More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_0256 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_0275  flavocytochrome c  83 
 
 
506 aa  877    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000326146 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0254  flavocytochrome c  91.28 
 
 
367 aa  721    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0256  flavocytochrome c  100 
 
 
506 aa  1053    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2153  flavocytochrome c  93.87 
 
 
506 aa  1003    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0615938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2230  flavocytochrome c  94.66 
 
 
506 aa  1009    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3897  flavocytochrome c  84.36 
 
 
506 aa  880    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.513243  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3939  flavocytochrome c  82.81 
 
 
506 aa  880    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3536  flavocytochrome c  93.86 
 
 
506 aa  1001    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0273  flavocytochrome c  86.36 
 
 
506 aa  923    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000188956 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4178  flavocytochrome c flavin subunit  55.02 
 
 
500 aa  567  1e-160  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.630459 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3624  flavocytochrome c flavin subunit  57.23 
 
 
494 aa  548  1e-155  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  47.31 
 
 
517 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  47.04 
 
 
519 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  46.51 
 
 
517 aa  456  1e-127  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  45.31 
 
 
519 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2432  flavocytochrome c  45.11 
 
 
517 aa  444  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77876  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  44.89 
 
 
519 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1444  flavocytochrome c  43.77 
 
 
512 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1803  FAD binding domain-containing protein  42.17 
 
 
521 aa  396  1e-109  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000300511  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0325  flavocytochrome c  41.24 
 
 
507 aa  397  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1414  flavocytochrome c flavin subunit, putative  42.29 
 
 
506 aa  392  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0299  flavocytochrome c  42.08 
 
 
506 aa  394  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0588345 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0276  flavocytochrome c  41.48 
 
 
505 aa  391  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106606 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2534  flavocytochrome c  40.32 
 
 
506 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.135835  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4184  flavocytochrome c  39.48 
 
 
503 aa  380  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.159689 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0270  flavocytochrome c flavin subunit  41.6 
 
 
511 aa  369  1e-101  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  39.22 
 
 
510 aa  363  3e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0136  flavocytochrome c flavin subunit  39.57 
 
 
517 aa  353  5e-96  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.584631  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  39.74 
 
 
517 aa  345  1e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2089  flavocytochrome c  39.5 
 
 
519 aa  343  5e-93  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.455233  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3301  flavocytochrome c flavin subunit  39.52 
 
 
499 aa  342  1e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2084  flavocytochrome c  40.43 
 
 
520 aa  342  1e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0139  radical SAM domain-containing protein  40.31 
 
 
511 aa  339  7e-92  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0340  flavocytochrome c  38.4 
 
 
500 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2511  flavocytochrome c  39.03 
 
 
507 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.842513  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2933  flavocytochrome c  37.07 
 
 
521 aa  326  6e-88  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  37.48 
 
 
515 aa  323  4e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0002  flavocytochrome c flavin subunit  36.24 
 
 
518 aa  311  2e-83  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000401985  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0913  flavocytochrome c  37.15 
 
 
483 aa  307  4.0000000000000004e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.387235  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0003  flavocytochrome c flavin subunit  35.73 
 
 
508 aa  298  2e-79  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000666036  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1548  flavocytochrome c flavin subunit  35.99 
 
 
501 aa  271  2e-71  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00203617  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0251  flavocytochrome c  97.04 
 
 
161 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2401  flavocytochrome c flavin subunit  32.16 
 
 
505 aa  256  9e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  34.43 
 
 
599 aa  238  2e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1643  FAD binding domain-containing protein  33.2 
 
 
491 aa  235  1.0000000000000001e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  34.55 
 
 
609 aa  228  2e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2096  flavocytochrome c  32.62 
 
 
515 aa  218  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148795  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  32.39 
 
 
584 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1861  flavocytochrome c  32.3 
 
 
515 aa  217  4e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1782  flavocytochrome c  32.11 
 
 
515 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  31.69 
 
 
582 aa  206  1e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4620  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  31.17 
 
 
582 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0488  flavocytochrome c  31.66 
 
 
606 aa  201  3.9999999999999996e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.203471 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0107  flavocytochrome c  31.69 
 
 
605 aa  200  5e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  31.56 
 
 
586 aa  199  9e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  32.98 
 
 
582 aa  193  8e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10160  flavocytochrome c  32.35 
 
 
603 aa  191  2e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  0.0211586 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  33.03 
 
 
596 aa  189  9e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  33.03 
 
 
596 aa  189  9e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  33.03 
 
 
596 aa  189  9e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  33.03 
 
 
596 aa  189  9e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  32.14 
 
 
598 aa  189  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  29.92 
 
 
586 aa  188  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  32.37 
 
 
591 aa  188  2e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  32.13 
 
 
596 aa  188  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  31.75 
 
 
597 aa  187  4e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  31.9 
 
 
596 aa  187  5e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  31.97 
 
 
596 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4193  flavocytochrome c  30.96 
 
 
582 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4325  flavocytochrome c  30.96 
 
 
582 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  31.9 
 
 
596 aa  184  3e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  30.11 
 
 
588 aa  176  9e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  29.65 
 
 
464 aa  171  2e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  32.21 
 
 
596 aa  169  9e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  31.57 
 
 
596 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1545  putative flavocytochrome c flavin subunit  27.31 
 
 
447 aa  167  4e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  31.77 
 
 
596 aa  167  5e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  31.29 
 
 
608 aa  167  5.9999999999999996e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  31.56 
 
 
583 aa  163  7e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  29.17 
 
 
457 aa  162  2e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  29.8 
 
 
596 aa  160  4e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  30.65 
 
 
596 aa  159  9e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  29.2 
 
 
598 aa  158  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  29.66 
 
 
502 aa  158  3e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  30.91 
 
 
593 aa  157  4e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  29.81 
 
 
465 aa  156  8e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  28.71 
 
 
598 aa  156  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  28.79 
 
 
589 aa  154  5e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13640  flavocytochrome c  27.66 
 
 
650 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2653  flavocytochrome c  28.54 
 
 
631 aa  152  1e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.123058 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  28.85 
 
 
597 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_10064  predicted protein  30.06 
 
 
561 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.14351 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  30.09 
 
 
925 aa  147  5e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00140  fumarate reductase (NADH), putative  27.88 
 
 
635 aa  146  9e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0434389  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  27.75 
 
 
504 aa  145  2e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2625  flavocytochrome c  28.78 
 
 
957 aa  144  4e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809387  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  28.79 
 
 
589 aa  144  5e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3495  flavocytochrome c  30.97 
 
 
925 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13430  flavocytochrome c  28.79 
 
 
616 aa  139  1e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  29.81 
 
 
589 aa  139  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>