More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_13430 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_13430  flavocytochrome c  100 
 
 
616 aa  1268    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  78.61 
 
 
637 aa  976    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13640  flavocytochrome c  38.98 
 
 
650 aa  385  1e-105  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2653  flavocytochrome c  38.75 
 
 
631 aa  374  1e-102  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.123058 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0049  fumarate reductase flavoprotein subunit  36.22 
 
 
616 aa  318  2e-85  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00375543  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  34.71 
 
 
609 aa  302  1e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2381  NADH:flavin oxidoreductase/fumarate reductase, flavoprotein subunit, putative  33.49 
 
 
1005 aa  300  5e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  36.78 
 
 
599 aa  298  2e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  33.27 
 
 
608 aa  294  3e-78  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  32.88 
 
 
597 aa  283  6.000000000000001e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10160  flavocytochrome c  35.32 
 
 
603 aa  282  1e-74  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  0.0211586 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  35.14 
 
 
591 aa  278  2e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05539  oxidoreductase  31.48 
 
 
1004 aa  278  3e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  34.74 
 
 
586 aa  267  4e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0107  flavocytochrome c  35.06 
 
 
605 aa  266  7e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  33.45 
 
 
584 aa  262  1e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  33.83 
 
 
502 aa  261  3e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  36.08 
 
 
504 aa  259  1e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  32.47 
 
 
925 aa  259  1e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3495  flavocytochrome c  32.64 
 
 
925 aa  258  2e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  35.85 
 
 
598 aa  254  3e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  35.98 
 
 
598 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  34.2 
 
 
588 aa  252  1e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2625  flavocytochrome c  33.28 
 
 
957 aa  251  3e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809387  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  33.86 
 
 
586 aa  250  5e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0488  flavocytochrome c  33 
 
 
606 aa  249  9e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.203471 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  34.98 
 
 
596 aa  249  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  34.4 
 
 
464 aa  248  2e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  32.15 
 
 
582 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  36.25 
 
 
589 aa  244  5e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  38.3 
 
 
593 aa  241  2e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  32.33 
 
 
582 aa  239  1e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  36.93 
 
 
598 aa  239  1e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4620  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  31.26 
 
 
582 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  35.73 
 
 
591 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  37.53 
 
 
596 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  37.53 
 
 
596 aa  231  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2558  flavocytochrome c  31.5 
 
 
926 aa  231  3e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  37.31 
 
 
596 aa  231  4e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  33.33 
 
 
457 aa  231  4e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4325  flavocytochrome c  31.44 
 
 
582 aa  230  6e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4193  flavocytochrome c  31.44 
 
 
582 aa  230  6e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  33.76 
 
 
589 aa  229  8e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  33.04 
 
 
465 aa  228  2e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  36.72 
 
 
596 aa  228  3e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  36.72 
 
 
596 aa  228  3e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  36.72 
 
 
596 aa  228  3e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  36.72 
 
 
596 aa  228  3e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  36.93 
 
 
596 aa  228  4e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  36.51 
 
 
597 aa  226  7e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  36.19 
 
 
589 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  33.7 
 
 
596 aa  219  1e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  33.85 
 
 
596 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2096  flavocytochrome c  33.64 
 
 
515 aa  217  5.9999999999999996e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148795  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  33.26 
 
 
583 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1861  flavocytochrome c  34.76 
 
 
515 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1782  flavocytochrome c  34.55 
 
 
515 aa  213  1e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  33.41 
 
 
596 aa  211  4e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  33.41 
 
 
596 aa  209  9e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  33.68 
 
 
519 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0913  flavocytochrome c  33.81 
 
 
483 aa  200  7e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.387235  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  31.42 
 
 
510 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  32.99 
 
 
519 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  31.26 
 
 
519 aa  194  4e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  32.61 
 
 
517 aa  192  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0270  flavocytochrome c flavin subunit  29.32 
 
 
511 aa  189  1e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0574  FMN-binding domain protein  28.27 
 
 
657 aa  187  4e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0139  radical SAM domain-containing protein  31.73 
 
 
511 aa  187  4e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2432  flavocytochrome c  31.82 
 
 
517 aa  184  3e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77876  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  31.95 
 
 
517 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  32.16 
 
 
517 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00140  fumarate reductase (NADH), putative  28.69 
 
 
635 aa  183  9.000000000000001e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0434389  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1444  flavocytochrome c  29.77 
 
 
512 aa  182  1e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0136  flavocytochrome c flavin subunit  30.12 
 
 
517 aa  180  7e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.584631  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01543  hypothetical fumarate reductase (Eurofung)  26.53 
 
 
627 aa  171  4e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000554356  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3624  flavocytochrome c flavin subunit  30 
 
 
494 aa  170  7e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0002  flavocytochrome c flavin subunit  29.15 
 
 
518 aa  170  7e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000401985  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3301  flavocytochrome c flavin subunit  31.33 
 
 
499 aa  169  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2933  flavocytochrome c  29.13 
 
 
521 aa  169  1e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  29.09 
 
 
515 aa  169  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3960  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.18 
 
 
577 aa  168  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000052594  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1029  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.58 
 
 
509 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4178  flavocytochrome c flavin subunit  28.81 
 
 
500 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.630459 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0795  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.38 
 
 
509 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.820864  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22640  aspartate oxidase  27.29 
 
 
623 aa  162  2e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.73746 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1803  FAD binding domain-containing protein  29.15 
 
 
521 aa  161  3e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000300511  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2089  flavocytochrome c  30.72 
 
 
519 aa  160  5e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.455233  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0003  flavocytochrome c flavin subunit  30.19 
 
 
508 aa  159  1e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000666036  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3536  flavocytochrome c  30.23 
 
 
506 aa  158  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2511  flavocytochrome c  28.75 
 
 
507 aa  157  7e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.842513  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3252  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.36 
 
 
523 aa  157  7e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.556116  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3181  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.8 
 
 
523 aa  156  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.357921  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0945  Succinate dehydrogenase  27.51 
 
 
511 aa  155  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0256  flavocytochrome c  29.39 
 
 
506 aa  154  4e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2084  flavocytochrome c  30.52 
 
 
520 aa  154  4e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3897  flavocytochrome c  28.69 
 
 
506 aa  154  5e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.513243  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0273  flavocytochrome c  28.54 
 
 
506 aa  154  5.9999999999999996e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000188956 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0405  FMN-binding domain protein  26.56 
 
 
626 aa  153  1e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.07228 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2230  flavocytochrome c  28.71 
 
 
506 aa  152  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2153  flavocytochrome c  28.71 
 
 
506 aa  151  3e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0615938 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>