More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_45689 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009044  PICST_45689  fumarate reductase flavoprotein subunit  100 
 
 		 478 aa  965    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10296  FAD dependent oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05070)  41.72 
 
 		 484 aa  314  2.9999999999999996e-84  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00140  fumarate reductase (NADH), putative  39.67 
 
 		 635 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0434389  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01543  hypothetical fumarate reductase (Eurofung)  41.53 
 
 		 627 aa  294  3e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000554356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27122  predicted protein  36.61 
 
 		 587 aa  278  2e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0188056 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52061  predicted protein  36.61 
 
 		 587 aa  278  2e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51720  fumarate reductase flavoprotein  36.65 
 
 		 668 aa  276  7e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.744935  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53948  Osmotic growth protein  38.35 
 
 		 659 aa  273  4.0000000000000004e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.621591 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_10064  predicted protein  36.92 
 
 		 561 aa  273  7e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.14351 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  34.18 
 
 		 457 aa  236  6e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  34.69 
 
 		 598 aa  228  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  34.26 
 
 		 464 aa  228  2e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  33.99 
 
 		 589 aa  212  1e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  32.63 
 
 		 598 aa  207  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  32.42 
 
 		 598 aa  207  4e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2625  flavocytochrome c  31.21 
 
 		 957 aa  204  4e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809387  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  30.11 
 
 		 597 aa  203  6e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  31.77 
 
 		 465 aa  202  8e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  32.15 
 
 		 596 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  31.6 
 
 		 588 aa  196  7e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  31.58 
 
 		 504 aa  193  5e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  31.78 
 
 		 502 aa  193  5e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  32.69 
 
 		 608 aa  193  6e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  33.12 
 
 		 589 aa  192  8e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  31.64 
 
 		 591 aa  190  4e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2558  flavocytochrome c  29.94 
 
 		 926 aa  187  3e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  33.89 
 
 		 925 aa  186  6e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3495  flavocytochrome c  33.12 
 
 		 925 aa  186  9e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  31.43 
 
 		 596 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  31.43 
 
 		 596 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  31.43 
 
 		 596 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  31.43 
 
 		 596 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  31.76 
 
 		 596 aa  180  4e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  30.53 
 
 		 593 aa  179  7e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  31.18 
 
 		 596 aa  179  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  31.32 
 
 		 596 aa  179  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  31.55 
 
 		 597 aa  178  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  31.21 
 
 		 596 aa  178  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  30.89 
 
 		 596 aa  176  7e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  29.34 
 
 		 599 aa  174  3.9999999999999995e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  31 
 
 		 583 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  30.87 
 
 		 596 aa  171  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  30.28 
 
 		 596 aa  168  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  30.26 
 
 		 596 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  28.1 
 
 		 589 aa  162  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  25.73 
 
 		 637 aa  141  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0913  flavocytochrome c  29.23 
 
 		 483 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.387235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13640  flavocytochrome c  27.31 
 
 		 650 aa  139  8.999999999999999e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  27.84 
 
 		 584 aa  139  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  29.23 
 
 		 609 aa  136  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2653  flavocytochrome c  28.42 
 
 		 631 aa  135  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.123058 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  26.97 
 
 		 586 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2773  L-aspartate oxidase  29.64 
 
 		 537 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05539  oxidoreductase  25.1 
 
 		 1004 aa  134  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2834  L-aspartate oxidase  27.8 
 
 		 540 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2968  L-aspartate oxidase  28 
 
 		 540 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2751  L-aspartate oxidase  27.8 
 
 		 539 aa  134  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.53736  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  27 
 
 		 586 aa  134  5e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2856  L-aspartate oxidase  27.8 
 
 		 540 aa  134  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151453  normal  0.187887 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  28.57 
 
 		 591 aa  133  6.999999999999999e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0488  flavocytochrome c  28.6 
 
 		 606 aa  133  6.999999999999999e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.203471 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  26.87 
 
 		 582 aa  133  7.999999999999999e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2852  L-aspartate oxidase  27.8 
 
 		 540 aa  133  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.184893  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3939  flavocytochrome c  27.81 
 
 		 506 aa  133  9e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2046  L-aspartate oxidase  28.23 
 
 		 550 aa  132  9e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  26.32 
 
 		 510 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1472  L-aspartate oxidase  29.29 
 
 		 533 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0002  flavocytochrome c flavin subunit  27.38 
 
 		 518 aa  130  5.0000000000000004e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000401985  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2936  L-aspartate oxidase  29.7 
 
 		 538 aa  130  6e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0270  flavocytochrome c flavin subunit  27.77 
 
 		 511 aa  129  1.0000000000000001e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1957  L-aspartate oxidase  27.99 
 
 		 546 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.422592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1030  L-aspartate oxidase  28.54 
 
 		 536 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0868483  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1271  L-aspartate oxidase  29.21 
 
 		 537 aa  128  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2862  L-aspartate oxidase  27.18 
 
 		 540 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0820367  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2728  L-aspartate oxidase  27.27 
 
 		 540 aa  127  5e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.100043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1236  L-aspartate oxidase  28.83 
 
 		 536 aa  127  5e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.305386  hitchhiker  0.0000186096 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13430  flavocytochrome c  26.72 
 
 		 616 aa  127  5e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2532  L-aspartate oxidase  28.34 
 
 		 538 aa  127  6e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0139  radical SAM domain-containing protein  25.69 
 
 		 511 aa  126  8.000000000000001e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03543  L-aspartate oxidase  28.69 
 
 		 559 aa  126  8.000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1152  L-aspartate oxidase  29.64 
 
 		 537 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.172404  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4620  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  26.23 
 
 		 582 aa  125  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1194  L-aspartate oxidase  29.21 
 
 		 537 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1238  L-aspartate oxidase  29.21 
 
 		 537 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  27.29 
 
 		 519 aa  125  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3119  L-aspartate oxidase  29.21 
 
 		 537 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0423808 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3033  L-aspartate oxidase  29.09 
 
 		 537 aa  125  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.625398  normal  0.389253 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0873  L-aspartate oxidase  28.4 
 
 		 535 aa  126  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1094  L-aspartate oxidase  26.98 
 
 		 540 aa  125  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.527185  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002490  L-aspartate oxidase  28.71 
 
 		 561 aa  125  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.79354  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2730  L-aspartate oxidase  26.77 
 
 		 540 aa  125  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.624821  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  27.39 
 
 		 515 aa  125  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2937  L-aspartate oxidase  28.89 
 
 		 537 aa  125  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.320984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0049  fumarate reductase flavoprotein subunit  27.6 
 
 		 616 aa  125  2e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00375543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0275  flavocytochrome c  27.8 
 
 		 506 aa  124  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000326146 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2096  flavocytochrome c  27.7 
 
 		 515 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148795  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1103  L-aspartate oxidase  26.77 
 
 		 540 aa  124  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.369167  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02468  L-aspartate oxidase  26.77 
 
 		 540 aa  124  5e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.757112  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02432  hypothetical protein  26.77 
 
 		 540 aa  124  5e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.874408  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2855  L-aspartate oxidase  28.69 
 
 		 537 aa  124  5e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.955955  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>