More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05539 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2381  NADH:flavin oxidoreductase/fumarate reductase, flavoprotein subunit, putative  60.86 
 
 		 1005 aa  1273    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  39 
 
 		 925 aa  636    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2625  flavocytochrome c  38.62 
 
 		 957 aa  639    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809387  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05539  oxidoreductase  100 
 
 		 1004 aa  2056    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2558  flavocytochrome c  37.79 
 
 		 926 aa  647    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3495  flavocytochrome c  39.36 
 
 		 925 aa  650    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0049  fumarate reductase flavoprotein subunit  55.27 
 
 		 616 aa  677    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00375543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0516  NADH:flavin oxidoreductase  42.31 
 
 		 372 aa  313  2e-83  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf867  NADH-dependent flavin oxidoreductase  43.6 
 
 		 367 aa  308  3e-82  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2008  NADH:flavin oxidoreductase  41.69 
 
 		 396 aa  298  3e-79  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  36.76 
 
 		 609 aa  296  2e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  34.9 
 
 		 599 aa  294  6e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1532  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.37 
 
 		 374 aa  286  2.0000000000000002e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  32.86 
 
 		 637 aa  285  3.0000000000000004e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  34.79 
 
 		 591 aa  281  6e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  33.44 
 
 		 597 aa  280  1e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2653  flavocytochrome c  32.91 
 
 		 631 aa  278  5e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.123058 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13640  flavocytochrome c  31.54 
 
 		 650 aa  276  1.0000000000000001e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  33.39 
 
 		 582 aa  271  5e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13430  flavocytochrome c  31.48 
 
 		 616 aa  270  1e-70  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4620  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  33.22 
 
 		 582 aa  268  4e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  31.75 
 
 		 584 aa  266  2e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  33.17 
 
 		 582 aa  264  6e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  36.99 
 
 		 598 aa  263  1e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  31.77 
 
 		 586 aa  259  2e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4193  flavocytochrome c  32.25 
 
 		 582 aa  259  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4325  flavocytochrome c  32.25 
 
 		 582 aa  259  2e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0493  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.18 
 
 		 368 aa  254  4.0000000000000004e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00242088  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  30.97 
 
 		 586 aa  253  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  31.49 
 
 		 608 aa  251  3e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1866  NADH:flavin oxidoreductase  40.53 
 
 		 389 aa  249  1e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.151913  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7286  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  38.2 
 
 		 384 aa  248  4e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.423648 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0107  flavocytochrome c  34.65 
 
 		 605 aa  243  1e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  34.44 
 
 		 593 aa  240  8e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  35.63 
 
 		 596 aa  239  2e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  35.63 
 
 		 596 aa  239  2e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  35.63 
 
 		 596 aa  239  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  35.63 
 
 		 596 aa  239  2e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  35.67 
 
 		 596 aa  238  4e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  35.09 
 
 		 596 aa  238  5.0000000000000005e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0837  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  37.26 
 
 		 377 aa  237  7e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  35.28 
 
 		 596 aa  237  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  35.16 
 
 		 597 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  32.9 
 
 		 589 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  35.09 
 
 		 596 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  33.46 
 
 		 596 aa  235  3e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0325  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  38.02 
 
 		 380 aa  234  5e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000687106  normal  0.103488 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  32.24 
 
 		 464 aa  234  5e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2284  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  36.44 
 
 		 384 aa  234  7.000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1861  flavocytochrome c  34.4 
 
 		 515 aa  233  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0345  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  37.57 
 
 		 380 aa  233  1e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0352016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1782  flavocytochrome c  33.87 
 
 		 515 aa  233  1e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0488  flavocytochrome c  32.68 
 
 		 606 aa  232  3e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.203471 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2096  flavocytochrome c  33.21 
 
 		 515 aa  230  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148795  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  33.07 
 
 		 583 aa  226  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0975  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  36.64 
 
 		 375 aa  224  8e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0956  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  36.64 
 
 		 375 aa  224  8e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  31.84 
 
 		 598 aa  223  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  33 
 
 		 596 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  32.62 
 
 		 591 aa  221  7e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  31.25 
 
 		 598 aa  220  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  32.87 
 
 		 596 aa  219  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  30.81 
 
 		 457 aa  218  4e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  32.21 
 
 		 596 aa  218  7e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  31.64 
 
 		 502 aa  217  8e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0542  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  36.99 
 
 		 375 aa  213  1e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  32.48 
 
 		 596 aa  213  1e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  33.06 
 
 		 504 aa  211  5e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10160  flavocytochrome c  36.25 
 
 		 603 aa  206  2e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  0.0211586 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  29.49 
 
 		 589 aa  195  5e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0233  NADH:flavin oxidoreductase  35.97 
 
 		 394 aa  191  4e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  32.61 
 
 		 588 aa  191  5e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  27.8 
 
 		 465 aa  186  1.0000000000000001e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0771  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  36.81 
 
 		 330 aa  186  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0157719 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0405  FMN-binding domain protein  28.13 
 
 		 626 aa  184  5.0000000000000004e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.07228 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0136  flavocytochrome c flavin subunit  28.84 
 
 		 517 aa  182  2.9999999999999997e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.584631  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1107  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.63 
 
 		 329 aa  181  5.999999999999999e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  29.07 
 
 		 589 aa  179  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2193  NADH oxidase  36.99 
 
 		 637 aa  179  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  29.28 
 
 		 517 aa  177  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0381  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.16 
 
 		 399 aa  176  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0370  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.16 
 
 		 399 aa  176  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2572  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.73 
 
 		 652 aa  176  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000750697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52061  predicted protein  35.2 
 
 		 587 aa  176  2.9999999999999996e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27122  predicted protein  35.2 
 
 		 587 aa  176  2.9999999999999996e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0188056 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1479  NADH:flavin oxidoreductase  34.89 
 
 		 650 aa  174  1e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  28.57 
 
 		 515 aa  171  9e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0574  FMN-binding domain protein  27.27 
 
 		 657 aa  170  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_10064  predicted protein  29 
 
 		 561 aa  169  2e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.14351 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0002  flavocytochrome c flavin subunit  27.07 
 
 		 518 aa  169  2.9999999999999998e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000401985  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0270  flavocytochrome c flavin subunit  27.44 
 
 		 511 aa  169  2.9999999999999998e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23180  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  29.23 
 
 		 550 aa  168  5e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0317036 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0945  Succinate dehydrogenase  29.46 
 
 		 511 aa  165  5.0000000000000005e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0139  radical SAM domain-containing protein  29 
 
 		 511 aa  164  6e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0482  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  30.57 
 
 		 491 aa  164  8.000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51720  fumarate reductase flavoprotein  27.5 
 
 		 668 aa  162  4e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.744935  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0968  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.03 
 
 		 644 aa  161  5e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.132179  normal  0.162387 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1061  oxidoreductase, FMN-binding  31.03 
 
 		 399 aa  160  9e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.777824  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2175  NADH oxidase  34.46 
 
 		 685 aa  160  9e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0369  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.53 
 
 		 662 aa  159  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.550194 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>