More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0488 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0488  flavocytochrome c  100 
 
 
606 aa  1235    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.203471 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0107  flavocytochrome c  59.9 
 
 
605 aa  688    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10160  flavocytochrome c  61.75 
 
 
603 aa  699    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  0.0211586 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  47.28 
 
 
609 aa  489  1e-137  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  45.63 
 
 
591 aa  414  1e-114  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  41.39 
 
 
584 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  40.3 
 
 
599 aa  405  1e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4620  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  42.16 
 
 
582 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  42.34 
 
 
582 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4325  flavocytochrome c  42.52 
 
 
582 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4193  flavocytochrome c  42.52 
 
 
582 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  43.6 
 
 
582 aa  395  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  42.73 
 
 
586 aa  390  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  40.46 
 
 
586 aa  385  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2653  flavocytochrome c  36.87 
 
 
631 aa  316  7e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.123058 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  42.44 
 
 
598 aa  314  2.9999999999999996e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  34.8 
 
 
608 aa  312  1e-83  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13640  flavocytochrome c  34.84 
 
 
650 aa  288  1e-76  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  34.62 
 
 
597 aa  277  5e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  34.41 
 
 
637 aa  275  2.0000000000000002e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  38.19 
 
 
589 aa  265  2e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13430  flavocytochrome c  33.87 
 
 
616 aa  263  4.999999999999999e-69  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  35.99 
 
 
598 aa  261  4e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  35.99 
 
 
598 aa  259  1e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  35.92 
 
 
517 aa  252  1e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  36.13 
 
 
517 aa  252  1e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  34.27 
 
 
925 aa  251  2e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05539  oxidoreductase  32.47 
 
 
1004 aa  251  2e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  36.64 
 
 
591 aa  251  3e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  35.12 
 
 
596 aa  250  6e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2381  NADH:flavin oxidoreductase/fumarate reductase, flavoprotein subunit, putative  31.68 
 
 
1005 aa  248  2e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  36.01 
 
 
588 aa  248  2e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  34.84 
 
 
517 aa  246  8e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3495  flavocytochrome c  34.35 
 
 
925 aa  245  9.999999999999999e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2432  flavocytochrome c  34.81 
 
 
517 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77876  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  32.13 
 
 
515 aa  241  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  35.96 
 
 
504 aa  241  2.9999999999999997e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  33.91 
 
 
519 aa  240  5e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0049  fumarate reductase flavoprotein subunit  33.65 
 
 
616 aa  240  5.999999999999999e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00375543  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  37.53 
 
 
596 aa  238  2e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  32.26 
 
 
457 aa  237  4e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  34.23 
 
 
589 aa  237  6e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  32.25 
 
 
502 aa  236  7e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  35.81 
 
 
596 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0270  flavocytochrome c flavin subunit  33.52 
 
 
511 aa  233  5e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  37.53 
 
 
596 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  37.09 
 
 
596 aa  232  1e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  37.31 
 
 
596 aa  233  1e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  33.69 
 
 
519 aa  233  1e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  36.05 
 
 
596 aa  231  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  31.64 
 
 
510 aa  230  5e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  35.83 
 
 
583 aa  230  7e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1782  flavocytochrome c  35.97 
 
 
515 aa  230  7e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  35.14 
 
 
596 aa  229  9e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  35.83 
 
 
596 aa  229  1e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1861  flavocytochrome c  35.97 
 
 
515 aa  229  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  35.79 
 
 
596 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  35.79 
 
 
596 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  35.79 
 
 
596 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  34.68 
 
 
593 aa  228  2e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  35.79 
 
 
596 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2096  flavocytochrome c  34.33 
 
 
515 aa  228  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148795  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  33.26 
 
 
464 aa  227  4e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  33.68 
 
 
519 aa  227  5.0000000000000005e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  36.44 
 
 
597 aa  226  8e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2558  flavocytochrome c  33.1 
 
 
926 aa  224  3e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3960  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  36.93 
 
 
577 aa  222  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000052594  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1444  flavocytochrome c  34.99 
 
 
512 aa  220  5e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3536  flavocytochrome c  32.5 
 
 
506 aa  219  1e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2625  flavocytochrome c  33.27 
 
 
957 aa  219  2e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809387  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0256  flavocytochrome c  31.87 
 
 
506 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2230  flavocytochrome c  32.48 
 
 
506 aa  216  9e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  33.55 
 
 
589 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2153  flavocytochrome c  32.69 
 
 
506 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0615938 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  33.12 
 
 
465 aa  215  1.9999999999999998e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1803  FAD binding domain-containing protein  33.82 
 
 
521 aa  211  4e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000300511  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0002  flavocytochrome c flavin subunit  33.82 
 
 
518 aa  210  8e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000401985  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0275  flavocytochrome c  31.48 
 
 
506 aa  209  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000326146 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0136  flavocytochrome c flavin subunit  31.44 
 
 
517 aa  209  1e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.584631  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3939  flavocytochrome c  31.67 
 
 
506 aa  209  1e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0003  flavocytochrome c flavin subunit  32.21 
 
 
508 aa  207  6e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000666036  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3897  flavocytochrome c  30.84 
 
 
506 aa  204  3e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.513243  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2933  flavocytochrome c  32.42 
 
 
521 aa  202  9.999999999999999e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2089  flavocytochrome c  33.26 
 
 
519 aa  201  5e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.455233  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0913  flavocytochrome c  31.76 
 
 
483 aa  198  3e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.387235  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0273  flavocytochrome c  30.42 
 
 
506 aa  196  9e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000188956 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3301  flavocytochrome c flavin subunit  31.81 
 
 
499 aa  195  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0139  radical SAM domain-containing protein  32.42 
 
 
511 aa  188  3e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0340  flavocytochrome c  30.41 
 
 
500 aa  187  6e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2401  flavocytochrome c flavin subunit  31.38 
 
 
505 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2511  flavocytochrome c  30.09 
 
 
507 aa  178  3e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.842513  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2084  flavocytochrome c  32.43 
 
 
520 aa  177  4e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2534  flavocytochrome c  31.13 
 
 
506 aa  170  9e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.135835  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27122  predicted protein  30.4 
 
 
587 aa  169  9e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0188056 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52061  predicted protein  30.4 
 
 
587 aa  169  9e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1414  flavocytochrome c flavin subunit, putative  30.92 
 
 
506 aa  169  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0299  flavocytochrome c  30.98 
 
 
506 aa  168  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0588345 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4178  flavocytochrome c flavin subunit  29.53 
 
 
500 aa  168  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.630459 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0276  flavocytochrome c  30.9 
 
 
505 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106606 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1003  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.47 
 
 
522 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>