More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0848 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  100 
 
 		 457 aa  936    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  63.88 
 
 		 464 aa  586  1e-166  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  50.91 
 
 		 502 aa  455  1e-127  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  49.67 
 
 		 465 aa  446  1.0000000000000001e-124  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  48.19 
 
 		 925 aa  390  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  46.31 
 
 		 589 aa  385  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2625  flavocytochrome c  47.15 
 
 		 957 aa  386  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809387  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3495  flavocytochrome c  47.32 
 
 		 925 aa  387  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2558  flavocytochrome c  45.77 
 
 		 926 aa  375  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  44.15 
 
 		 597 aa  377  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  44.3 
 
 		 591 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  44.68 
 
 		 598 aa  365  1e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  40.88 
 
 		 596 aa  355  8.999999999999999e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  44.73 
 
 		 504 aa  355  8.999999999999999e-97  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  40.9 
 
 		 589 aa  341  2e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  44 
 
 		 596 aa  340  4e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  39.82 
 
 		 598 aa  338  8e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  44 
 
 		 596 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  44.32 
 
 		 597 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  43.56 
 
 		 596 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  43.56 
 
 		 596 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  43.56 
 
 		 596 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  43.56 
 
 		 596 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  39.82 
 
 		 598 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  44 
 
 		 596 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  43.56 
 
 		 596 aa  335  1e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  38.74 
 
 		 588 aa  332  8e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  43.3 
 
 		 593 aa  332  1e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  38.86 
 
 		 608 aa  315  9e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  37.88 
 
 		 596 aa  306  7e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  36.95 
 
 		 596 aa  305  9.000000000000001e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  37.18 
 
 		 596 aa  301  2e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  37.61 
 
 		 589 aa  297  3e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  36.95 
 
 		 596 aa  295  1e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  37.05 
 
 		 599 aa  292  9e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  36.26 
 
 		 583 aa  288  1e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  36.84 
 
 		 584 aa  277  2e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  36.42 
 
 		 586 aa  266  7e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  35.46 
 
 		 586 aa  258  1e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  34.8 
 
 		 582 aa  257  4e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4620  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  34.8 
 
 		 582 aa  256  5e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  35.9 
 
 		 609 aa  249  8e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  34.48 
 
 		 582 aa  248  1e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4325  flavocytochrome c  34.8 
 
 		 582 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4193  flavocytochrome c  34.8 
 
 		 582 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51720  fumarate reductase flavoprotein  34.8 
 
 		 668 aa  240  4e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.744935  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00140  fumarate reductase (NADH), putative  35.11 
 
 		 635 aa  239  5.999999999999999e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0434389  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10160  flavocytochrome c  34.71 
 
 		 603 aa  236  4e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  0.0211586 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45689  fumarate reductase flavoprotein subunit  34.18 
 
 		 478 aa  236  5.0000000000000005e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  33.1 
 
 		 591 aa  225  1e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  32.46 
 
 		 637 aa  224  2e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  31.87 
 
 		 519 aa  224  3e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27122  predicted protein  34.05 
 
 		 587 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0188056 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52061  predicted protein  34.05 
 
 		 587 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0107  flavocytochrome c  33.49 
 
 		 605 aa  223  7e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10296  FAD dependent oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05070)  34.33 
 
 		 484 aa  220  5e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13640  flavocytochrome c  33.41 
 
 		 650 aa  219  8.999999999999998e-56  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  32.06 
 
 		 517 aa  217  4e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.803318 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01543  hypothetical fumarate reductase (Eurofung)  32.39 
 
 		 627 aa  214  2.9999999999999995e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000554356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  31.63 
 
 		 519 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2653  flavocytochrome c  33.57 
 
 		 631 aa  213  3.9999999999999995e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.123058 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  31.63 
 
 		 517 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0488  flavocytochrome c  31.53 
 
 		 606 aa  211  2e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.203471 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_10064  predicted protein  34.04 
 
 		 561 aa  211  3e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.14351 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13430  flavocytochrome c  32.65 
 
 		 616 aa  207  2e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2432  flavocytochrome c  31.41 
 
 		 517 aa  207  2e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77876  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  31.33 
 
 		 519 aa  204  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  31.68 
 
 		 517 aa  204  3e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0913  flavocytochrome c  33.12 
 
 		 483 aa  204  3e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.387235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05539  oxidoreductase  30.4 
 
 		 1004 aa  203  6e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  31.78 
 
 		 510 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2381  NADH:flavin oxidoreductase/fumarate reductase, flavoprotein subunit, putative  29.86 
 
 		 1005 aa  198  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1861  flavocytochrome c  32.9 
 
 		 515 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2096  flavocytochrome c  33.12 
 
 		 515 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148795  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53948  Osmotic growth protein  31.99 
 
 		 659 aa  198  2.0000000000000003e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.621591 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1782  flavocytochrome c  32.68 
 
 		 515 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2933  flavocytochrome c  30.32 
 
 		 521 aa  196  7e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0049  fumarate reductase flavoprotein subunit  31.83 
 
 		 616 aa  195  1e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00375543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  30.36 
 
 		 515 aa  191  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0340  flavocytochrome c  29.92 
 
 		 500 aa  190  4e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3301  flavocytochrome c flavin subunit  28.33 
 
 		 499 aa  186  7e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0270  flavocytochrome c flavin subunit  31.03 
 
 		 511 aa  185  1.0000000000000001e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3960  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  31 
 
 		 577 aa  182  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000052594  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1444  flavocytochrome c  31.38 
 
 		 512 aa  181  2e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4178  flavocytochrome c flavin subunit  31.29 
 
 		 500 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.630459 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0273  flavocytochrome c  31.59 
 
 		 506 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188956 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0136  flavocytochrome c flavin subunit  29.81 
 
 		 517 aa  174  3.9999999999999995e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.584631  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0002  flavocytochrome c flavin subunit  29.74 
 
 		 518 aa  170  4e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000401985  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0139  radical SAM domain-containing protein  30.06 
 
 		 511 aa  170  5e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2511  flavocytochrome c  29.49 
 
 		 507 aa  169  7e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.842513  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3453  succinate dehydrogenase  30.54 
 
 		 576 aa  169  9e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  29.86 
 
 		 470 aa  168  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3939  flavocytochrome c  30.06 
 
 		 506 aa  167  4e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0945  Succinate dehydrogenase  28.11 
 
 		 511 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3536  flavocytochrome c  29.71 
 
 		 506 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3897  flavocytochrome c  29.98 
 
 		 506 aa  164  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.513243  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  28.6 
 
 		 493 aa  164  4.0000000000000004e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000784469 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0275  flavocytochrome c  29.64 
 
 		 506 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000326146 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0256  flavocytochrome c  29.17 
 
 		 506 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0140  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  30.79 
 
 		 542 aa  162  1e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>