More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3960 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3960  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  100 
 
 		 577 aa  1164    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000052594  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  35.56 
 
 		 597 aa  282  1e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  32.03 
 
 		 608 aa  241  2.9999999999999997e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  33.95 
 
 		 588 aa  239  1e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  36.14 
 
 		 609 aa  238  2e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  37.95 
 
 		 598 aa  236  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  33.67 
 
 		 591 aa  235  2.0000000000000002e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10160  flavocytochrome c  36.05 
 
 		 603 aa  230  4e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  0.0211586 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  32.13 
 
 		 599 aa  229  2e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  35.71 
 
 		 589 aa  228  3e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  37.61 
 
 		 596 aa  216  8e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  37.61 
 
 		 596 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  35.14 
 
 		 502 aa  215  1.9999999999999998e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  37.39 
 
 		 596 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  37.47 
 
 		 596 aa  213  9e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  37.47 
 
 		 596 aa  213  9e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  37.47 
 
 		 596 aa  213  9e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  37.47 
 
 		 596 aa  213  9e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  37.03 
 
 		 596 aa  211  4e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  34.59 
 
 		 465 aa  209  8e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0107  flavocytochrome c  35.26 
 
 		 605 aa  208  2e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13640  flavocytochrome c  31.49 
 
 		 650 aa  207  3e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  35.95 
 
 		 593 aa  207  4e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  32.52 
 
 		 464 aa  204  4e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  35.84 
 
 		 597 aa  204  4e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  32.51 
 
 		 596 aa  204  5e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0488  flavocytochrome c  36.39 
 
 		 606 aa  203  7e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.203471 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  34.02 
 
 		 583 aa  200  6e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  31.76 
 
 		 457 aa  200  7e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  34.74 
 
 		 598 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  34.53 
 
 		 598 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  35.09 
 
 		 596 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  33.87 
 
 		 596 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  32.88 
 
 		 596 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  33.26 
 
 		 596 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  29.38 
 
 		 582 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  35.2 
 
 		 589 aa  195  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  35.04 
 
 		 589 aa  195  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  36.48 
 
 		 591 aa  194  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4620  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  30.02 
 
 		 582 aa  193  6e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2653  flavocytochrome c  32.02 
 
 		 631 aa  193  8e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.123058 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  30.32 
 
 		 637 aa  189  1e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  33.56 
 
 		 504 aa  187  5e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  31.05 
 
 		 582 aa  186  8e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4325  flavocytochrome c  31.28 
 
 		 582 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4193  flavocytochrome c  31.28 
 
 		 582 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  29.94 
 
 		 925 aa  184  5.0000000000000004e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  30.22 
 
 		 584 aa  183  9.000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  30.76 
 
 		 586 aa  178  3e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3495  flavocytochrome c  29.96 
 
 		 925 aa  174  5e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  31.46 
 
 		 586 aa  172  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2558  flavocytochrome c  28.78 
 
 		 926 aa  169  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0086  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  31.85 
 
 		 515 aa  167  2.9999999999999998e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0208  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  31.11 
 
 		 534 aa  167  6.9999999999999995e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177  normal  0.616185 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0405  FMN-binding domain protein  27.84 
 
 		 626 aa  165  2.0000000000000002e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.07228 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2625  flavocytochrome c  32.37 
 
 		 957 aa  164  3e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809387  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13430  flavocytochrome c  30.18 
 
 		 616 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5210  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  31.46 
 
 		 517 aa  157  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247495 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0049  fumarate reductase flavoprotein subunit  31.49 
 
 		 616 aa  153  7e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00375543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1782  flavocytochrome c  31.01 
 
 		 515 aa  150  6e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2096  flavocytochrome c  30.6 
 
 		 515 aa  150  7e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148795  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1861  flavocytochrome c  30.8 
 
 		 515 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  29.67 
 
 		 470 aa  144  4e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05539  oxidoreductase  29.6 
 
 		 1004 aa  143  8e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1003  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.84 
 
 		 522 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  29.96 
 
 		 517 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3768  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  28.67 
 
 		 460 aa  140  6e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.48 
 
 		 519 aa  140  6e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0482  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  30.86 
 
 		 491 aa  140  7e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0626  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.96 
 
 		 562 aa  138  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.770057 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1095  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.15 
 
 		 482 aa  139  2e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2381  NADH:flavin oxidoreductase/fumarate reductase, flavoprotein subunit, putative  33.8 
 
 		 1005 aa  138  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2865  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  33.33 
 
 		 513 aa  136  8e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417281  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4658  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.58 
 
 		 492 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0945  Succinate dehydrogenase  27.57 
 
 		 511 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22640  aspartate oxidase  27.01 
 
 		 623 aa  134  6.999999999999999e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.73746 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0574  FMN-binding domain protein  26.69 
 
 		 657 aa  133  7.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0913  flavocytochrome c  30.39 
 
 		 483 aa  133  9e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.387235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24770  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  28.19 
 
 		 658 aa  132  2.0000000000000002e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0682  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.02 
 
 		 640 aa  131  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000305666  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1547  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  29.73 
 
 		 530 aa  130  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04200  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  28.15 
 
 		 481 aa  128  2.0000000000000002e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.906237  normal  0.517886 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02520  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  29.66 
 
 		 527 aa  127  5e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.152988  normal  0.211132 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2796  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.11 
 
 		 578 aa  127  8.000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000175303 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00140  fumarate reductase (NADH), putative  27.88 
 
 		 635 aa  126  1e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0434389  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0124  Succinate dehydrogenase  29.25 
 
 		 497 aa  125  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0287  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  31.45 
 
 		 514 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205707  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51720  fumarate reductase flavoprotein  26.95 
 
 		 668 aa  125  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.744935  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0297  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  31.45 
 
 		 514 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.374229 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0278  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  31.45 
 
 		 514 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.198959  normal  0.93633 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1029  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.83 
 
 		 509 aa  125  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1037  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  29.98 
 
 		 463 aa  125  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.192722  normal  0.0849595 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0795  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.98 
 
 		 509 aa  125  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.820864  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0687  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.87 
 
 		 503 aa  123  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  27.23 
 
 		 519 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3501  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.18 
 
 		 510 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116635  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  25.79 
 
 		 515 aa  121  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1659  hypothetical protein  32.1 
 
 		 493 aa  121  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.224804  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_10064  predicted protein  27.33 
 
 		 561 aa  121  3e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.14351 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2354  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.75 
 
 		 551 aa  120  6e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>