More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1421 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  100 
 
 		 589 aa  1218    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  44.33 
 
 		 588 aa  514  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  46.38 
 
 		 589 aa  489  1e-137  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  45.96 
 
 		 596 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  45.96 
 
 		 596 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  46.5 
 
 		 589 aa  477  1e-133  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  45.96 
 
 		 596 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  45.96 
 
 		 596 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  45.88 
 
 		 596 aa  473  1e-132  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  45.79 
 
 		 596 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  45.55 
 
 		 596 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  44.46 
 
 		 593 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  45.45 
 
 		 597 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  45.45 
 
 		 596 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  45.01 
 
 		 591 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  43.28 
 
 		 598 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  43.42 
 
 		 583 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  42.31 
 
 		 596 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  43.28 
 
 		 598 aa  450  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  42.3 
 
 		 596 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  42.2 
 
 		 596 aa  444  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  41.57 
 
 		 596 aa  433  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  40.27 
 
 		 596 aa  423  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  42.63 
 
 		 598 aa  342  8e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  41.46 
 
 		 608 aa  327  3e-88  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  41.31 
 
 		 597 aa  323  8e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  41.29 
 
 		 925 aa  313  6.999999999999999e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3495  flavocytochrome c  41.94 
 
 		 925 aa  312  9e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  37.61 
 
 		 457 aa  312  1e-83  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  39.3 
 
 		 504 aa  311  2e-83  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  39.01 
 
 		 465 aa  308  2.0000000000000002e-82  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2625  flavocytochrome c  40.83 
 
 		 957 aa  307  3e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809387  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  37.27 
 
 		 502 aa  304  3.0000000000000004e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2558  flavocytochrome c  39.81 
 
 		 926 aa  301  2e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  36.99 
 
 		 599 aa  289  9e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  37.1 
 
 		 464 aa  283  6.000000000000001e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  36.78 
 
 		 609 aa  261  2e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  35.68 
 
 		 586 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4620  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  34.97 
 
 		 582 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  34.73 
 
 		 582 aa  253  6e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  31.46 
 
 		 584 aa  253  6e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  35.9 
 
 		 586 aa  250  4e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4325  flavocytochrome c  34.73 
 
 		 582 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4193  flavocytochrome c  34.73 
 
 		 582 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  34.27 
 
 		 582 aa  242  1e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  34.34 
 
 		 591 aa  234  3e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10160  flavocytochrome c  34.8 
 
 		 603 aa  231  3e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  0.0211586 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01543  hypothetical fumarate reductase (Eurofung)  33.83 
 
 		 627 aa  229  8e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000554356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52061  predicted protein  33.97 
 
 		 587 aa  229  9e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27122  predicted protein  33.97 
 
 		 587 aa  229  9e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0188056 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1861  flavocytochrome c  34.48 
 
 		 515 aa  223  6e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1782  flavocytochrome c  34.48 
 
 		 515 aa  223  8e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13640  flavocytochrome c  32.95 
 
 		 650 aa  223  9.999999999999999e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  35.11 
 
 		 637 aa  219  8.999999999999998e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13430  flavocytochrome c  34.76 
 
 		 616 aa  218  2e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2096  flavocytochrome c  33.56 
 
 		 515 aa  218  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148795  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  33.98 
 
 		 517 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51720  fumarate reductase flavoprotein  32.49 
 
 		 668 aa  212  1e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.744935  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0488  flavocytochrome c  32.62 
 
 		 606 aa  211  2e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.203471 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  36.13 
 
 		 515 aa  210  6e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  32.26 
 
 		 519 aa  209  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00140  fumarate reductase (NADH), putative  30.79 
 
 		 635 aa  207  4e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0434389  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0107  flavocytochrome c  33.18 
 
 		 605 aa  206  8e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0270  flavocytochrome c flavin subunit  33.68 
 
 		 511 aa  206  1e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10296  FAD dependent oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05070)  32.77 
 
 		 484 aa  204  3e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0913  flavocytochrome c  33.55 
 
 		 483 aa  204  3e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.387235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_10064  predicted protein  30.82 
 
 		 561 aa  200  6e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.14351 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2653  flavocytochrome c  34.11 
 
 		 631 aa  200  7e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.123058 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  31.83 
 
 		 519 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0136  flavocytochrome c flavin subunit  31.68 
 
 		 517 aa  199  2.0000000000000003e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.584631  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  31.88 
 
 		 510 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  31.4 
 
 		 519 aa  194  4e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3960  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  34.26 
 
 		 577 aa  193  6e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000052594  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2933  flavocytochrome c  31.01 
 
 		 521 aa  190  5.999999999999999e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0049  fumarate reductase flavoprotein subunit  29.96 
 
 		 616 aa  188  3e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00375543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1444  flavocytochrome c  30.83 
 
 		 512 aa  187  4e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2381  NADH:flavin oxidoreductase/fumarate reductase, flavoprotein subunit, putative  30.37 
 
 		 1005 aa  185  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  30.89 
 
 		 517 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  30.89 
 
 		 517 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0340  flavocytochrome c  30.51 
 
 		 500 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2432  flavocytochrome c  30.43 
 
 		 517 aa  184  3e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77876  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53948  Osmotic growth protein  32.36 
 
 		 659 aa  183  6e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.621591 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3301  flavocytochrome c flavin subunit  29.25 
 
 		 499 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1803  FAD binding domain-containing protein  30.98 
 
 		 521 aa  180  4.999999999999999e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000300511  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0002  flavocytochrome c flavin subunit  29.98 
 
 		 518 aa  179  1e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000401985  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05539  oxidoreductase  28.92 
 
 		 1004 aa  179  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0139  radical SAM domain-containing protein  30.85 
 
 		 511 aa  177  7e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2084  flavocytochrome c  32.06 
 
 		 520 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45689  fumarate reductase flavoprotein subunit  28.21 
 
 		 478 aa  171  5e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2089  flavocytochrome c  31.12 
 
 		 519 aa  169  1e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.455233  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4178  flavocytochrome c flavin subunit  30.19 
 
 		 500 aa  169  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.630459 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0273  flavocytochrome c  30.19 
 
 		 506 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188956 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3624  flavocytochrome c flavin subunit  29.7 
 
 		 494 aa  164  3e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2401  flavocytochrome c flavin subunit  29.05 
 
 		 505 aa  164  6e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0276  flavocytochrome c  30.19 
 
 		 505 aa  162  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106606 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0325  flavocytochrome c  30.28 
 
 		 507 aa  160  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3536  flavocytochrome c  28.88 
 
 		 506 aa  161  4e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0275  flavocytochrome c  29.91 
 
 		 506 aa  160  5e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000326146 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3939  flavocytochrome c  29.48 
 
 		 506 aa  160  5e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3768  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  29.2 
 
 		 460 aa  159  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>