More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1548 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1643  FAD binding domain-containing protein  72.29 
 
 
491 aa  705    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1548  flavocytochrome c flavin subunit  100 
 
 
501 aa  1020    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00203617  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2401  flavocytochrome c flavin subunit  42.91 
 
 
505 aa  389  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1803  FAD binding domain-containing protein  42.64 
 
 
521 aa  380  1e-104  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000300511  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0270  flavocytochrome c flavin subunit  40.61 
 
 
511 aa  340  4e-92  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1444  flavocytochrome c  37.09 
 
 
512 aa  332  9e-90  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0136  flavocytochrome c flavin subunit  38.36 
 
 
517 aa  317  3e-85  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.584631  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0002  flavocytochrome c flavin subunit  37.6 
 
 
518 aa  314  1.9999999999999998e-84  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000401985  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0003  flavocytochrome c flavin subunit  38.52 
 
 
508 aa  304  3.0000000000000004e-81  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000666036  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  35.11 
 
 
510 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0139  radical SAM domain-containing protein  36.45 
 
 
511 aa  283  4.0000000000000003e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2153  flavocytochrome c  35.99 
 
 
506 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0615938 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0275  flavocytochrome c  35.98 
 
 
506 aa  283  7.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000326146 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2230  flavocytochrome c  35.99 
 
 
506 aa  281  2e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0256  flavocytochrome c  35.99 
 
 
506 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  32.76 
 
 
519 aa  280  4e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2089  flavocytochrome c  36.42 
 
 
519 aa  280  5e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.455233  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  31.66 
 
 
519 aa  276  6e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3939  flavocytochrome c  36.23 
 
 
506 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0273  flavocytochrome c  34.93 
 
 
506 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000188956 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2084  flavocytochrome c  36.22 
 
 
520 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3536  flavocytochrome c  35.74 
 
 
506 aa  273  6e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  32.75 
 
 
519 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  34.92 
 
 
517 aa  263  6e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3301  flavocytochrome c flavin subunit  35.56 
 
 
499 aa  261  2e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1545  putative flavocytochrome c flavin subunit  32.97 
 
 
447 aa  260  4e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3897  flavocytochrome c  34.23 
 
 
506 aa  260  4e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.513243  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  31.64 
 
 
517 aa  257  4e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2511  flavocytochrome c  33.53 
 
 
507 aa  257  4e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.842513  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2432  flavocytochrome c  32.14 
 
 
517 aa  253  7e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77876  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  31.25 
 
 
517 aa  249  1e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  32.24 
 
 
515 aa  248  1e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2933  flavocytochrome c  33.33 
 
 
521 aa  248  3e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0340  flavocytochrome c  31.91 
 
 
500 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0913  flavocytochrome c  32.16 
 
 
483 aa  230  6e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.387235  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0276  flavocytochrome c  32.12 
 
 
505 aa  227  5.0000000000000005e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106606 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4178  flavocytochrome c flavin subunit  30.62 
 
 
500 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.630459 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3624  flavocytochrome c flavin subunit  31.95 
 
 
494 aa  217  4e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0299  flavocytochrome c  33.2 
 
 
506 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0588345 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1414  flavocytochrome c flavin subunit, putative  32.99 
 
 
506 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0325  flavocytochrome c  32.31 
 
 
507 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2534  flavocytochrome c  33.4 
 
 
506 aa  211  4e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.135835  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4184  flavocytochrome c  32.65 
 
 
503 aa  210  5e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.159689 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0254  flavocytochrome c  33.69 
 
 
367 aa  192  9e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  32.28 
 
 
598 aa  184  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  30.82 
 
 
599 aa  178  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  30.67 
 
 
589 aa  177  4e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  29.9 
 
 
584 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  31.65 
 
 
591 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  29.34 
 
 
588 aa  172  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  30.17 
 
 
597 aa  172  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  30.4 
 
 
596 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  30.11 
 
 
596 aa  167  4e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  28.95 
 
 
598 aa  167  5e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  29.09 
 
 
589 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  29.53 
 
 
596 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  29.19 
 
 
464 aa  166  8e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  30.11 
 
 
597 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  29.53 
 
 
596 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  29.53 
 
 
596 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  30.72 
 
 
609 aa  163  8.000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  29.07 
 
 
596 aa  163  8.000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  29.96 
 
 
596 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  29.96 
 
 
596 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  29.96 
 
 
596 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  29.96 
 
 
596 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  28.54 
 
 
598 aa  161  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  27.68 
 
 
596 aa  160  4e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  29.24 
 
 
582 aa  160  4e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  29.39 
 
 
583 aa  158  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  28.82 
 
 
596 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  28.54 
 
 
596 aa  156  9e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10160  flavocytochrome c  30.3 
 
 
603 aa  156  9e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  0.0211586 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3495  flavocytochrome c  29.03 
 
 
925 aa  156  9e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4620  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  29.03 
 
 
582 aa  155  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0107  flavocytochrome c  30.46 
 
 
605 aa  155  2e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  29.79 
 
 
925 aa  155  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2096  flavocytochrome c  26.92 
 
 
515 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148795  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  29.64 
 
 
582 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1861  flavocytochrome c  27.15 
 
 
515 aa  154  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1782  flavocytochrome c  27.15 
 
 
515 aa  154  4e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4325  flavocytochrome c  27.82 
 
 
582 aa  153  5e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4193  flavocytochrome c  27.82 
 
 
582 aa  153  5e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  29.3 
 
 
591 aa  151  2e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0488  flavocytochrome c  29.12 
 
 
606 aa  151  3e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.203471 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  29 
 
 
502 aa  151  3e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  29.45 
 
 
586 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13640  flavocytochrome c  27.88 
 
 
650 aa  145  2e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  28.27 
 
 
593 aa  145  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  28.6 
 
 
586 aa  144  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2558  flavocytochrome c  28.38 
 
 
926 aa  144  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  28.24 
 
 
457 aa  143  8e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2984  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.23 
 
 
607 aa  141  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2625  flavocytochrome c  27 
 
 
957 aa  140  6e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809387  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13430  flavocytochrome c  26.37 
 
 
616 aa  139  2e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  27.33 
 
 
589 aa  137  5e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  25.7 
 
 
637 aa  135  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  25.85 
 
 
465 aa  134  3.9999999999999996e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  27.53 
 
 
608 aa  133  6e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0801  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  28.21 
 
 
598 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>