More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0136 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0136  flavocytochrome c flavin subunit  100 
 
 
517 aa  1061    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.584631  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0270  flavocytochrome c flavin subunit  47.84 
 
 
511 aa  455  1e-127  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  45.95 
 
 
510 aa  430  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1803  FAD binding domain-containing protein  45.22 
 
 
521 aa  431  1e-119  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000300511  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1444  flavocytochrome c  45.9 
 
 
512 aa  426  1e-118  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0002  flavocytochrome c flavin subunit  43.46 
 
 
518 aa  403  1e-111  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000401985  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2089  flavocytochrome c  45.28 
 
 
519 aa  398  1e-109  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.455233  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2084  flavocytochrome c  45.35 
 
 
520 aa  392  1e-108  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  43.43 
 
 
519 aa  393  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  43.14 
 
 
517 aa  389  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  42.64 
 
 
519 aa  387  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  42.44 
 
 
519 aa  388  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  43.37 
 
 
517 aa  382  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2432  flavocytochrome c  43.54 
 
 
517 aa  377  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77876  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0139  radical SAM domain-containing protein  43.06 
 
 
511 aa  369  1e-100  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2933  flavocytochrome c  42.54 
 
 
521 aa  358  9.999999999999999e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  40.83 
 
 
517 aa  357  3.9999999999999996e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0913  flavocytochrome c  41.72 
 
 
483 aa  355  1e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.387235  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0256  flavocytochrome c  39.57 
 
 
506 aa  353  5e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2230  flavocytochrome c  39.96 
 
 
506 aa  349  8e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0273  flavocytochrome c  40.79 
 
 
506 aa  348  1e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000188956 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2153  flavocytochrome c  39.96 
 
 
506 aa  347  2e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0615938 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3536  flavocytochrome c  39.26 
 
 
506 aa  347  3e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3897  flavocytochrome c  40.58 
 
 
506 aa  342  8e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.513243  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3939  flavocytochrome c  41 
 
 
506 aa  342  9e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0003  flavocytochrome c flavin subunit  41.29 
 
 
508 aa  342  1e-92  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000666036  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0340  flavocytochrome c  39.96 
 
 
500 aa  340  4e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0275  flavocytochrome c  41.09 
 
 
506 aa  340  4e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000326146 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  37.4 
 
 
515 aa  336  7.999999999999999e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3301  flavocytochrome c flavin subunit  38.37 
 
 
499 aa  330  3e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2511  flavocytochrome c  37.3 
 
 
507 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.842513  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2534  flavocytochrome c  40.04 
 
 
506 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.135835  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1414  flavocytochrome c flavin subunit, putative  40.7 
 
 
506 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0299  flavocytochrome c  41.41 
 
 
506 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0588345 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2401  flavocytochrome c flavin subunit  38.15 
 
 
505 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0325  flavocytochrome c  39.69 
 
 
507 aa  306  7e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0276  flavocytochrome c  38.31 
 
 
505 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106606 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1548  flavocytochrome c flavin subunit  38.36 
 
 
501 aa  304  2.0000000000000002e-81  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00203617  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4178  flavocytochrome c flavin subunit  37.82 
 
 
500 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.630459 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3624  flavocytochrome c flavin subunit  38.83 
 
 
494 aa  301  2e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4184  flavocytochrome c  39.5 
 
 
503 aa  290  6e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.159689 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2096  flavocytochrome c  38.51 
 
 
515 aa  266  8e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148795  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1643  FAD binding domain-containing protein  35.1 
 
 
491 aa  265  1e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1861  flavocytochrome c  38.1 
 
 
515 aa  260  4e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1782  flavocytochrome c  37.89 
 
 
515 aa  259  1e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0254  flavocytochrome c  39.05 
 
 
367 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  35.02 
 
 
584 aa  249  7e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  37.14 
 
 
609 aa  248  2e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  33.4 
 
 
599 aa  243  6e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  35.4 
 
 
582 aa  241  2e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4620  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  34.78 
 
 
582 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  34.78 
 
 
582 aa  230  4e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  33.54 
 
 
586 aa  228  1e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  34.99 
 
 
593 aa  229  1e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4193  flavocytochrome c  34.58 
 
 
582 aa  226  8e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4325  flavocytochrome c  34.58 
 
 
582 aa  226  8e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  32.78 
 
 
586 aa  226  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  35.61 
 
 
596 aa  224  3e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  35.61 
 
 
596 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  35.8 
 
 
597 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  35.4 
 
 
596 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  35.68 
 
 
596 aa  220  6e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  35.2 
 
 
596 aa  219  6e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  35.68 
 
 
596 aa  220  6e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  35.68 
 
 
596 aa  220  6e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  35.68 
 
 
596 aa  220  6e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  33.01 
 
 
588 aa  218  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  33.33 
 
 
598 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  33.19 
 
 
591 aa  210  5e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1545  putative flavocytochrome c flavin subunit  31.59 
 
 
447 aa  210  5e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  32.78 
 
 
589 aa  202  9e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  32.72 
 
 
598 aa  202  9e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  32.72 
 
 
598 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  32.69 
 
 
596 aa  201  3e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  33.19 
 
 
596 aa  201  3e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  32.2 
 
 
596 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  32.12 
 
 
596 aa  194  3e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  31.41 
 
 
502 aa  193  5e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  30.71 
 
 
596 aa  193  7e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10160  flavocytochrome c  32.49 
 
 
603 aa  192  1e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  0.0211586 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0107  flavocytochrome c  31.73 
 
 
605 aa  192  1e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  31.9 
 
 
589 aa  189  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  31.84 
 
 
583 aa  188  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  30.94 
 
 
464 aa  187  5e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  31.64 
 
 
591 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  31.68 
 
 
589 aa  183  6e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3495  flavocytochrome c  32.17 
 
 
925 aa  180  4.999999999999999e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0488  flavocytochrome c  29.53 
 
 
606 aa  179  8e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.203471 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  31.88 
 
 
925 aa  179  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2558  flavocytochrome c  29.4 
 
 
926 aa  178  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00140  fumarate reductase (NADH), putative  31.8 
 
 
635 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0434389  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  29.81 
 
 
457 aa  174  5e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  32.85 
 
 
597 aa  173  5.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2625  flavocytochrome c  30.23 
 
 
957 aa  171  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809387  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13640  flavocytochrome c  28.91 
 
 
650 aa  169  1e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05539  oxidoreductase  28.19 
 
 
1004 aa  169  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51720  fumarate reductase flavoprotein  28.11 
 
 
668 aa  165  1.0000000000000001e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.744935  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_10064  predicted protein  29.49 
 
 
561 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.14351 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  27.56 
 
 
637 aa  165  2.0000000000000002e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13430  flavocytochrome c  29.39 
 
 
616 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>