More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1861 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2096  flavocytochrome c  94.76 
 
 
515 aa  975    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148795  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1782  flavocytochrome c  99.61 
 
 
515 aa  1044    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1861  flavocytochrome c  100 
 
 
515 aa  1048    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  38.96 
 
 
510 aa  311  1e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  38.26 
 
 
517 aa  309  9e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  41.56 
 
 
609 aa  300  5e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  38.33 
 
 
584 aa  294  2e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  37.04 
 
 
515 aa  294  3e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  37.78 
 
 
582 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0136  flavocytochrome c flavin subunit  38.1 
 
 
517 aa  287  4e-76  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.584631  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  37.08 
 
 
586 aa  286  5e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  37.28 
 
 
586 aa  286  7e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  39.35 
 
 
599 aa  284  2.0000000000000002e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2432  flavocytochrome c  36.11 
 
 
517 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77876  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  35.56 
 
 
519 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2933  flavocytochrome c  35.59 
 
 
521 aa  281  2e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  34.95 
 
 
519 aa  280  4e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  34.02 
 
 
519 aa  280  5e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  34.72 
 
 
517 aa  278  2e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4620  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  36.97 
 
 
582 aa  278  2e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0913  flavocytochrome c  37.66 
 
 
483 aa  278  2e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.387235  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  35.26 
 
 
517 aa  278  2e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4325  flavocytochrome c  37.98 
 
 
582 aa  272  1e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4193  flavocytochrome c  37.98 
 
 
582 aa  272  1e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  37.98 
 
 
582 aa  272  1e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  38.15 
 
 
598 aa  266  7e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  37.02 
 
 
598 aa  263  6e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  36.81 
 
 
598 aa  261  3e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1444  flavocytochrome c  35.7 
 
 
512 aa  258  3e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  37.15 
 
 
596 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10160  flavocytochrome c  37.8 
 
 
603 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  0.0211586 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  39.57 
 
 
596 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  36.29 
 
 
589 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  38.32 
 
 
596 aa  253  6e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0270  flavocytochrome c flavin subunit  34.91 
 
 
511 aa  253  7e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  38.91 
 
 
596 aa  252  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  38.91 
 
 
596 aa  252  1e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  38.91 
 
 
596 aa  252  1e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  38.91 
 
 
596 aa  252  1e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  38.11 
 
 
596 aa  251  2e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0275  flavocytochrome c  34.96 
 
 
506 aa  251  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000326146 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  38.11 
 
 
596 aa  251  2e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3536  flavocytochrome c  32.69 
 
 
506 aa  251  2e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  38.41 
 
 
591 aa  248  1e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3939  flavocytochrome c  34.46 
 
 
506 aa  248  2e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  39.13 
 
 
597 aa  248  2e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0256  flavocytochrome c  32.3 
 
 
506 aa  247  3e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  38.21 
 
 
925 aa  247  3e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  37.24 
 
 
589 aa  247  4e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  38.87 
 
 
593 aa  246  8e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0273  flavocytochrome c  34.17 
 
 
506 aa  246  9e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000188956 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3897  flavocytochrome c  33.83 
 
 
506 aa  244  3e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.513243  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  36.65 
 
 
591 aa  243  5e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2230  flavocytochrome c  33.4 
 
 
506 aa  243  5e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  37.44 
 
 
596 aa  243  7.999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3624  flavocytochrome c flavin subunit  35.58 
 
 
494 aa  242  1e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2153  flavocytochrome c  32.63 
 
 
506 aa  242  1e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0615938 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2381  NADH:flavin oxidoreductase/fumarate reductase, flavoprotein subunit, putative  34.11 
 
 
1005 aa  241  2.9999999999999997e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  37.42 
 
 
596 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  35.33 
 
 
502 aa  241  2.9999999999999997e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  36.33 
 
 
597 aa  240  4e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  37.42 
 
 
596 aa  238  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4178  flavocytochrome c flavin subunit  33.9 
 
 
500 aa  237  3e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.630459 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  37.67 
 
 
596 aa  238  3e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05539  oxidoreductase  34.4 
 
 
1004 aa  237  4e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0107  flavocytochrome c  35.67 
 
 
605 aa  236  6e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  36.77 
 
 
583 aa  236  6e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  33.33 
 
 
588 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2625  flavocytochrome c  36.61 
 
 
957 aa  231  2e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809387  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0139  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 
511 aa  231  3e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0325  flavocytochrome c  35.89 
 
 
507 aa  231  3e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3495  flavocytochrome c  37.25 
 
 
925 aa  230  5e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2558  flavocytochrome c  34.08 
 
 
926 aa  229  6e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13640  flavocytochrome c  35.03 
 
 
650 aa  229  7e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1803  FAD binding domain-containing protein  32.71 
 
 
521 aa  228  2e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000300511  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  35.31 
 
 
589 aa  225  1e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2084  flavocytochrome c  35.59 
 
 
520 aa  223  6e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0049  fumarate reductase flavoprotein subunit  33.81 
 
 
616 aa  223  6e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00375543  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2089  flavocytochrome c  34.33 
 
 
519 aa  223  6e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.455233  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  33.85 
 
 
608 aa  223  8e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  32.9 
 
 
457 aa  221  1.9999999999999999e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2534  flavocytochrome c  33.62 
 
 
506 aa  219  7e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.135835  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0488  flavocytochrome c  34.18 
 
 
606 aa  219  7e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.203471 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1414  flavocytochrome c flavin subunit, putative  33.19 
 
 
506 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2653  flavocytochrome c  34.19 
 
 
631 aa  217  2.9999999999999998e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.123058 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2511  flavocytochrome c  31.42 
 
 
507 aa  217  4e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.842513  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0002  flavocytochrome c flavin subunit  30.75 
 
 
518 aa  216  5.9999999999999996e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000401985  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0003  flavocytochrome c flavin subunit  34.22 
 
 
508 aa  216  7e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000666036  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13430  flavocytochrome c  34.76 
 
 
616 aa  215  9.999999999999999e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0340  flavocytochrome c  34.6 
 
 
500 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0299  flavocytochrome c  33.4 
 
 
506 aa  213  7.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0588345 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  32.7 
 
 
464 aa  213  9e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4184  flavocytochrome c  33.26 
 
 
503 aa  212  1e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.159689 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  32.33 
 
 
465 aa  211  2e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3301  flavocytochrome c flavin subunit  33.05 
 
 
499 aa  209  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0276  flavocytochrome c  32.71 
 
 
505 aa  208  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106606 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  32.13 
 
 
504 aa  207  3e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  32.73 
 
 
637 aa  206  9e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2401  flavocytochrome c flavin subunit  30.61 
 
 
505 aa  192  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52061  predicted protein  34.73 
 
 
587 aa  189  8e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>