More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_4325 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_4620  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  94.85 
 
 
582 aa  1108    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  69.66 
 
 
586 aa  831    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4325  flavocytochrome c  100 
 
 
582 aa  1184    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  92.61 
 
 
582 aa  1075    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  61.51 
 
 
584 aa  723    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  69.24 
 
 
586 aa  832    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  93.64 
 
 
582 aa  1097    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4193  flavocytochrome c  100 
 
 
582 aa  1184    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  45.26 
 
 
599 aa  501  1e-140  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  48.63 
 
 
609 aa  501  1e-140  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10160  flavocytochrome c  42.86 
 
 
603 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  0.0211586 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0488  flavocytochrome c  42.26 
 
 
606 aa  384  1e-105  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.203471 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  42.07 
 
 
591 aa  379  1e-104  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0107  flavocytochrome c  40.07 
 
 
605 aa  374  1e-102  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  36.43 
 
 
597 aa  312  1e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  37.12 
 
 
608 aa  306  9.000000000000001e-82  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  40.65 
 
 
598 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  38.5 
 
 
502 aa  291  3e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  37.34 
 
 
588 aa  288  1e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2653  flavocytochrome c  34.8 
 
 
631 aa  288  1e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.123058 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3495  flavocytochrome c  37.79 
 
 
925 aa  287  4e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  35.61 
 
 
925 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2625  flavocytochrome c  34.34 
 
 
957 aa  281  2e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809387  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  35.95 
 
 
517 aa  281  3e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  36.71 
 
 
515 aa  278  2e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1861  flavocytochrome c  38.05 
 
 
515 aa  276  6e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1782  flavocytochrome c  38.05 
 
 
515 aa  276  8e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2558  flavocytochrome c  35.32 
 
 
926 aa  274  4.0000000000000004e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  34.5 
 
 
510 aa  274  4.0000000000000004e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2381  NADH:flavin oxidoreductase/fumarate reductase, flavoprotein subunit, putative  33.44 
 
 
1005 aa  273  9e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  36.56 
 
 
589 aa  272  1e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  34.8 
 
 
457 aa  271  2e-71  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  37.58 
 
 
596 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  37.98 
 
 
596 aa  269  8.999999999999999e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  37.98 
 
 
596 aa  269  8.999999999999999e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  37.98 
 
 
596 aa  269  8.999999999999999e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  37.98 
 
 
596 aa  269  8.999999999999999e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  37.58 
 
 
596 aa  269  1e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  38.01 
 
 
596 aa  268  2e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2096  flavocytochrome c  37.01 
 
 
515 aa  268  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148795  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  37.77 
 
 
597 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  37.58 
 
 
596 aa  267  4e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0913  flavocytochrome c  36.07 
 
 
483 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.387235  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13640  flavocytochrome c  32.22 
 
 
650 aa  264  3e-69  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05539  oxidoreductase  32.25 
 
 
1004 aa  262  1e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  34.92 
 
 
464 aa  257  4e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  36.25 
 
 
593 aa  257  4e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  34.85 
 
 
596 aa  257  4e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  35.36 
 
 
583 aa  256  7e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  36.7 
 
 
589 aa  254  3e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  34.7 
 
 
598 aa  253  6e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  34.73 
 
 
589 aa  252  1e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  34.84 
 
 
598 aa  252  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  34.74 
 
 
519 aa  251  3e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  34.85 
 
 
596 aa  250  4e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0136  flavocytochrome c flavin subunit  34.58 
 
 
517 aa  250  5e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.584631  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  35.53 
 
 
517 aa  249  7e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  34.27 
 
 
504 aa  248  2e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  36.6 
 
 
465 aa  248  2e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  33.83 
 
 
596 aa  247  3e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  34.4 
 
 
596 aa  248  3e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  31.49 
 
 
637 aa  247  4.9999999999999997e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0049  fumarate reductase flavoprotein subunit  32.05 
 
 
616 aa  246  6e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00375543  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  35.16 
 
 
517 aa  244  3e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  33.53 
 
 
519 aa  244  3e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  34 
 
 
519 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2432  flavocytochrome c  34.26 
 
 
517 aa  239  1e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77876  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  37.69 
 
 
591 aa  239  1e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0270  flavocytochrome c flavin subunit  33.19 
 
 
511 aa  235  2.0000000000000002e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  33.18 
 
 
596 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13430  flavocytochrome c  31.44 
 
 
616 aa  229  9e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0002  flavocytochrome c flavin subunit  32.85 
 
 
518 aa  226  9e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000401985  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0139  radical SAM domain-containing protein  31.96 
 
 
511 aa  219  1e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2089  flavocytochrome c  33.86 
 
 
519 aa  218  2e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.455233  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2933  flavocytochrome c  31.34 
 
 
521 aa  218  2e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3301  flavocytochrome c flavin subunit  32.18 
 
 
499 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2084  flavocytochrome c  32.41 
 
 
520 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2230  flavocytochrome c  31.54 
 
 
506 aa  214  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2153  flavocytochrome c  31.54 
 
 
506 aa  213  1e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0615938 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0256  flavocytochrome c  30.96 
 
 
506 aa  210  7e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0273  flavocytochrome c  31.89 
 
 
506 aa  206  9e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000188956 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3536  flavocytochrome c  30.55 
 
 
506 aa  205  1e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1444  flavocytochrome c  33.06 
 
 
512 aa  205  2e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3939  flavocytochrome c  31.18 
 
 
506 aa  203  5e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0003  flavocytochrome c flavin subunit  30.51 
 
 
508 aa  202  9.999999999999999e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000666036  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51720  fumarate reductase flavoprotein  31.61 
 
 
668 aa  202  9.999999999999999e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.744935  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3897  flavocytochrome c  31.4 
 
 
506 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.513243  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1803  FAD binding domain-containing protein  31.28 
 
 
521 aa  201  3e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000300511  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0275  flavocytochrome c  30.75 
 
 
506 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000326146 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2511  flavocytochrome c  29.39 
 
 
507 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.842513  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3624  flavocytochrome c flavin subunit  30 
 
 
494 aa  188  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3960  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  31.28 
 
 
577 aa  188  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000052594  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4178  flavocytochrome c flavin subunit  29.85 
 
 
500 aa  188  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.630459 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52061  predicted protein  31.82 
 
 
587 aa  188  3e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27122  predicted protein  31.82 
 
 
587 aa  188  3e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0188056 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0340  flavocytochrome c  31.24 
 
 
500 aa  186  8e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0325  flavocytochrome c  30 
 
 
507 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2401  flavocytochrome c flavin subunit  28.04 
 
 
505 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0276  flavocytochrome c  29.94 
 
 
505 aa  180  7e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106606 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2534  flavocytochrome c  30.19 
 
 
506 aa  177  4e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.135835  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>