative FAD-binding dehydrogenase  39.21 
 
 
556 aa  337  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.684507  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10800  putative FAD-binding dehydrogenase  39.12 
 
 
566 aa  335  9e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0163  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  37.82 
 
 
548 aa  332  1e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0957  putative FAD-binding dehydrogenase  38.04 
 
 
558 aa  331  2e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1725  putative FAD-binding dehydrogenase  39.26 
 
 
551 aa  327  2.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.64226  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08090  predicted oxidoreductase  39.53 
 
 
549 aa  326  5e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0173464  normal  0.283602 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0741  putative FAD-binding dehydrogenase  38.36 
 
 
555 aa  325  1e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1043  putative FAD-binding dehydrogenase  36.96 
 
 
558 aa  318  1e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0883  putative FAD-binding dehydrogenase  37.94 
 
 
552 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.237453  normal  0.672197 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1896  putative FAD-binding dehydrogenase  36.43 
 
 
557 aa  309  1.0000000000000001e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06450  predicted oxidoreductase  38.22 
 
 
559 aa  307  3e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3994  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  36.93 
 
 
571 aa  306  5.0000000000000004e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.542255  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1100  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  38.18 
 
 
551 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000939173 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4333  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  37 
 
 
597 aa  304  3.0000000000000004e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2248  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  38.1 
 
 
555 aa  303  6.000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.826896  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3223  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  37.92 
 
 
550 aa  301  2e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0675  putative FAD-binding dehydrogenase  38 
 
 
552 aa  301  3e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.935742  normal  0.139475 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0670  putative FAD-binding dehydrogenase  37.07 
 
 
551 aa  296  8e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1344  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  37.25 
 
 
559 aa  295  1e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.543603  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0628  putative FAD-binding dehydrogenase  36.68 
 
 
551 aa  293  8e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3775  putative FAD-binding dehydrogenase  34.94 
 
 
553 aa  291  2e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2713  putative FAD-binding dehydrogenase  35.8 
 
 
551 aa  283  6.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0401801  hitchhiker  0.00069854 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2532  putative FAD-binding dehydrogenase  35.8 
 
 
551 aa  280  6e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.608155 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1140  putative FAD-binding dehydrogenase  37.5 
 
 
573 aa  280  7e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.196555  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2414  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  36.08 
 
 
571 aa  278  2e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0440095  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0214  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  34.54 
 
 
558 aa  273  4.0000000000000004e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0191  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  36.36 
 
 
550 aa  268  1e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1003  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.6 
 
 
522 aa  182  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0945  Succinate dehydrogenase  23.7 
 
 
511 aa  95.1  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03960  FAD dependent oxidoreductase  54.67 
 
 
98 aa  86.7  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.933434  normal  0.205844 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0795  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.68 
 
 
509 aa  85.1  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.820864  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4075  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  26.07 
 
 
484 aa  84  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1029  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.09 
 
 
509 aa  79.3  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04200  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  23.06 
 
 
481 aa  77.8  0.0000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.906237  normal  0.517886 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22640  aspartate oxidase  23.96 
 
 
623 aa  76.6  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.73746 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4061  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  24.51 
 
 
476 aa  72  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  24.49 
 
 
589 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  24.18 
 
 
582 aa  67.8  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  23.3 
 
 
597 aa  67.4  0.0000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2826  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.21 
 
 
543 aa  67  0.0000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3181  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.29 
 
 
523 aa  66.2  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.357921  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  23.96 
 
 
582 aa  65.9  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  22.83 
 
 
457 aa  64.7  0.000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4620  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  24.12 
 
 
582 aa  63.9  0.000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  21.19 
 
 
637 aa  63.9  0.000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  22.43 
 
 
502 aa  63.5  0.000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4325  flavocytochrome c  23.69 
 
 
582 aa  62.8  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4193  flavocytochrome c  23.69 
 
 
582 aa  62.8  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  22.94 
 
 
591 aa  62.8  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  22.26 
 
 
464 aa  62.4  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  26.06 
 
 
470 aa  62  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3252  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.1 
 
 
523 aa  61.2  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.556116  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13430  flavocytochrome c  21.47 
 
 
616 aa  60.8  0.00000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  26.18 
 
 
519 aa  60.8  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  23.5 
 
 
588 aa  59.3  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3501  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.29 
 
 
510 aa  59.3  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116635  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4077  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  24.62 
 
 
491 aa  58.5  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  32.89 
 
 
519 aa  57.8  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0298  putative flavoprotein subunit of a reductase  23.91 
 
 
508 aa  57.8  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000145919 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_10064  predicted protein  22.48 
 
 
561 aa  57  0.0000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.14351 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3301  flavocytochrome c flavin subunit  27.8 
 
 
499 aa  57  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2432  flavocytochrome c  30.66 
 
 
517 aa  56.2  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77876  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01543  hypothetical fumarate reductase (Eurofung)  22.51 
 
 
627 aa  55.8  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000554356  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  22.95 
 
 
598 aa  56.2  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0270  flavocytochrome c flavin subunit  21.45 
 
 
511 aa  56.2  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0340  flavocytochrome c  27.31 
 
 
500 aa  55.5  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  23.41 
 
 
586 aa  55.8  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4671  putative 3-oxosteroid 1-dehydrogenase  33.07 
 
 
577 aa  55.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  23.09 
 
 
596 aa  55.5  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0287  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  25.09 
 
 
514 aa  55.5  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205707  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  29.72 
 
 
517 aa  55.5  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0297  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  25.09 
 
 
514 aa  55.5  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.374229 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  23.09 
 
 
597 aa  55.1  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01540  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  23.03 
 
 
501 aa  54.7  0.000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0190007 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12690  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  24.19 
 
 
580 aa  54.3  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3820  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30 
 
 
554 aa  54.7  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0510368  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  22.45 
 
 
599 aa  54.7  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1444  flavocytochrome c  21.43 
 
 
512 aa  53.9  0.000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  29.25 
 
 
517 aa  53.9  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2089  flavocytochrome c  29.73 
 
 
519 aa  53.9  0.000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.455233  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2778  Succinate dehydrogenase  21.74 
 
 
510 aa  53.5  0.000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.961247  normal  0.792272 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  22.66 
 
 
596 aa  53.5  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  22.87 
 
 
504 aa  52.8  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  22.16 
 
 
596 aa  53.5  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>