More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0378 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  100 
 
 
591 aa  1187    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  48.5 
 
 
609 aa  490  1e-137  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  45.85 
 
 
599 aa  449  1e-125  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10160  flavocytochrome c  47.29 
 
 
603 aa  448  1.0000000000000001e-124  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  0.0211586 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  44.26 
 
 
584 aa  434  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  45.95 
 
 
586 aa  424  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0107  flavocytochrome c  46.96 
 
 
605 aa  418  9.999999999999999e-116  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  44.58 
 
 
586 aa  413  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  40.88 
 
 
582 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0488  flavocytochrome c  45.45 
 
 
606 aa  399  1e-109  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.203471 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4620  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  40.71 
 
 
582 aa  396  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  41.65 
 
 
582 aa  392  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4193  flavocytochrome c  42.07 
 
 
582 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4325  flavocytochrome c  42.07 
 
 
582 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  39.5 
 
 
597 aa  368  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  37.64 
 
 
608 aa  341  2e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  43.86 
 
 
598 aa  311  2e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13640  flavocytochrome c  35.35 
 
 
650 aa  307  4.0000000000000004e-82  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2653  flavocytochrome c  37.25 
 
 
631 aa  306  9.000000000000001e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.123058 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  37.28 
 
 
925 aa  302  1e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  37.68 
 
 
502 aa  296  6e-79  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  38.71 
 
 
517 aa  292  1e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  40.75 
 
 
588 aa  291  2e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05539  oxidoreductase  34.79 
 
 
1004 aa  290  6e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  35.2 
 
 
637 aa  289  8e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3495  flavocytochrome c  36.98 
 
 
925 aa  287  4e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  39.06 
 
 
596 aa  286  5.999999999999999e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2381  NADH:flavin oxidoreductase/fumarate reductase, flavoprotein subunit, putative  33.17 
 
 
1005 aa  285  1.0000000000000001e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0049  fumarate reductase flavoprotein subunit  35.97 
 
 
616 aa  285  2.0000000000000002e-75  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00375543  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  38 
 
 
598 aa  281  2e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  38.48 
 
 
598 aa  278  2e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13430  flavocytochrome c  35.14 
 
 
616 aa  276  7e-73  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2558  flavocytochrome c  34.22 
 
 
926 aa  267  4e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  38.11 
 
 
589 aa  265  2e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2625  flavocytochrome c  34.94 
 
 
957 aa  263  4.999999999999999e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809387  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  39.47 
 
 
589 aa  260  5.0000000000000005e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  39.96 
 
 
591 aa  259  7e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  37.84 
 
 
583 aa  253  6e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  38.06 
 
 
596 aa  252  1e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  38.74 
 
 
596 aa  252  1e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0270  flavocytochrome c flavin subunit  35.62 
 
 
511 aa  252  1e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  40.13 
 
 
596 aa  251  2e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  38.06 
 
 
596 aa  251  3e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  40.13 
 
 
596 aa  250  6e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  33.92 
 
 
457 aa  250  6e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  36.24 
 
 
464 aa  249  7e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2096  flavocytochrome c  37.72 
 
 
515 aa  249  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148795  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1782  flavocytochrome c  37.72 
 
 
515 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  39.91 
 
 
596 aa  248  3e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  34.41 
 
 
510 aa  247  4e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1861  flavocytochrome c  37.52 
 
 
515 aa  247  4.9999999999999997e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  40.35 
 
 
596 aa  246  6e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  39.47 
 
 
596 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  39.47 
 
 
596 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  39.47 
 
 
596 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  39.47 
 
 
596 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  39.69 
 
 
597 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0913  flavocytochrome c  35.28 
 
 
483 aa  245  1.9999999999999999e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.387235  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  37.61 
 
 
596 aa  244  3e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  35.89 
 
 
465 aa  241  2.9999999999999997e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  35.78 
 
 
504 aa  240  5e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  38.63 
 
 
593 aa  239  9e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0139  radical SAM domain-containing protein  35.28 
 
 
511 aa  238  2e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  34.95 
 
 
589 aa  238  3e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  33.83 
 
 
519 aa  236  6e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3960  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  33.17 
 
 
577 aa  236  6e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000052594  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  34.85 
 
 
515 aa  232  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0136  flavocytochrome c flavin subunit  34.34 
 
 
517 aa  230  6e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.584631  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  34.89 
 
 
519 aa  225  2e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  35.33 
 
 
519 aa  224  4e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  34.48 
 
 
517 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  34.48 
 
 
517 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1803  FAD binding domain-containing protein  34.23 
 
 
521 aa  221  3.9999999999999997e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000300511  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1444  flavocytochrome c  33.47 
 
 
512 aa  219  7e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2432  flavocytochrome c  33.69 
 
 
517 aa  219  1e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77876  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3301  flavocytochrome c flavin subunit  32.23 
 
 
499 aa  217  5.9999999999999996e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2933  flavocytochrome c  35 
 
 
521 aa  216  8e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0340  flavocytochrome c  32.64 
 
 
500 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0003  flavocytochrome c flavin subunit  32.82 
 
 
508 aa  214  3.9999999999999995e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000666036  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0002  flavocytochrome c flavin subunit  31.84 
 
 
518 aa  211  2e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000401985  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2089  flavocytochrome c  34.71 
 
 
519 aa  206  1e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.455233  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0256  flavocytochrome c  32.92 
 
 
506 aa  205  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2084  flavocytochrome c  33.61 
 
 
520 aa  204  4e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3536  flavocytochrome c  33.33 
 
 
506 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2230  flavocytochrome c  33.33 
 
 
506 aa  201  3e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3939  flavocytochrome c  33.47 
 
 
506 aa  200  7e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2153  flavocytochrome c  33.13 
 
 
506 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0615938 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2401  flavocytochrome c flavin subunit  30.82 
 
 
505 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0275  flavocytochrome c  33.19 
 
 
506 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000326146 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00140  fumarate reductase (NADH), putative  31.37 
 
 
635 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0434389  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3897  flavocytochrome c  31.67 
 
 
506 aa  196  7e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.513243  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0273  flavocytochrome c  31.52 
 
 
506 aa  196  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000188956 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51720  fumarate reductase flavoprotein  32.14 
 
 
668 aa  195  2e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.744935  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1095  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  33.41 
 
 
482 aa  194  4e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_10064  predicted protein  32.59 
 
 
561 aa  192  1e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.14351 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27122  predicted protein  31.83 
 
 
587 aa  186  8e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0188056 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52061  predicted protein  31.83 
 
 
587 aa  186  8e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3624  flavocytochrome c flavin subunit  31.98 
 
 
494 aa  184  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2511  flavocytochrome c  30.52 
 
 
507 aa  181  4e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.842513  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4178  flavocytochrome c flavin subunit  30.85 
 
 
500 aa  179  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.630459 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>