More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0943 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  100 
 
 
517 aa  1071    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  53.5 
 
 
515 aa  568  1e-161  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  48.43 
 
 
510 aa  488  1e-136  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  44.05 
 
 
519 aa  420  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  42.1 
 
 
519 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2432  flavocytochrome c  42.94 
 
 
517 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77876  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  43.42 
 
 
517 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0270  flavocytochrome c flavin subunit  43.62 
 
 
511 aa  407  1.0000000000000001e-112  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2933  flavocytochrome c  42.02 
 
 
521 aa  403  1e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1444  flavocytochrome c  42.86 
 
 
512 aa  404  1e-111  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  43.08 
 
 
519 aa  404  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  42.52 
 
 
517 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1803  FAD binding domain-containing protein  42.37 
 
 
521 aa  389  1e-107  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000300511  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0139  radical SAM domain-containing protein  42.97 
 
 
511 aa  382  1e-104  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2089  flavocytochrome c  44.23 
 
 
519 aa  380  1e-104  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.455233  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0913  flavocytochrome c  41.49 
 
 
483 aa  374  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.387235  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0002  flavocytochrome c flavin subunit  40.3 
 
 
518 aa  366  1e-100  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000401985  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0003  flavocytochrome c flavin subunit  41.92 
 
 
508 aa  360  2e-98  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000666036  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0136  flavocytochrome c flavin subunit  39.31 
 
 
517 aa  360  5e-98  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.584631  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2084  flavocytochrome c  42.26 
 
 
520 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3536  flavocytochrome c  39.38 
 
 
506 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2230  flavocytochrome c  39.88 
 
 
506 aa  353  5e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0256  flavocytochrome c  39.11 
 
 
506 aa  352  8e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2153  flavocytochrome c  40.51 
 
 
506 aa  352  1e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0615938 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0275  flavocytochrome c  40.99 
 
 
506 aa  350  3e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000326146 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0273  flavocytochrome c  39.96 
 
 
506 aa  348  2e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000188956 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0325  flavocytochrome c  40.55 
 
 
507 aa  341  1e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3897  flavocytochrome c  38.76 
 
 
506 aa  342  1e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.513243  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3939  flavocytochrome c  39.91 
 
 
506 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2511  flavocytochrome c  37.85 
 
 
507 aa  339  8e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.842513  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3301  flavocytochrome c flavin subunit  39.42 
 
 
499 aa  332  8e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4178  flavocytochrome c flavin subunit  38.63 
 
 
500 aa  332  1e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.630459 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0340  flavocytochrome c  37.74 
 
 
500 aa  332  1e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3624  flavocytochrome c flavin subunit  41.03 
 
 
494 aa  329  7e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0276  flavocytochrome c  37.3 
 
 
505 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106606 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1414  flavocytochrome c flavin subunit, putative  39.15 
 
 
506 aa  327  3e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4184  flavocytochrome c  38.4 
 
 
503 aa  327  3e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.159689 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2534  flavocytochrome c  38.72 
 
 
506 aa  323  6e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.135835  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0299  flavocytochrome c  38.94 
 
 
506 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0588345 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1861  flavocytochrome c  39.2 
 
 
515 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1782  flavocytochrome c  39.5 
 
 
515 aa  287  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2096  flavocytochrome c  38.55 
 
 
515 aa  284  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148795  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  38.04 
 
 
609 aa  278  2e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  36.15 
 
 
582 aa  276  7e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  35.36 
 
 
584 aa  276  7e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4620  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  35.95 
 
 
582 aa  272  1e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  37.67 
 
 
591 aa  270  5e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  35.26 
 
 
599 aa  267  4e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  36.67 
 
 
586 aa  266  5e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  35.87 
 
 
586 aa  262  1e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2401  flavocytochrome c flavin subunit  35.33 
 
 
505 aa  261  3e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0254  flavocytochrome c  38.57 
 
 
367 aa  259  9e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  37.95 
 
 
598 aa  259  1e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  36.15 
 
 
582 aa  258  2e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4193  flavocytochrome c  35.36 
 
 
582 aa  257  3e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4325  flavocytochrome c  35.36 
 
 
582 aa  257  3e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  37.93 
 
 
596 aa  256  8e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  37.5 
 
 
597 aa  254  3e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  37.28 
 
 
596 aa  253  8.000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1548  flavocytochrome c flavin subunit  34.81 
 
 
501 aa  252  9.000000000000001e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00203617  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  37.28 
 
 
596 aa  251  1e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  37.28 
 
 
596 aa  251  2e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  37.28 
 
 
596 aa  251  3e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  37.28 
 
 
596 aa  251  3e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  37.28 
 
 
596 aa  251  3e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  37.28 
 
 
596 aa  251  3e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  34.69 
 
 
588 aa  248  2e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1643  FAD binding domain-containing protein  35.26 
 
 
491 aa  244  3e-63  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  36.5 
 
 
593 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  33.89 
 
 
596 aa  238  3e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  33.48 
 
 
598 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  32.98 
 
 
598 aa  233  6e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  34.06 
 
 
597 aa  232  1e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10160  flavocytochrome c  36.07 
 
 
603 aa  230  5e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  0.0211586 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  34.33 
 
 
589 aa  229  9e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  36.51 
 
 
596 aa  228  3e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  34.99 
 
 
589 aa  226  7e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  36.65 
 
 
583 aa  224  3e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  34.26 
 
 
591 aa  224  3e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  33.48 
 
 
608 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  36.72 
 
 
596 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0107  flavocytochrome c  35.87 
 
 
605 aa  220  6e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  36.84 
 
 
596 aa  216  7e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0488  flavocytochrome c  33.33 
 
 
606 aa  214  3.9999999999999995e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.203471 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  35.06 
 
 
596 aa  208  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  31.97 
 
 
502 aa  207  4e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3495  flavocytochrome c  33.2 
 
 
925 aa  206  7e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  32.84 
 
 
925 aa  206  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  31.68 
 
 
457 aa  204  3e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  33.98 
 
 
589 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  31.55 
 
 
464 aa  201  3.9999999999999996e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2558  flavocytochrome c  32.73 
 
 
926 aa  197  3e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2625  flavocytochrome c  30.5 
 
 
957 aa  193  8e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809387  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  30.67 
 
 
465 aa  190  5.999999999999999e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  32.12 
 
 
504 aa  190  5.999999999999999e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  31.58 
 
 
493 aa  180  7e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000784469 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13640  flavocytochrome c  31.03 
 
 
650 aa  177  4e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0801  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  28.82 
 
 
598 aa  170  5e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1545  putative flavocytochrome c flavin subunit  28.36 
 
 
447 aa  170  6e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2653  flavocytochrome c  32.12 
 
 
631 aa  169  9e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.123058 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>