More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_2558 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP2381  NADH:flavin oxidoreductase/fumarate reductase, flavoprotein subunit, putative  37.86 
 
 
1005 aa  658    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2558  flavocytochrome c  100 
 
 
926 aa  1900    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  76.41 
 
 
925 aa  1428    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3495  flavocytochrome c  76.74 
 
 
925 aa  1441    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2625  flavocytochrome c  67.62 
 
 
957 aa  1258    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809387  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05539  oxidoreductase  38.38 
 
 
1004 aa  659    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  49.48 
 
 
502 aa  480  1e-134  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  49.77 
 
 
598 aa  414  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  46.31 
 
 
457 aa  398  1e-109  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  39.89 
 
 
597 aa  395  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  40.17 
 
 
608 aa  392  1e-107  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  44.27 
 
 
598 aa  384  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  45.07 
 
 
465 aa  382  1e-104  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  43.6 
 
 
598 aa  378  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  45.82 
 
 
589 aa  375  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  43.65 
 
 
596 aa  371  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  45.81 
 
 
504 aa  368  1e-100  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  43.51 
 
 
596 aa  365  1e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  43.88 
 
 
596 aa  366  1e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  43.42 
 
 
583 aa  366  1e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  44.72 
 
 
464 aa  366  1e-99  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  42.49 
 
 
596 aa  360  9.999999999999999e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  45.17 
 
 
591 aa  358  3.9999999999999996e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  42.49 
 
 
596 aa  358  3.9999999999999996e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  41.77 
 
 
596 aa  336  1e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  41.77 
 
 
596 aa  336  1e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  41.77 
 
 
596 aa  336  1e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  41.77 
 
 
596 aa  336  1e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  41.99 
 
 
596 aa  336  1e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  41.77 
 
 
596 aa  336  1e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  41.77 
 
 
596 aa  335  2e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  41.56 
 
 
597 aa  334  3e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  38.18 
 
 
588 aa  335  3e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  43.12 
 
 
593 aa  335  3e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  39.64 
 
 
589 aa  331  5.0000000000000004e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  41.13 
 
 
596 aa  330  5.0000000000000004e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0516  NADH:flavin oxidoreductase  40.88 
 
 
372 aa  328  4.0000000000000003e-88  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2008  NADH:flavin oxidoreductase  43.38 
 
 
396 aa  312  2e-83  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  38.25 
 
 
599 aa  306  8.000000000000001e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  35.89 
 
 
609 aa  304  5.000000000000001e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  40.55 
 
 
589 aa  301  3e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  34.73 
 
 
584 aa  295  2e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf867  NADH-dependent flavin oxidoreductase  41.44 
 
 
367 aa  293  1e-77  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  35.5 
 
 
582 aa  291  5.0000000000000004e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  33.5 
 
 
586 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4620  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  35.14 
 
 
582 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1532  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.11 
 
 
374 aa  282  3e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  36.04 
 
 
582 aa  281  3e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  32.55 
 
 
586 aa  280  1e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4193  flavocytochrome c  35.32 
 
 
582 aa  271  4e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4325  flavocytochrome c  35.32 
 
 
582 aa  271  4e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  34.22 
 
 
591 aa  268  5e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0493  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.67 
 
 
368 aa  266  8.999999999999999e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00242088  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  33.68 
 
 
637 aa  262  2e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2284  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  38.04 
 
 
384 aa  259  2e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7286  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  36.68 
 
 
384 aa  258  4e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.423648 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0837  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  38.61 
 
 
377 aa  253  1e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0975  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  38.21 
 
 
375 aa  246  9.999999999999999e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0956  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  38.21 
 
 
375 aa  246  9.999999999999999e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0325  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  35.83 
 
 
380 aa  240  9e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000687106  normal  0.103488 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0345  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  35.28 
 
 
380 aa  238  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0352016  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0049  fumarate reductase flavoprotein subunit  31.61 
 
 
616 aa  232  2e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00375543  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13430  flavocytochrome c  31.5 
 
 
616 aa  232  3e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1866  NADH:flavin oxidoreductase  35.09 
 
 
389 aa  231  4e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.151913  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2653  flavocytochrome c  31.45 
 
 
631 aa  230  1e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.123058 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0542  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  36.16 
 
 
375 aa  229  2e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51720  fumarate reductase flavoprotein  32.64 
 
 
668 aa  228  3e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.744935  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01543  hypothetical fumarate reductase (Eurofung)  32.19 
 
 
627 aa  228  4e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000554356  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1861  flavocytochrome c  35.93 
 
 
515 aa  227  6e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2096  flavocytochrome c  35.75 
 
 
515 aa  226  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148795  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1782  flavocytochrome c  35.96 
 
 
515 aa  226  2e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13640  flavocytochrome c  29.91 
 
 
650 aa  225  2e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_10064  predicted protein  36.15 
 
 
561 aa  224  4.9999999999999996e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.14351 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10160  flavocytochrome c  34.17 
 
 
603 aa  224  4.9999999999999996e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  0.0211586 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  33.2 
 
 
517 aa  223  9.999999999999999e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10296  FAD dependent oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05070)  32.55 
 
 
484 aa  222  1.9999999999999999e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0488  flavocytochrome c  33.39 
 
 
606 aa  219  2e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.203471 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0107  flavocytochrome c  33.46 
 
 
605 aa  213  9e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52061  predicted protein  31.07 
 
 
587 aa  213  1e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27122  predicted protein  31.07 
 
 
587 aa  213  1e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0188056 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  31.6 
 
 
519 aa  211  6e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  33.05 
 
 
515 aa  207  5e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  31.22 
 
 
519 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  32.4 
 
 
510 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53948  Osmotic growth protein  30.64 
 
 
659 aa  202  1.9999999999999998e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.621591 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45689  fumarate reductase flavoprotein subunit  30.99 
 
 
478 aa  202  1.9999999999999998e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00140  fumarate reductase (NADH), putative  28.63 
 
 
635 aa  200  1.0000000000000001e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0434389  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0913  flavocytochrome c  31.25 
 
 
483 aa  199  2.0000000000000003e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.387235  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0136  flavocytochrome c flavin subunit  30.91 
 
 
517 aa  197  5.000000000000001e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.584631  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  31.61 
 
 
519 aa  196  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  29.14 
 
 
517 aa  195  4e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  29.14 
 
 
517 aa  194  9e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0270  flavocytochrome c flavin subunit  31.7 
 
 
511 aa  191  4e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2432  flavocytochrome c  29.44 
 
 
517 aa  191  4e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77876  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2933  flavocytochrome c  31.29 
 
 
521 aa  185  3e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1061  oxidoreductase, FMN-binding  33.15 
 
 
399 aa  185  4.0000000000000006e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.777824  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0340  flavocytochrome c  30.25 
 
 
500 aa  178  3e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0771  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  37.46 
 
 
330 aa  178  5e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0157719 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3301  flavocytochrome c flavin subunit  29.76 
 
 
499 aa  177  9e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2511  flavocytochrome c  31 
 
 
507 aa  174  5e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.842513  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>