More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3912 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4620  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  70.1 
 
 		 582 aa  843    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4193  flavocytochrome c  69.24 
 
 		 582 aa  815    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  70.27 
 
 		 582 aa  848    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  57.29 
 
 		 584 aa  684    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  70.1 
 
 		 582 aa  828    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4325  flavocytochrome c  69.24 
 
 		 582 aa  815    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  100 
 
 		 586 aa  1188    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  92.49 
 
 		 586 aa  1099    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  48.72 
 
 		 609 aa  502  1e-141  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  46.06 
 
 		 599 aa  501  1e-140  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10160  flavocytochrome c  43.32 
 
 		 603 aa  415  1e-114  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  0.0211586 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  45.95 
 
 		 591 aa  414  1e-114  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0488  flavocytochrome c  42.18 
 
 		 606 aa  366  1e-100  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.203471 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0107  flavocytochrome c  39.6 
 
 		 605 aa  356  5e-97  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  42.07 
 
 		 598 aa  317  3e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  37.52 
 
 		 597 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  37.7 
 
 		 608 aa  298  2e-79  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  36.27 
 
 		 502 aa  297  3e-79  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  36.48 
 
 		 588 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2625  flavocytochrome c  35.88 
 
 		 957 aa  286  5.999999999999999e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809387  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13640  flavocytochrome c  34.93 
 
 		 650 aa  286  7e-76  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  36.01 
 
 		 925 aa  283  6.000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  43.17 
 
 		 591 aa  281  2e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  38.72 
 
 		 598 aa  281  2e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  38.5 
 
 		 598 aa  279  1e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3495  flavocytochrome c  35.22 
 
 		 925 aa  279  1e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1782  flavocytochrome c  37.28 
 
 		 515 aa  277  3e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  40.52 
 
 		 589 aa  277  4e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1861  flavocytochrome c  37.08 
 
 		 515 aa  276  8e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  38.05 
 
 		 464 aa  275  2.0000000000000002e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  38.2 
 
 		 593 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  35.46 
 
 		 457 aa  273  6e-72  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  38.99 
 
 		 504 aa  273  7e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  36.27 
 
 		 517 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  39.25 
 
 		 596 aa  270  4e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  39.25 
 
 		 596 aa  270  4e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  39.04 
 
 		 596 aa  270  4e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  39.25 
 
 		 596 aa  270  4e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  39.25 
 
 		 596 aa  270  4e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  35.34 
 
 		 637 aa  270  5e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  39.25 
 
 		 596 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  38.82 
 
 		 596 aa  270  8e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2096  flavocytochrome c  35.64 
 
 		 515 aa  269  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148795  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  38.82 
 
 		 596 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  37.78 
 
 		 596 aa  267  4e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2558  flavocytochrome c  30.72 
 
 		 926 aa  267  4e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  35.32 
 
 		 589 aa  266  8e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  38.38 
 
 		 597 aa  265  2e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2653  flavocytochrome c  33.39 
 
 		 631 aa  264  3e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.123058 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  36.59 
 
 		 596 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2381  NADH:flavin oxidoreductase/fumarate reductase, flavoprotein subunit, putative  32.91 
 
 		 1005 aa  263  6e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  38.06 
 
 		 583 aa  263  6e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  38.37 
 
 		 596 aa  263  8e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  35.26 
 
 		 510 aa  263  8.999999999999999e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  38.15 
 
 		 596 aa  262  2e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0913  flavocytochrome c  36.77 
 
 		 483 aa  261  2e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.387235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  32.49 
 
 		 515 aa  256  1.0000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  36.88 
 
 		 596 aa  253  6e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  35.68 
 
 		 589 aa  253  8.000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0049  fumarate reductase flavoprotein subunit  33.17 
 
 		 616 aa  253  8.000000000000001e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00375543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05539  oxidoreductase  30.97 
 
 		 1004 aa  252  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  35.65 
 
 		 465 aa  247  4e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13430  flavocytochrome c  33.86 
 
 		 616 aa  240  4e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  33.19 
 
 		 519 aa  236  6e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0136  flavocytochrome c flavin subunit  32.71 
 
 		 517 aa  236  6e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.584631  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  32.62 
 
 		 517 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  32.41 
 
 		 519 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  32.03 
 
 		 517 aa  228  3e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0270  flavocytochrome c flavin subunit  33.05 
 
 		 511 aa  228  3e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2432  flavocytochrome c  32.33 
 
 		 517 aa  226  1e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77876  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2933  flavocytochrome c  33.12 
 
 		 521 aa  223  4.9999999999999996e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  31.5 
 
 		 519 aa  223  6e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3301  flavocytochrome c flavin subunit  32.18 
 
 		 499 aa  209  9e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0002  flavocytochrome c flavin subunit  31.87 
 
 		 518 aa  208  3e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000401985  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3536  flavocytochrome c  31.03 
 
 		 506 aa  206  6e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0139  radical SAM domain-containing protein  30.74 
 
 		 511 aa  204  3e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2230  flavocytochrome c  31.15 
 
 		 506 aa  204  5e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3897  flavocytochrome c  31.67 
 
 		 506 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.513243  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2153  flavocytochrome c  30.94 
 
 		 506 aa  200  5e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0615938 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0256  flavocytochrome c  29.92 
 
 		 506 aa  199  9e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3939  flavocytochrome c  31.56 
 
 		 506 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1444  flavocytochrome c  31.29 
 
 		 512 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2089  flavocytochrome c  33.54 
 
 		 519 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.455233  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0273  flavocytochrome c  31.03 
 
 		 506 aa  197  6e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188956 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2084  flavocytochrome c  32.86 
 
 		 520 aa  197  6e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1803  FAD binding domain-containing protein  31.26 
 
 		 521 aa  196  8.000000000000001e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000300511  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00140  fumarate reductase (NADH), putative  31.69 
 
 		 635 aa  196  1e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0434389  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4178  flavocytochrome c flavin subunit  30.1 
 
 		 500 aa  196  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.630459 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2401  flavocytochrome c flavin subunit  30.28 
 
 		 505 aa  194  5e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52061  predicted protein  32.22 
 
 		 587 aa  192  1e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27122  predicted protein  32.22 
 
 		 587 aa  192  1e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0188056 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0275  flavocytochrome c  30.92 
 
 		 506 aa  192  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000326146 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3624  flavocytochrome c flavin subunit  29.79 
 
 		 494 aa  187  3e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51720  fumarate reductase flavoprotein  29.59 
 
 		 668 aa  185  2.0000000000000003e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.744935  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0325  flavocytochrome c  30.84 
 
 		 507 aa  182  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2534  flavocytochrome c  30.21 
 
 		 506 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.135835  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0003  flavocytochrome c flavin subunit  29.19 
 
 		 508 aa  182  2e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000666036  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4184  flavocytochrome c  30.82 
 
 		 503 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.159689 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0276  flavocytochrome c  29.39 
 
 		 505 aa  180  8e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106606 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1414  flavocytochrome c flavin subunit, putative  30.64 
 
 		 506 aa  177  7e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>