More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1444 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1444  flavocytochrome c  100 
 
 
512 aa  1050    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1803  FAD binding domain-containing protein  56.89 
 
 
521 aa  611  1e-173  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000300511  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0270  flavocytochrome c flavin subunit  54.58 
 
 
511 aa  575  1.0000000000000001e-163  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0139  radical SAM domain-containing protein  52.55 
 
 
511 aa  549  1e-155  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0002  flavocytochrome c flavin subunit  51.64 
 
 
518 aa  540  9.999999999999999e-153  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000401985  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2084  flavocytochrome c  50.1 
 
 
520 aa  490  1e-137  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0003  flavocytochrome c flavin subunit  49.51 
 
 
508 aa  483  1e-135  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000666036  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2089  flavocytochrome c  49.42 
 
 
519 aa  477  1e-133  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.455233  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0136  flavocytochrome c flavin subunit  45.9 
 
 
517 aa  426  1e-118  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.584631  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  44.05 
 
 
519 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0275  flavocytochrome c  45.51 
 
 
506 aa  412  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000326146 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  44.23 
 
 
519 aa  414  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3939  flavocytochrome c  45.01 
 
 
506 aa  412  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3536  flavocytochrome c  44.55 
 
 
506 aa  413  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  44.27 
 
 
510 aa  411  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  42.38 
 
 
519 aa  409  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  42.8 
 
 
517 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2153  flavocytochrome c  44.75 
 
 
506 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0615938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2230  flavocytochrome c  44.55 
 
 
506 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0256  flavocytochrome c  43.77 
 
 
506 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0273  flavocytochrome c  43.64 
 
 
506 aa  402  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000188956 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  42.86 
 
 
517 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2432  flavocytochrome c  42.23 
 
 
517 aa  397  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77876  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  42.02 
 
 
517 aa  398  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3897  flavocytochrome c  43.66 
 
 
506 aa  391  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.513243  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  42.2 
 
 
515 aa  370  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3301  flavocytochrome c flavin subunit  42.55 
 
 
499 aa  366  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0340  flavocytochrome c  40.94 
 
 
500 aa  342  7e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4178  flavocytochrome c flavin subunit  38.67 
 
 
500 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.630459 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2511  flavocytochrome c  37.5 
 
 
507 aa  327  3e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.842513  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3624  flavocytochrome c flavin subunit  40.04 
 
 
494 aa  327  5e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2933  flavocytochrome c  38 
 
 
521 aa  325  1e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0276  flavocytochrome c  39.38 
 
 
505 aa  324  3e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106606 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0913  flavocytochrome c  38.17 
 
 
483 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.387235  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1548  flavocytochrome c flavin subunit  37.09 
 
 
501 aa  321  1.9999999999999998e-86  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00203617  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0325  flavocytochrome c  39.46 
 
 
507 aa  318  1e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1414  flavocytochrome c flavin subunit, putative  39.46 
 
 
506 aa  317  4e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2534  flavocytochrome c  40.04 
 
 
506 aa  316  5e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.135835  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2401  flavocytochrome c flavin subunit  35.62 
 
 
505 aa  315  8e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0299  flavocytochrome c  39.65 
 
 
506 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0588345 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4184  flavocytochrome c  38.83 
 
 
503 aa  311  2e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.159689 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1643  FAD binding domain-containing protein  37.48 
 
 
491 aa  304  3.0000000000000004e-81  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0254  flavocytochrome c  43.65 
 
 
367 aa  298  2e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1861  flavocytochrome c  35.7 
 
 
515 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1782  flavocytochrome c  35.91 
 
 
515 aa  229  7e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2096  flavocytochrome c  34.75 
 
 
515 aa  229  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148795  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  33.61 
 
 
599 aa  224  3e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  33.61 
 
 
584 aa  210  6e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  35 
 
 
596 aa  204  3e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  34.24 
 
 
609 aa  204  3e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  34.38 
 
 
596 aa  203  6e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  31.49 
 
 
588 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  33.96 
 
 
596 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  33.75 
 
 
596 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  33.68 
 
 
598 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  32.91 
 
 
582 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  34.32 
 
 
597 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1545  putative flavocytochrome c flavin subunit  30.02 
 
 
447 aa  197  5.000000000000001e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  33.4 
 
 
596 aa  196  9e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  33.4 
 
 
596 aa  196  9e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  33.4 
 
 
596 aa  196  9e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  33.4 
 
 
596 aa  196  9e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  33.68 
 
 
598 aa  196  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  33.47 
 
 
591 aa  194  4e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  32.22 
 
 
598 aa  193  6e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  33.47 
 
 
589 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  32.08 
 
 
596 aa  190  5e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0488  flavocytochrome c  33.33 
 
 
606 aa  190  5.999999999999999e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.203471 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  30.86 
 
 
586 aa  190  7e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  31.81 
 
 
596 aa  189  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10160  flavocytochrome c  33.33 
 
 
603 aa  187  3e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  0.0211586 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  31.29 
 
 
586 aa  187  5e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4620  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  32.14 
 
 
582 aa  186  6e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  32.16 
 
 
597 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  32.63 
 
 
582 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  31.88 
 
 
596 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  31.74 
 
 
464 aa  184  3e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  31.06 
 
 
589 aa  183  7e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  30.28 
 
 
596 aa  182  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  31.38 
 
 
457 aa  181  2e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  30.43 
 
 
596 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4193  flavocytochrome c  32.99 
 
 
582 aa  181  4e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4325  flavocytochrome c  32.99 
 
 
582 aa  181  4e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  31.15 
 
 
583 aa  179  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  33.81 
 
 
591 aa  178  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  30.83 
 
 
589 aa  174  5e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  31.2 
 
 
593 aa  174  5e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  32.56 
 
 
465 aa  172  1e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0107  flavocytochrome c  31.5 
 
 
605 aa  168  2e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13640  flavocytochrome c  28.82 
 
 
650 aa  167  4e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0264  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  46.59 
 
 
174 aa  166  8e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  31.29 
 
 
925 aa  160  4e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13430  flavocytochrome c  29.67 
 
 
616 aa  159  8e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  29.18 
 
 
502 aa  157  4e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  26.17 
 
 
637 aa  157  5.0000000000000005e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  30.65 
 
 
504 aa  156  7e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01543  hypothetical fumarate reductase (Eurofung)  30.52 
 
 
627 aa  155  1e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000554356  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2653  flavocytochrome c  29.62 
 
 
631 aa  155  1e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.123058 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3495  flavocytochrome c  31.3 
 
 
925 aa  155  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  29.87 
 
 
608 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>