More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0694 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4620  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  61.68 
 
 		 582 aa  706    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4193  flavocytochrome c  61.51 
 
 		 582 aa  692    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  61.03 
 
 		 582 aa  703    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4325  flavocytochrome c  61.51 
 
 		 582 aa  692    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  60.52 
 
 		 582 aa  689    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  100 
 
 		 584 aa  1193    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  58.65 
 
 		 586 aa  676    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  57.39 
 
 		 586 aa  664    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  49.36 
 
 		 609 aa  499  1e-140  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  47.55 
 
 		 599 aa  501  1e-140  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10160  flavocytochrome c  44.84 
 
 		 603 aa  426  1e-118  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  0.0211586 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  44.26 
 
 		 591 aa  402  1e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0107  flavocytochrome c  42.22 
 
 		 605 aa  386  1e-106  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0488  flavocytochrome c  41.01 
 
 		 606 aa  367  1e-100  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.203471 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  42.89 
 
 		 598 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  36.74 
 
 		 597 aa  303  5.000000000000001e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  37.3 
 
 		 608 aa  299  8e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  37.3 
 
 		 510 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  37.3 
 
 		 502 aa  283  5.000000000000001e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3495  flavocytochrome c  37.14 
 
 		 925 aa  281  2e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  36.84 
 
 		 457 aa  277  3e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  36.71 
 
 		 925 aa  276  6e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  36.91 
 
 		 517 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  37.26 
 
 		 596 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  37.36 
 
 		 464 aa  273  7e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2096  flavocytochrome c  38.76 
 
 		 515 aa  272  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148795  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2625  flavocytochrome c  35.22 
 
 		 957 aa  272  1e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809387  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  36.32 
 
 		 588 aa  271  2e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  37.07 
 
 		 598 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1861  flavocytochrome c  38.33 
 
 		 515 aa  270  4e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2381  NADH:flavin oxidoreductase/fumarate reductase, flavoprotein subunit, putative  33.6 
 
 		 1005 aa  270  5e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1782  flavocytochrome c  38.12 
 
 		 515 aa  269  1e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  37.01 
 
 		 598 aa  268  2e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  38.13 
 
 		 589 aa  268  2e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2653  flavocytochrome c  33.94 
 
 		 631 aa  267  5e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.123058 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2558  flavocytochrome c  34 
 
 		 926 aa  266  1e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  37.59 
 
 		 596 aa  264  4e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0913  flavocytochrome c  35.52 
 
 		 483 aa  259  7e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.387235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  35.27 
 
 		 517 aa  258  3e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  38.41 
 
 		 591 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  37.13 
 
 		 583 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  35.25 
 
 		 504 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  37.88 
 
 		 596 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  38.34 
 
 		 589 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  36.36 
 
 		 596 aa  251  3e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  35.06 
 
 		 515 aa  251  4e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  35.04 
 
 		 517 aa  250  6e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  38.04 
 
 		 593 aa  250  6e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0136  flavocytochrome c flavin subunit  35.02 
 
 		 517 aa  249  8e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.584631  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  36.22 
 
 		 596 aa  249  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  37.88 
 
 		 596 aa  248  2e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05539  oxidoreductase  31.75 
 
 		 1004 aa  248  2e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  35.6 
 
 		 519 aa  248  3e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13640  flavocytochrome c  31.22 
 
 		 650 aa  247  4e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  37.45 
 
 		 596 aa  246  6e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  37.23 
 
 		 596 aa  246  8e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  37.58 
 
 		 597 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2432  flavocytochrome c  34.62 
 
 		 517 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77876  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  37.23 
 
 		 596 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  37.23 
 
 		 596 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  37.23 
 
 		 596 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  37.23 
 
 		 596 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  34.9 
 
 		 519 aa  244  5e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  35.58 
 
 		 465 aa  243  7e-63  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  35.34 
 
 		 519 aa  243  9e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2933  flavocytochrome c  32.7 
 
 		 521 aa  243  1e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  35.54 
 
 		 596 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  31.46 
 
 		 589 aa  238  2e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  33.39 
 
 		 637 aa  236  7e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13430  flavocytochrome c  33.45 
 
 		 616 aa  234  4.0000000000000004e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3301  flavocytochrome c flavin subunit  34.39 
 
 		 499 aa  230  6e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0270  flavocytochrome c flavin subunit  33.86 
 
 		 511 aa  230  6e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0049  fumarate reductase flavoprotein subunit  32.09 
 
 		 616 aa  224  3e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00375543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3897  flavocytochrome c  33.26 
 
 		 506 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.513243  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0256  flavocytochrome c  32.39 
 
 		 506 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0139  radical SAM domain-containing protein  32.09 
 
 		 511 aa  216  7e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3536  flavocytochrome c  32.59 
 
 		 506 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0273  flavocytochrome c  33.05 
 
 		 506 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188956 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0340  flavocytochrome c  33.69 
 
 		 500 aa  213  9e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0002  flavocytochrome c flavin subunit  31.4 
 
 		 518 aa  211  2e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000401985  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2230  flavocytochrome c  32.39 
 
 		 506 aa  211  3e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1444  flavocytochrome c  33.61 
 
 		 512 aa  210  8e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2153  flavocytochrome c  32.39 
 
 		 506 aa  209  9e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0615938 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2089  flavocytochrome c  34.03 
 
 		 519 aa  209  1e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.455233  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3939  flavocytochrome c  32.22 
 
 		 506 aa  207  4e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0003  flavocytochrome c flavin subunit  32.75 
 
 		 508 aa  207  5e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000666036  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0275  flavocytochrome c  32.34 
 
 		 506 aa  206  7e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000326146 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52061  predicted protein  34.11 
 
 		 587 aa  201  3.9999999999999996e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27122  predicted protein  34.11 
 
 		 587 aa  201  3.9999999999999996e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0188056 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1803  FAD binding domain-containing protein  32.92 
 
 		 521 aa  199  1.0000000000000001e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000300511  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2084  flavocytochrome c  33.46 
 
 		 520 aa  197  5.000000000000001e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3624  flavocytochrome c flavin subunit  31.56 
 
 		 494 aa  195  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2401  flavocytochrome c flavin subunit  31.29 
 
 		 505 aa  192  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00140  fumarate reductase (NADH), putative  30.75 
 
 		 635 aa  187  4e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0434389  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4178  flavocytochrome c flavin subunit  29.94 
 
 		 500 aa  187  4e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.630459 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2511  flavocytochrome c  30.1 
 
 		 507 aa  186  7e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.842513  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04200  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  29.09 
 
 		 481 aa  181  2.9999999999999997e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.906237  normal  0.517886 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4184  flavocytochrome c  31.7 
 
 		 503 aa  173  9e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.159689 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0276  flavocytochrome c  31.84 
 
 		 505 aa  172  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106606 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2534  flavocytochrome c  31.36 
 
 		 506 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.135835  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>