More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3505 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  95.64 
 
 		 596 aa  1149    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  100 
 
 		 596 aa  1216    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  62.05 
 
 		 596 aa  717    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  63.27 
 
 		 596 aa  733    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  100 
 
 		 596 aa  1216    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  62.35 
 
 		 596 aa  722    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  95.46 
 
 		 597 aa  1146    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  61.87 
 
 		 596 aa  739    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  94.46 
 
 		 596 aa  1146    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  94.3 
 
 		 596 aa  1144    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  61.34 
 
 		 583 aa  717    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  94.8 
 
 		 596 aa  1147    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  100 
 
 		 596 aa  1216    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  81.21 
 
 		 593 aa  959    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  100 
 
 		 596 aa  1216    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  55.97 
 
 		 589 aa  633  1e-180  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  54.97 
 
 		 591 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  48.31 
 
 		 588 aa  566  1e-160  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  51.69 
 
 		 598 aa  564  1.0000000000000001e-159  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  49.32 
 
 		 589 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  51.24 
 
 		 596 aa  561  1.0000000000000001e-159  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  51.34 
 
 		 598 aa  555  1e-156  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  45.96 
 
 		 589 aa  483  1e-135  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  49.68 
 
 		 598 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  49.1 
 
 		 597 aa  412  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  42.7 
 
 		 502 aa  366  1e-100  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  43.56 
 
 		 457 aa  361  2e-98  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2625  flavocytochrome c  44.91 
 
 		 957 aa  355  1e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809387  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  45.07 
 
 		 925 aa  351  3e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3495  flavocytochrome c  45.05 
 
 		 925 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2558  flavocytochrome c  41.49 
 
 		 926 aa  336  7e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  41.14 
 
 		 608 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  38.99 
 
 		 464 aa  328  2.0000000000000001e-88  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  37.95 
 
 		 465 aa  320  6e-86  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  42.19 
 
 		 504 aa  315  9.999999999999999e-85  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  38.2 
 
 		 599 aa  293  7e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  38.83 
 
 		 582 aa  282  1e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  39.3 
 
 		 586 aa  279  1e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4620  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  38.83 
 
 		 582 aa  278  2e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  39.25 
 
 		 586 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  37.72 
 
 		 517 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  37.23 
 
 		 584 aa  269  1e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  38.61 
 
 		 582 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  39.25 
 
 		 609 aa  267  2.9999999999999995e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  36.13 
 
 		 519 aa  261  3e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4325  flavocytochrome c  37.98 
 
 		 582 aa  259  7e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4193  flavocytochrome c  37.98 
 
 		 582 aa  259  7e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2096  flavocytochrome c  38.87 
 
 		 515 aa  253  9.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148795  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  34.7 
 
 		 519 aa  250  6e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1782  flavocytochrome c  38.91 
 
 		 515 aa  247  3e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1861  flavocytochrome c  38.91 
 
 		 515 aa  247  4e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  38.13 
 
 		 591 aa  244  3e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05539  oxidoreductase  35.63 
 
 		 1004 aa  244  3.9999999999999997e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10160  flavocytochrome c  39.43 
 
 		 603 aa  243  7.999999999999999e-63  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  0.0211586 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2653  flavocytochrome c  37.37 
 
 		 631 aa  242  1e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.123058 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  35.49 
 
 		 515 aa  242  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0136  flavocytochrome c flavin subunit  35.68 
 
 		 517 aa  239  1e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.584631  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  33.91 
 
 		 519 aa  237  4e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  32.68 
 
 		 510 aa  234  3e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0270  flavocytochrome c flavin subunit  35.79 
 
 		 511 aa  234  4.0000000000000004e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0049  fumarate reductase flavoprotein subunit  35.78 
 
 		 616 aa  233  7.000000000000001e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00375543  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  34.55 
 
 		 517 aa  230  5e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  35.62 
 
 		 637 aa  230  5e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2432  flavocytochrome c  33.76 
 
 		 517 aa  228  2e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77876  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  33.69 
 
 		 517 aa  227  4e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0107  flavocytochrome c  37.5 
 
 		 605 aa  227  4e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1803  FAD binding domain-containing protein  35.7 
 
 		 521 aa  227  6e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000300511  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3301  flavocytochrome c flavin subunit  32.52 
 
 		 499 aa  226  1e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13640  flavocytochrome c  36.99 
 
 		 650 aa  226  1e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13430  flavocytochrome c  36.72 
 
 		 616 aa  223  7e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0340  flavocytochrome c  34.13 
 
 		 500 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27122  predicted protein  35.12 
 
 		 587 aa  222  1.9999999999999999e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0188056 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52061  predicted protein  35.12 
 
 		 587 aa  222  1.9999999999999999e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00140  fumarate reductase (NADH), putative  33.11 
 
 		 635 aa  217  4e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0434389  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1444  flavocytochrome c  33.4 
 
 		 512 aa  217  5e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0273  flavocytochrome c  34.81 
 
 		 506 aa  217  5.9999999999999996e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188956 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51720  fumarate reductase flavoprotein  32.98 
 
 		 668 aa  215  1.9999999999999998e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.744935  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0488  flavocytochrome c  34.12 
 
 		 606 aa  215  1.9999999999999998e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.203471 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2933  flavocytochrome c  32.85 
 
 		 521 aa  214  2.9999999999999995e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2381  NADH:flavin oxidoreductase/fumarate reductase, flavoprotein subunit, putative  33.27 
 
 		 1005 aa  214  3.9999999999999995e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3624  flavocytochrome c flavin subunit  35.43 
 
 		 494 aa  213  7.999999999999999e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0913  flavocytochrome c  33.26 
 
 		 483 aa  213  1e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.387235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3960  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  36.41 
 
 		 577 aa  213  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000052594  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3897  flavocytochrome c  35.61 
 
 		 506 aa  213  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.513243  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0275  flavocytochrome c  35.17 
 
 		 506 aa  212  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000326146 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01543  hypothetical fumarate reductase (Eurofung)  33.26 
 
 		 627 aa  211  3e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000554356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4178  flavocytochrome c flavin subunit  34.89 
 
 		 500 aa  210  7e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.630459 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3536  flavocytochrome c  35.15 
 
 		 506 aa  209  1e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0256  flavocytochrome c  33.83 
 
 		 506 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_10064  predicted protein  33.2 
 
 		 561 aa  208  2e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.14351 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2230  flavocytochrome c  34.67 
 
 		 506 aa  208  2e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3939  flavocytochrome c  34.96 
 
 		 506 aa  208  3e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2089  flavocytochrome c  35.49 
 
 		 519 aa  205  1e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.455233  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0002  flavocytochrome c flavin subunit  32.15 
 
 		 518 aa  205  2e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000401985  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2084  flavocytochrome c  34.36 
 
 		 520 aa  204  3e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2153  flavocytochrome c  34.04 
 
 		 506 aa  204  4e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0615938 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0139  radical SAM domain-containing protein  32.84 
 
 		 511 aa  204  5e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0086  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  35.99 
 
 		 515 aa  196  7e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45689  fumarate reductase flavoprotein subunit  31.65 
 
 		 478 aa  196  1e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10296  FAD dependent oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05070)  30.35 
 
 		 484 aa  192  2e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>