More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1643 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1548  flavocytochrome c flavin subunit  72.29 
 
 
501 aa  704    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00203617  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1643  FAD binding domain-containing protein  100 
 
 
491 aa  992    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2401  flavocytochrome c flavin subunit  42.28 
 
 
505 aa  375  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1803  FAD binding domain-containing protein  41.09 
 
 
521 aa  354  2e-96  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000300511  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0270  flavocytochrome c flavin subunit  39.14 
 
 
511 aa  319  6e-86  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1444  flavocytochrome c  37.48 
 
 
512 aa  315  9e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0002  flavocytochrome c flavin subunit  38.13 
 
 
518 aa  313  4.999999999999999e-84  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000401985  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0003  flavocytochrome c flavin subunit  38.82 
 
 
508 aa  298  2e-79  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000666036  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1545  putative flavocytochrome c flavin subunit  36.03 
 
 
447 aa  276  4e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0136  flavocytochrome c flavin subunit  35.88 
 
 
517 aa  272  9e-72  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.584631  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0139  radical SAM domain-containing protein  34.62 
 
 
511 aa  271  2.9999999999999997e-71  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2084  flavocytochrome c  36.4 
 
 
520 aa  265  1e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2089  flavocytochrome c  35.98 
 
 
519 aa  262  1e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.455233  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  33.14 
 
 
519 aa  259  9e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  34.87 
 
 
517 aa  256  6e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2511  flavocytochrome c  33.73 
 
 
507 aa  256  7e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.842513  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  31.27 
 
 
519 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  33.97 
 
 
510 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  31.68 
 
 
519 aa  251  2e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2432  flavocytochrome c  32.4 
 
 
517 aa  248  2e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77876  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0275  flavocytochrome c  34.18 
 
 
506 aa  248  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000326146 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3939  flavocytochrome c  33.98 
 
 
506 aa  247  3e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3301  flavocytochrome c flavin subunit  33.67 
 
 
499 aa  246  6e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  31.8 
 
 
517 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0256  flavocytochrome c  33.2 
 
 
506 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2933  flavocytochrome c  33.97 
 
 
521 aa  244  1.9999999999999999e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2230  flavocytochrome c  34.18 
 
 
506 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  32.25 
 
 
515 aa  244  3e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0273  flavocytochrome c  32.42 
 
 
506 aa  243  5e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000188956 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3536  flavocytochrome c  33.14 
 
 
506 aa  241  2e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2153  flavocytochrome c  33.79 
 
 
506 aa  241  2e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0615938 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  32 
 
 
517 aa  241  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0340  flavocytochrome c  33.79 
 
 
500 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3897  flavocytochrome c  31.18 
 
 
506 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.513243  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0276  flavocytochrome c  31.12 
 
 
505 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106606 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0325  flavocytochrome c  31.7 
 
 
507 aa  217  4e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3624  flavocytochrome c flavin subunit  31.11 
 
 
494 aa  212  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1414  flavocytochrome c flavin subunit, putative  31.54 
 
 
506 aa  210  5e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4178  flavocytochrome c flavin subunit  29.35 
 
 
500 aa  208  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.630459 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0299  flavocytochrome c  31.95 
 
 
506 aa  208  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0588345 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4184  flavocytochrome c  29.74 
 
 
503 aa  207  5e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.159689 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2534  flavocytochrome c  32.16 
 
 
506 aa  207  5e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.135835  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0913  flavocytochrome c  29.85 
 
 
483 aa  194  3e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.387235  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  31.2 
 
 
597 aa  176  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0254  flavocytochrome c  32.98 
 
 
367 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  29.98 
 
 
591 aa  163  8.000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  30.29 
 
 
598 aa  160  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  31.32 
 
 
589 aa  155  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  28.88 
 
 
599 aa  150  4e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  29.5 
 
 
584 aa  150  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  28.67 
 
 
596 aa  150  5e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  27.84 
 
 
588 aa  150  6e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2096  flavocytochrome c  27.13 
 
 
515 aa  149  9e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148795  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1782  flavocytochrome c  27.47 
 
 
515 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1861  flavocytochrome c  27.47 
 
 
515 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  28.94 
 
 
596 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  29.29 
 
 
591 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  29.16 
 
 
596 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  27.87 
 
 
589 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  29.16 
 
 
596 aa  147  6e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  29.16 
 
 
596 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  28.94 
 
 
597 aa  145  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  26.69 
 
 
464 aa  145  2e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  28.01 
 
 
596 aa  145  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2625  flavocytochrome c  27.78 
 
 
957 aa  144  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809387  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  27.79 
 
 
596 aa  143  5e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  27.53 
 
 
925 aa  144  5e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  29.16 
 
 
596 aa  143  6e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  29.16 
 
 
596 aa  143  6e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  29.16 
 
 
596 aa  143  6e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  29.16 
 
 
596 aa  143  6e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  28.35 
 
 
609 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  27.35 
 
 
596 aa  140  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  28.8 
 
 
586 aa  141  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3495  flavocytochrome c  26.72 
 
 
925 aa  141  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  27.15 
 
 
598 aa  138  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  28.14 
 
 
583 aa  138  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  28.71 
 
 
582 aa  137  4e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  28.06 
 
 
582 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  27.08 
 
 
598 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  29.06 
 
 
586 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4620  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  28.06 
 
 
582 aa  133  6e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2558  flavocytochrome c  26.92 
 
 
926 aa  133  6e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  27.65 
 
 
502 aa  133  9e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4193  flavocytochrome c  27.66 
 
 
582 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4325  flavocytochrome c  27.66 
 
 
582 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  26.22 
 
 
465 aa  132  2.0000000000000002e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  26.78 
 
 
596 aa  131  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  27.12 
 
 
457 aa  130  7.000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13640  flavocytochrome c  26.1 
 
 
650 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  28.29 
 
 
608 aa  127  6e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0488  flavocytochrome c  27.03 
 
 
606 aa  126  8.000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.203471 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10160  flavocytochrome c  27.4 
 
 
603 aa  125  1e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  0.0211586 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  27.25 
 
 
593 aa  125  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  27.41 
 
 
504 aa  123  6e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0107  flavocytochrome c  27.65 
 
 
605 aa  123  6e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  27.05 
 
 
589 aa  123  8e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  24.84 
 
 
637 aa  122  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13430  flavocytochrome c  24.5 
 
 
616 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0801  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  26.58 
 
 
598 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>