More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3536 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_0254  flavocytochrome c  92.62 
 
 		 367 aa  724    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0256  flavocytochrome c  93.86 
 
 		 506 aa  1001    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0273  flavocytochrome c  84.95 
 
 		 506 aa  910    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188956 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2153  flavocytochrome c  90.5 
 
 		 506 aa  974    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0615938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2230  flavocytochrome c  91.09 
 
 		 506 aa  979    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3897  flavocytochrome c  85.38 
 
 		 506 aa  884    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.513243  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0275  flavocytochrome c  83.53 
 
 		 506 aa  880    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000326146 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3939  flavocytochrome c  82.77 
 
 		 506 aa  877    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3536  flavocytochrome c  100 
 
 		 506 aa  1051    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4178  flavocytochrome c flavin subunit  55.24 
 
 		 500 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.630459 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3624  flavocytochrome c flavin subunit  56.62 
 
 		 494 aa  536  1e-151  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  47.7 
 
 		 517 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  47.16 
 
 		 519 aa  462  1e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  47.11 
 
 		 517 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  45.51 
 
 		 519 aa  450  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2432  flavocytochrome c  45.51 
 
 		 517 aa  442  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77876  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  44.49 
 
 		 519 aa  435  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1444  flavocytochrome c  44.55 
 
 		 512 aa  413  1e-114  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0325  flavocytochrome c  41.43 
 
 		 507 aa  397  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0299  flavocytochrome c  42.41 
 
 		 506 aa  393  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0588345 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1803  FAD binding domain-containing protein  42.36 
 
 		 521 aa  394  1e-108  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000300511  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0276  flavocytochrome c  42.08 
 
 		 505 aa  392  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106606 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1414  flavocytochrome c flavin subunit, putative  42.62 
 
 		 506 aa  391  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2534  flavocytochrome c  40.2 
 
 		 506 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.135835  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4184  flavocytochrome c  39.48 
 
 		 503 aa  380  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.159689 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0270  flavocytochrome c flavin subunit  42.22 
 
 		 511 aa  370  1e-101  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  39.45 
 
 		 510 aa  360  2e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0136  flavocytochrome c flavin subunit  39.26 
 
 		 517 aa  347  3e-94  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.584631  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  39.83 
 
 		 517 aa  346  5e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2084  flavocytochrome c  40.5 
 
 		 520 aa  338  9.999999999999999e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2089  flavocytochrome c  39.39 
 
 		 519 aa  338  9.999999999999999e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.455233  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0340  flavocytochrome c  39.04 
 
 		 500 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3301  flavocytochrome c flavin subunit  39.52 
 
 		 499 aa  336  5.999999999999999e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0139  radical SAM domain-containing protein  40 
 
 		 511 aa  333  3e-90  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2511  flavocytochrome c  39.05 
 
 		 507 aa  330  4e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.842513  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  38.01 
 
 		 515 aa  323  4e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2933  flavocytochrome c  35.91 
 
 		 521 aa  316  8e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0002  flavocytochrome c flavin subunit  35.8 
 
 		 518 aa  309  9e-83  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000401985  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0913  flavocytochrome c  36.19 
 
 		 483 aa  302  7.000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.387235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0003  flavocytochrome c flavin subunit  36.19 
 
 		 508 aa  295  1e-78  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000666036  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1548  flavocytochrome c flavin subunit  35.74 
 
 		 501 aa  263  4.999999999999999e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00203617  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0251  flavocytochrome c  94.07 
 
 		 161 aa  259  6e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2401  flavocytochrome c flavin subunit  32.05 
 
 		 505 aa  251  3e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  33.7 
 
 		 599 aa  233  8.000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1643  FAD binding domain-containing protein  33.14 
 
 		 491 aa  231  3e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  34.85 
 
 		 609 aa  223  7e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1861  flavocytochrome c  32.69 
 
 		 515 aa  220  5e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2096  flavocytochrome c  32.49 
 
 		 515 aa  219  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148795  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1782  flavocytochrome c  32.5 
 
 		 515 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  32.59 
 
 		 584 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  32.86 
 
 		 586 aa  209  7e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  31.78 
 
 		 582 aa  205  2e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4620  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  31.78 
 
 		 582 aa  201  3e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0488  flavocytochrome c  31.89 
 
 		 606 aa  201  3e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.203471 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0107  flavocytochrome c  31.15 
 
 		 605 aa  197  3e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  31.03 
 
 		 586 aa  194  3e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  32.77 
 
 		 598 aa  189  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  32.19 
 
 		 582 aa  189  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  35.15 
 
 		 596 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  35.15 
 
 		 596 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  35.15 
 
 		 596 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  35.15 
 
 		 596 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  32.88 
 
 		 597 aa  187  6e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  32.97 
 
 		 596 aa  186  8e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  34.17 
 
 		 596 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  32.76 
 
 		 596 aa  184  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10160  flavocytochrome c  31 
 
 		 603 aa  184  3e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  0.0211586 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  32.37 
 
 		 591 aa  183  8.000000000000001e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  32.76 
 
 		 596 aa  182  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4325  flavocytochrome c  30.55 
 
 		 582 aa  179  7e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4193  flavocytochrome c  30.55 
 
 		 582 aa  179  7e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  30.54 
 
 		 588 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1545  putative flavocytochrome c flavin subunit  27.31 
 
 		 447 aa  166  1.0000000000000001e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  29.71 
 
 		 457 aa  164  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  30.42 
 
 		 596 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  29.45 
 
 		 464 aa  164  4.0000000000000004e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  31.36 
 
 		 596 aa  160  6e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  30.88 
 
 		 608 aa  159  8e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13640  flavocytochrome c  27.5 
 
 		 650 aa  159  1e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  31.78 
 
 		 596 aa  158  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  29.66 
 
 		 502 aa  157  5.0000000000000005e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  32.35 
 
 		 593 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2653  flavocytochrome c  29.12 
 
 		 631 aa  156  7e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.123058 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  29.54 
 
 		 598 aa  156  8e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  30.89 
 
 		 596 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  29.22 
 
 		 589 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  29.06 
 
 		 598 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  30.91 
 
 		 583 aa  152  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  30.44 
 
 		 596 aa  151  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2625  flavocytochrome c  30.43 
 
 		 957 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809387  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  30.09 
 
 		 465 aa  149  1.0000000000000001e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  29.72 
 
 		 597 aa  147  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  30.89 
 
 		 925 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  28.88 
 
 		 589 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  28.21 
 
 		 504 aa  146  9e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_10064  predicted protein  29.85 
 
 		 561 aa  146  1e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.14351 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00140  fumarate reductase (NADH), putative  27.64 
 
 		 635 aa  145  2e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0434389  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13430  flavocytochrome c  29.46 
 
 		 616 aa  142  9.999999999999999e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  31.17 
 
 		 589 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3495  flavocytochrome c  30.75 
 
 		 925 aa  138  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>