More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1226 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  100 
 
 		 502 aa  1013    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  51.14 
 
 		 925 aa  479  1e-134  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3495  flavocytochrome c  49.9 
 
 		 925 aa  463  1e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  50.33 
 
 		 464 aa  455  1e-127  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  50.91 
 
 		 457 aa  455  1e-127  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2558  flavocytochrome c  51.52 
 
 		 926 aa  455  1.0000000000000001e-126  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2625  flavocytochrome c  52.79 
 
 		 957 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809387  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  52.36 
 
 		 504 aa  428  1e-118  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  48.87 
 
 		 597 aa  419  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  44.15 
 
 		 465 aa  406  1.0000000000000001e-112  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  43.99 
 
 		 596 aa  402  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  45.33 
 
 		 598 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  47.3 
 
 		 589 aa  397  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  44.62 
 
 		 598 aa  393  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  44.89 
 
 		 598 aa  394  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  46.9 
 
 		 591 aa  394  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  43.71 
 
 		 608 aa  380  1e-104  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  41.7 
 
 		 588 aa  349  6e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  41.8 
 
 		 596 aa  348  2e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  42.92 
 
 		 597 aa  347  4e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  42.26 
 
 		 596 aa  345  2e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  41.34 
 
 		 596 aa  344  2e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  42.7 
 
 		 596 aa  344  2e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  42.47 
 
 		 596 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  42.26 
 
 		 583 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  42.47 
 
 		 596 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  42.7 
 
 		 596 aa  343  4e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  42.7 
 
 		 596 aa  343  4e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  42.7 
 
 		 596 aa  343  4e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  42.7 
 
 		 596 aa  343  4e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  41.57 
 
 		 596 aa  342  9e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  43.47 
 
 		 593 aa  342  1e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  41.8 
 
 		 596 aa  339  7e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  42.57 
 
 		 589 aa  333  4e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  39.56 
 
 		 599 aa  313  3.9999999999999997e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  38.52 
 
 		 609 aa  301  1e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  37.27 
 
 		 589 aa  289  6e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  37.55 
 
 		 586 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  37.3 
 
 		 584 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  36.27 
 
 		 586 aa  281  2e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  36.27 
 
 		 582 aa  273  7e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4620  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  36.07 
 
 		 582 aa  272  1e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  37.68 
 
 		 591 aa  269  8e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4325  flavocytochrome c  38.5 
 
 		 582 aa  266  8.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4193  flavocytochrome c  38.5 
 
 		 582 aa  266  8.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  35.74 
 
 		 582 aa  257  4e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  32.68 
 
 		 637 aa  248  3e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51720  fumarate reductase flavoprotein  33.55 
 
 		 668 aa  239  1e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.744935  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13430  flavocytochrome c  32.65 
 
 		 616 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10160  flavocytochrome c  35.94 
 
 		 603 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  0.0211586 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52061  predicted protein  33.26 
 
 		 587 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27122  predicted protein  33.26 
 
 		 587 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0188056 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13640  flavocytochrome c  35.23 
 
 		 650 aa  229  1e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10296  FAD dependent oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05070)  32.37 
 
 		 484 aa  227  4e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2653  flavocytochrome c  33.97 
 
 		 631 aa  226  7e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.123058 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01543  hypothetical fumarate reductase (Eurofung)  31.37 
 
 		 627 aa  223  4e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000554356  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00140  fumarate reductase (NADH), putative  30.84 
 
 		 635 aa  219  7e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0434389  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_10064  predicted protein  33.75 
 
 		 561 aa  219  7.999999999999999e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.14351 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1782  flavocytochrome c  35.33 
 
 		 515 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53948  Osmotic growth protein  31.42 
 
 		 659 aa  218  2e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.621591 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0107  flavocytochrome c  32.26 
 
 		 605 aa  218  2e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1861  flavocytochrome c  35.33 
 
 		 515 aa  216  5.9999999999999996e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  30.23 
 
 		 519 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2096  flavocytochrome c  34.48 
 
 		 515 aa  216  9e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148795  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  31.38 
 
 		 510 aa  209  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0049  fumarate reductase flavoprotein subunit  31.88 
 
 		 616 aa  209  1e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00375543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  31.97 
 
 		 517 aa  207  4e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2381  NADH:flavin oxidoreductase/fumarate reductase, flavoprotein subunit, putative  32.14 
 
 		 1005 aa  207  5e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  29.03 
 
 		 519 aa  205  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0488  flavocytochrome c  30.97 
 
 		 606 aa  204  3e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.203471 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2432  flavocytochrome c  28.3 
 
 		 517 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77876  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  30.89 
 
 		 519 aa  201  3e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05539  oxidoreductase  31.64 
 
 		 1004 aa  200  6e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  29.45 
 
 		 517 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  31.35 
 
 		 515 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  30.25 
 
 		 517 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45689  fumarate reductase flavoprotein subunit  31.78 
 
 		 478 aa  193  5e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0136  flavocytochrome c flavin subunit  31.41 
 
 		 517 aa  193  5e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.584631  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3301  flavocytochrome c flavin subunit  29.18 
 
 		 499 aa  192  9e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0270  flavocytochrome c flavin subunit  31.71 
 
 		 511 aa  191  2e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3960  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  33.57 
 
 		 577 aa  190  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000052594  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0340  flavocytochrome c  29.46 
 
 		 500 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  31.18 
 
 		 493 aa  189  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000784469 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0913  flavocytochrome c  29.98 
 
 		 483 aa  188  2e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.387235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1095  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.18 
 
 		 482 aa  186  9e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2401  flavocytochrome c flavin subunit  29.54 
 
 		 505 aa  177  3e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  29.49 
 
 		 470 aa  177  5e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0275  flavocytochrome c  32.18 
 
 		 506 aa  170  5e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000326146 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0140  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  30.4 
 
 		 542 aa  168  2e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4178  flavocytochrome c flavin subunit  30.04 
 
 		 500 aa  168  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.630459 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3624  flavocytochrome c flavin subunit  29.87 
 
 		 494 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0273  flavocytochrome c  30.3 
 
 		 506 aa  166  8e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188956 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3453  succinate dehydrogenase  28.91 
 
 		 576 aa  166  9e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1037  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  28.31 
 
 		 463 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.192722  normal  0.0849595 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0945  Succinate dehydrogenase  28.72 
 
 		 511 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0795  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.67 
 
 		 509 aa  164  3e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.820864  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3939  flavocytochrome c  31.39 
 
 		 506 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3252  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.83 
 
 		 523 aa  161  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.556116  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3181  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.45 
 
 		 523 aa  161  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.357921  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2933  flavocytochrome c  28.89 
 
 		 521 aa  159  9e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>