More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2085 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_1621  putative FAD-binding dehydrogenase  62.52 
 
 		 545 aa  668    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0670  putative FAD-binding dehydrogenase  64.27 
 
 		 551 aa  636    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2713  putative FAD-binding dehydrogenase  65.23 
 
 		 551 aa  655    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0401801  hitchhiker  0.00069854 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3223  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  64.26 
 
 		 550 aa  642    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3775  putative FAD-binding dehydrogenase  62.5 
 
 		 553 aa  645    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0883  putative FAD-binding dehydrogenase  65.38 
 
 		 552 aa  677    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.237453  normal  0.672197 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3745  putative FAD-binding dehydrogenase  61.19 
 
 		 549 aa  647    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4333  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  62.27 
 
 		 597 aa  644    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2085  putative FAD-binding dehydrogenase  100 
 
 		 558 aa  1123    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.376668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1725  putative FAD-binding dehydrogenase  64.4 
 
 		 551 aa  660    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.64226  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5200  putative FAD-binding dehydrogenase  76.71 
 
 		 556 aa  848    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0957  putative FAD-binding dehydrogenase  70.32 
 
 		 558 aa  762    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1043  putative FAD-binding dehydrogenase  70.22 
 
 		 558 aa  750    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10800  putative FAD-binding dehydrogenase  62.27 
 
 		 566 aa  666    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1140  putative FAD-binding dehydrogenase  66.86 
 
 		 573 aa  645    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.196555  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0163  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  63.24 
 
 		 548 aa  684    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3668  putative FAD-binding dehydrogenase  65.47 
 
 		 552 aa  703    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114123  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3994  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  63.04 
 
 		 571 aa  654    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.542255  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2248  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  64.94 
 
 		 555 aa  637    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.826896  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5288  putative FAD-binding dehydrogenase  76.71 
 
 		 556 aa  848    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.918325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5132  putative FAD-binding dehydrogenase  62.39 
 
 		 555 aa  662    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2532  putative FAD-binding dehydrogenase  64.97 
 
 		 551 aa  650    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.608155 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4560  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  63.13 
 
 		 557 aa  656    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.935324  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5580  putative FAD-binding dehydrogenase  76.9 
 
 		 556 aa  849    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.684507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06450  predicted oxidoreductase  61.64 
 
 		 559 aa  633  1e-180  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1896  putative FAD-binding dehydrogenase  60.44 
 
 		 557 aa  632  1e-180  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0628  putative FAD-binding dehydrogenase  64.09 
 
 		 551 aa  632  1e-180  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6214  putative FAD-binding dehydrogenase  59.57 
 
 		 551 aa  631  1e-180  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08090  predicted oxidoreductase  63.79 
 
 		 549 aa  632  1e-180  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0173464  normal  0.283602 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0741  putative FAD-binding dehydrogenase  60.36 
 
 		 555 aa  617  1e-175  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0675  putative FAD-binding dehydrogenase  58.38 
 
 		 552 aa  577  1.0000000000000001e-163  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.935742  normal  0.139475 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0191  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  58.08 
 
 		 550 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1100  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  55.54 
 
 		 551 aa  543  1e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000939173 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1344  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  55 
 
 		 559 aa  528  1e-148  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.543603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0214  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  51.45 
 
 		 558 aa  513  1e-144  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2414  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  53.24 
 
 		 571 aa  508  9.999999999999999e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0440095  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2343  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  37.86 
 
 		 552 aa  343  5e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0870  putative fumarate reductase flavoprotein  35.89 
 
 		 549 aa  311  1e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4675  putative fumarate reductase flavoprotein  36.28 
 
 		 533 aa  310  5.9999999999999995e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.572233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  40 
 
 		 537 aa  309  6.999999999999999e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.223151  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3510  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  35.06 
 
 		 541 aa  309  8e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2809  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  35.9 
 
 		 537 aa  295  1e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3486  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  35.53 
 
 		 537 aa  286  5e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.664087  normal  0.809041 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1003  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.48 
 
 		 522 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03960  FAD dependent oxidoreductase  68.06 
 
 		 98 aa  103  8e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.933434  normal  0.205844 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  24.27 
 
 		 608 aa  100  5e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  23.78 
 
 		 465 aa  92  2e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  23.74 
 
 		 637 aa  80.1  0.00000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  23.42 
 
 		 597 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3301  flavocytochrome c flavin subunit  28.84 
 
 		 499 aa  77.4  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  24.14 
 
 		 464 aa  77  0.0000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13430  flavocytochrome c  25.22 
 
 		 616 aa  74.7  0.000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  23.78 
 
 		 457 aa  71.6  0.00000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1029  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.74 
 
 		 509 aa  71.2  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0795  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.69 
 
 		 509 aa  69.7  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.820864  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  23.83 
 
 		 504 aa  67.4  0.0000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  25 
 
 		 517 aa  66.6  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0270  flavocytochrome c flavin subunit  27.38 
 
 		 511 aa  65.9  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.06 
 
 		 519 aa  65.5  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_10064  predicted protein  23.04 
 
 		 561 aa  64.7  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.14351 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3181  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.65 
 
 		 523 aa  64.3  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.357921  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0208  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.3 
 
 		 534 aa  63.2  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177  normal  0.616185 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4075  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  25.62 
 
 		 484 aa  62.8  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0003  flavocytochrome c flavin subunit  22.83 
 
 		 508 aa  62.8  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000666036  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22640  aspartate oxidase  26.87 
 
 		 623 aa  62.8  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.73746 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1444  flavocytochrome c  28.57 
 
 		 512 aa  62  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01540  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  23.45 
 
 		 501 aa  62  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0190007 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1005  hypothetical protein  37.06 
 
 		 555 aa  60.8  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0143655 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4077  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  24.04 
 
 		 491 aa  61.2  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04200  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  31.69 
 
 		 481 aa  61.2  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.906237  normal  0.517886 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0945  Succinate dehydrogenase  24.83 
 
 		 511 aa  60.8  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  40.24 
 
 		 515 aa  60.5  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0316  hypothetical protein  45.88 
 
 		 487 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.719492  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2778  Succinate dehydrogenase  23.1 
 
 		 510 aa  58.9  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.961247  normal  0.792272 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0326  hypothetical protein  45.88 
 
 		 487 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.173098 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  24.6 
 
 		 519 aa  58.9  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0307  hypothetical protein  45.88 
 
 		 487 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.681233  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3252  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.21 
 
 		 523 aa  58.9  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.556116  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0136  flavocytochrome c flavin subunit  21.79 
 
 		 517 aa  58.5  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.584631  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4550  hypothetical protein  46.91 
 
 		 482 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.288577 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2933  flavocytochrome c  40.24 
 
 		 521 aa  57.8  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  25.21 
 
 		 519 aa  57.4  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2096  flavocytochrome c  30.29 
 
 		 515 aa  57.4  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148795  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02520  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  26.54 
 
 		 527 aa  57  0.0000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.152988  normal  0.211132 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  44.44 
 
 		 598 aa  56.6  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  37.97 
 
 		 589 aa  56.2  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  36.26 
 
 		 502 aa  56.6  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3846  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  46.99 
 
 		 486 aa  57  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1861  flavocytochrome c  30.86 
 
 		 515 aa  56.6  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  27.67 
 
 		 519 aa  56.6  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01543  hypothetical fumarate reductase (Eurofung)  46.15 
 
 		 627 aa  55.8  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000554356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2084  flavocytochrome c  42.11 
 
 		 520 aa  55.1  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21320  fumarate reductase/succinate dehyfrogenase, flavoprotein subunit  26.32 
 
 		 514 aa  55.5  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.22533  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  43.08 
 
 		 596 aa  55.1  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  34.86 
 
 		 589 aa  55.1  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  24.23 
 
 		 593 aa  55.1  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3056  tricarballylate dehydrogenase  24.66 
 
 		 482 aa  55.1  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  38.3 
 
 		 588 aa  54.7  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0904  succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  23.33 
 
 		 603 aa  54.7  0.000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000602214 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  35.65 
 
 		 582 aa  54.7  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>