More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3768 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  100 
 
 
515 aa  1063    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  52.92 
 
 
517 aa  561  1e-158  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  44.98 
 
 
510 aa  448  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  43.97 
 
 
519 aa  404  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2933  flavocytochrome c  41.95 
 
 
521 aa  392  1e-108  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  42.11 
 
 
519 aa  389  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  42.33 
 
 
517 aa  384  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  40.88 
 
 
519 aa  384  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  41.94 
 
 
517 aa  380  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0913  flavocytochrome c  41.68 
 
 
483 aa  373  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.387235  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2432  flavocytochrome c  42.08 
 
 
517 aa  373  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77876  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1444  flavocytochrome c  42.2 
 
 
512 aa  370  1e-101  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2089  flavocytochrome c  42.31 
 
 
519 aa  355  1e-96  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.455233  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0270  flavocytochrome c flavin subunit  39.88 
 
 
511 aa  355  1e-96  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0002  flavocytochrome c flavin subunit  39.55 
 
 
518 aa  355  1e-96  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000401985  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1803  FAD binding domain-containing protein  40.6 
 
 
521 aa  350  3e-95  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000300511  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0139  radical SAM domain-containing protein  38.85 
 
 
511 aa  337  3.9999999999999995e-91  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0136  flavocytochrome c flavin subunit  37.4 
 
 
517 aa  336  7.999999999999999e-91  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.584631  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2084  flavocytochrome c  40.53 
 
 
520 aa  324  3e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0256  flavocytochrome c  37.48 
 
 
506 aa  323  4e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3536  flavocytochrome c  38.01 
 
 
506 aa  323  4e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2230  flavocytochrome c  37.28 
 
 
506 aa  323  5e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0273  flavocytochrome c  39.96 
 
 
506 aa  323  6e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000188956 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2153  flavocytochrome c  37.09 
 
 
506 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0615938 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0275  flavocytochrome c  40.26 
 
 
506 aa  317  4e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000326146 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3939  flavocytochrome c  39.2 
 
 
506 aa  312  1e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4178  flavocytochrome c flavin subunit  36.86 
 
 
500 aa  311  2e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.630459 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0003  flavocytochrome c flavin subunit  37.9 
 
 
508 aa  306  6e-82  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000666036  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3301  flavocytochrome c flavin subunit  40.13 
 
 
499 aa  300  5e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3624  flavocytochrome c flavin subunit  37.89 
 
 
494 aa  294  2e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3897  flavocytochrome c  36.71 
 
 
506 aa  294  2e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.513243  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2511  flavocytochrome c  35.45 
 
 
507 aa  293  4e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.842513  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0325  flavocytochrome c  37.07 
 
 
507 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2534  flavocytochrome c  38.16 
 
 
506 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.135835  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0340  flavocytochrome c  36.69 
 
 
500 aa  280  5e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0276  flavocytochrome c  37.66 
 
 
505 aa  280  6e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106606 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1414  flavocytochrome c flavin subunit, putative  36.83 
 
 
506 aa  270  4e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0299  flavocytochrome c  36.19 
 
 
506 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0588345 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4184  flavocytochrome c  35.29 
 
 
503 aa  267  4e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.159689 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4620  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  36.13 
 
 
582 aa  264  2e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  35.93 
 
 
582 aa  265  2e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1861  flavocytochrome c  37.19 
 
 
515 aa  264  4e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1782  flavocytochrome c  36.99 
 
 
515 aa  262  1e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2096  flavocytochrome c  36.54 
 
 
515 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148795  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  37.6 
 
 
582 aa  259  9e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2401  flavocytochrome c flavin subunit  33.33 
 
 
505 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  35.06 
 
 
584 aa  251  3e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4193  flavocytochrome c  36.71 
 
 
582 aa  249  7e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4325  flavocytochrome c  36.71 
 
 
582 aa  249  7e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  32.49 
 
 
586 aa  243  7e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  35.2 
 
 
609 aa  236  5.0000000000000005e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1548  flavocytochrome c flavin subunit  32.24 
 
 
501 aa  234  2.0000000000000002e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00203617  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  32.16 
 
 
586 aa  234  3e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1643  FAD binding domain-containing protein  32.05 
 
 
491 aa  233  4.0000000000000004e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0254  flavocytochrome c  35.9 
 
 
367 aa  233  6e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  33.55 
 
 
588 aa  233  9e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  33.48 
 
 
599 aa  229  1e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  35.34 
 
 
596 aa  224  3e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  34.86 
 
 
596 aa  223  8e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  35.49 
 
 
596 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  34.63 
 
 
598 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  35.07 
 
 
596 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  35.49 
 
 
596 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  35.49 
 
 
596 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  35.49 
 
 
596 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  34.86 
 
 
596 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  35.14 
 
 
597 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10160  flavocytochrome c  33.08 
 
 
603 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  0.0211586 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  33.86 
 
 
591 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  34.33 
 
 
593 aa  211  2e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  33.12 
 
 
589 aa  208  2e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0488  flavocytochrome c  31.92 
 
 
606 aa  207  3e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.203471 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  34.79 
 
 
589 aa  207  4e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  32.9 
 
 
598 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  32.66 
 
 
596 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  31.35 
 
 
502 aa  197  4.0000000000000005e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  36.13 
 
 
589 aa  195  1e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  33.12 
 
 
597 aa  194  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  32.47 
 
 
598 aa  194  3e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  32.5 
 
 
596 aa  194  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  33.26 
 
 
591 aa  194  4e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  31.32 
 
 
596 aa  191  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0107  flavocytochrome c  30.15 
 
 
605 aa  191  2.9999999999999997e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  32.14 
 
 
583 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  30.36 
 
 
457 aa  191  2.9999999999999997e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  31.3 
 
 
464 aa  189  1e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3495  flavocytochrome c  33.06 
 
 
925 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2558  flavocytochrome c  31.53 
 
 
926 aa  184  3e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  31.1 
 
 
596 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  32.9 
 
 
925 aa  182  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  30.84 
 
 
608 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  32.33 
 
 
465 aa  180  7e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2625  flavocytochrome c  32.31 
 
 
957 aa  179  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809387  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  30.96 
 
 
596 aa  176  8e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2381  NADH:flavin oxidoreductase/fumarate reductase, flavoprotein subunit, putative  28.63 
 
 
1005 aa  172  1e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13640  flavocytochrome c  29.15 
 
 
650 aa  171  3e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  29.33 
 
 
637 aa  169  2e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1545  putative flavocytochrome c flavin subunit  26.08 
 
 
447 aa  159  9e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  29.78 
 
 
504 aa  159  2e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2653  flavocytochrome c  29.77 
 
 
631 aa  157  6e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.123058 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>