More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1445 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  100 
 
 		 493 aa  1009    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000784469 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  31.5 
 
 		 598 aa  192  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  31.5 
 
 		 598 aa  191  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  30.95 
 
 		 502 aa  190  4e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  30.09 
 
 		 596 aa  177  5e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  31.38 
 
 		 517 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  29.96 
 
 		 599 aa  172  9e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  29.81 
 
 		 597 aa  171  3e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3495  flavocytochrome c  30.26 
 
 		 925 aa  170  4e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  29.25 
 
 		 925 aa  169  8e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  31.21 
 
 		 591 aa  168  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  31.7 
 
 		 598 aa  167  4e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  29.84 
 
 		 464 aa  166  6.9999999999999995e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  30.67 
 
 		 589 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  28.45 
 
 		 457 aa  165  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  30.24 
 
 		 608 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  28.41 
 
 		 588 aa  162  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  28.6 
 
 		 519 aa  160  5e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  30.61 
 
 		 609 aa  159  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  29.65 
 
 		 584 aa  158  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  28.52 
 
 		 515 aa  157  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  28.4 
 
 		 517 aa  155  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  28.38 
 
 		 519 aa  156  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  27.74 
 
 		 589 aa  154  4e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2558  flavocytochrome c  28.79 
 
 		 926 aa  153  5.9999999999999996e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2625  flavocytochrome c  29.15 
 
 		 957 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809387  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  27.93 
 
 		 517 aa  152  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2432  flavocytochrome c  28.04 
 
 		 517 aa  152  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77876  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  26.54 
 
 		 465 aa  149  8e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  27.24 
 
 		 519 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  26.42 
 
 		 582 aa  146  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  27.93 
 
 		 596 aa  144  4e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  28.23 
 
 		 586 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  26.07 
 
 		 510 aa  141  3e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4620  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  26.22 
 
 		 582 aa  139  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1064  tricarballylate dehydrogenase  27.98 
 
 		 505 aa  139  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4325  flavocytochrome c  27.03 
 
 		 582 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  27.7 
 
 		 583 aa  139  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4193  flavocytochrome c  27.03 
 
 		 582 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0002  flavocytochrome c flavin subunit  26.55 
 
 		 518 aa  137  3.0000000000000003e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000401985  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  28.15 
 
 		 596 aa  137  4e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3133  tricarballylate dehydrogenase  27.69 
 
 		 524 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.262589  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  27.15 
 
 		 504 aa  136  8e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0275  flavocytochrome c  29.24 
 
 		 506 aa  136  9e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000326146 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0574  FMN-binding domain protein  26.21 
 
 		 657 aa  136  9e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2153  flavocytochrome c  28.4 
 
 		 506 aa  136  9e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0615938 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  27.47 
 
 		 586 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0270  flavocytochrome c flavin subunit  27.29 
 
 		 511 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  29.83 
 
 		 591 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04200  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  26.94 
 
 		 481 aa  135  1.9999999999999998e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.906237  normal  0.517886 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  27.7 
 
 		 596 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  26.18 
 
 		 582 aa  134  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2230  flavocytochrome c  28.04 
 
 		 506 aa  133  6e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1782  flavocytochrome c  30.44 
 
 		 515 aa  133  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1861  flavocytochrome c  30.21 
 
 		 515 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0256  flavocytochrome c  27.34 
 
 		 506 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0283  tricarballylate dehydrogenase  26.78 
 
 		 493 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  29.52 
 
 		 593 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0340  flavocytochrome c  27.25 
 
 		 500 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2834  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  27.62 
 
 		 488 aa  129  9.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  28.32 
 
 		 596 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  28.32 
 
 		 596 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  28.32 
 
 		 596 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  28.32 
 
 		 596 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1003  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.86 
 
 		 522 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0273  flavocytochrome c  27.85 
 
 		 506 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188956 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3939  flavocytochrome c  28.6 
 
 		 506 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1444  flavocytochrome c  26.73 
 
 		 512 aa  127  5e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0124  Succinate dehydrogenase  25.75 
 
 		 497 aa  126  7e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0945  Succinate dehydrogenase  28.17 
 
 		 511 aa  126  8.000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0200  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  30.03 
 
 		 488 aa  126  9e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0208  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.45 
 
 		 534 aa  126  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177  normal  0.616185 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  27.65 
 
 		 596 aa  125  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  28.1 
 
 		 596 aa  125  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  25.96 
 
 		 589 aa  125  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2096  flavocytochrome c  29.83 
 
 		 515 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148795  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1095  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.63 
 
 		 482 aa  125  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13640  flavocytochrome c  26.83 
 
 		 650 aa  125  2e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  27.65 
 
 		 596 aa  124  4e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2893  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.71 
 
 		 576 aa  123  7e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2653  flavocytochrome c  28.27 
 
 		 631 aa  123  7e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.123058 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0986  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.29 
 
 		 567 aa  123  7e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3301  flavocytochrome c flavin subunit  27.06 
 
 		 499 aa  123  8e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1580  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  26.25 
 
 		 550 aa  122  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0182  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.14 
 
 		 588 aa  122  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  27.43 
 
 		 597 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4662  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  25.89 
 
 		 563 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4750  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  25.89 
 
 		 563 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.309954  normal  0.275452 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5045  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  25.89 
 
 		 563 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3536  flavocytochrome c  27.88 
 
 		 506 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  27.43 
 
 		 596 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02608  conserved hypothetical protein  25.79 
 
 		 508 aa  120  4.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.262389 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  29.52 
 
 		 470 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0139  radical SAM domain-containing protein  27.24 
 
 		 511 aa  120  4.9999999999999996e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0913  flavocytochrome c  26.28 
 
 		 483 aa  120  6e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.387235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0687  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.84 
 
 		 503 aa  120  7e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1029  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.52 
 
 		 509 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0462  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.87 
 
 		 536 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  26.49 
 
 		 596 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0508  putative dehydrogenase flavoprotein  24.04 
 
 		 560 aa  118  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.890159  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>