176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0957 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2085  putative FAD-binding dehydrogenase  70.86 
 
 		 558 aa  759    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.376668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0883  putative FAD-binding dehydrogenase  62.41 
 
 		 552 aa  667    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.237453  normal  0.672197 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3668  putative FAD-binding dehydrogenase  61.38 
 
 		 552 aa  655    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114123  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5200  putative FAD-binding dehydrogenase  70.86 
 
 		 556 aa  772    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0163  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  60.57 
 
 		 548 aa  658    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0957  putative FAD-binding dehydrogenase  100 
 
 		 558 aa  1117    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1043  putative FAD-binding dehydrogenase  85.3 
 
 		 558 aa  941    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5288  putative FAD-binding dehydrogenase  70.86 
 
 		 556 aa  772    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.918325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5580  putative FAD-binding dehydrogenase  70.5 
 
 		 556 aa  766    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.684507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6214  putative FAD-binding dehydrogenase  60.14 
 
 		 551 aa  639    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2532  putative FAD-binding dehydrogenase  61.99 
 
 		 551 aa  643    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.608155 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4560  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  61.07 
 
 		 557 aa  659    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.935324  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2713  putative FAD-binding dehydrogenase  62.14 
 
 		 551 aa  653    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0401801  hitchhiker  0.00069854 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1725  putative FAD-binding dehydrogenase  60.77 
 
 		 551 aa  645    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.64226  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1140  putative FAD-binding dehydrogenase  63.93 
 
 		 573 aa  632  1e-180  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.196555  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4333  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  60.66 
 
 		 597 aa  629  1e-179  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3994  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  59.86 
 
 		 571 aa  626  1e-178  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.542255  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1896  putative FAD-binding dehydrogenase  60.11 
 
 		 557 aa  622  1e-177  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10800  putative FAD-binding dehydrogenase  58.98 
 
 		 566 aa  623  1e-177  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3745  putative FAD-binding dehydrogenase  58.3 
 
 		 549 aa  618  1e-175  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5132  putative FAD-binding dehydrogenase  58.11 
 
 		 555 aa  614  9.999999999999999e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06450  predicted oxidoreductase  60.07 
 
 		 559 aa  613  9.999999999999999e-175  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3775  putative FAD-binding dehydrogenase  58.97 
 
 		 553 aa  613  9.999999999999999e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08090  predicted oxidoreductase  61.49 
 
 		 549 aa  608  9.999999999999999e-173  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0173464  normal  0.283602 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1621  putative FAD-binding dehydrogenase  57.79 
 
 		 545 aa  608  9.999999999999999e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2248  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  61.21 
 
 		 555 aa  602  1.0000000000000001e-171  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.826896  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0670  putative FAD-binding dehydrogenase  60.73 
 
 		 551 aa  600  1e-170  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3223  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  60 
 
 		 550 aa  600  1e-170  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0628  putative FAD-binding dehydrogenase  60.73 
 
 		 551 aa  597  1e-169  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0741  putative FAD-binding dehydrogenase  58.48 
 
 		 555 aa  594  1e-168  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0675  putative FAD-binding dehydrogenase  57.71 
 
 		 552 aa  579  1e-164  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.935742  normal  0.139475 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0191  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  54.98 
 
 		 550 aa  541  9.999999999999999e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1100  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  54.41 
 
 		 551 aa  529  1e-149  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000939173 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1344  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  52.32 
 
 		 559 aa  500  1e-140  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.543603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0214  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  48.91 
 
 		 558 aa  493  9.999999999999999e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2414  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  50.7 
 
 		 571 aa  478  1e-133  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0440095  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  42.86 
 
 		 537 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.223151  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2343  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  38.04 
 
 		 552 aa  334  2e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4675  putative fumarate reductase flavoprotein  37.25 
 
 		 533 aa  306  9.000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.572233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3510  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  36.02 
 
 		 541 aa  300  4e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0870  putative fumarate reductase flavoprotein  35.6 
 
 		 549 aa  295  2e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2809  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  36.86 
 
 		 537 aa  294  3e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3486  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  36.5 
 
 		 537 aa  287  4e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.664087  normal  0.809041 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1003  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.18 
 
 		 522 aa  160  4e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03960  FAD dependent oxidoreductase  63.16 
 
 		 98 aa  99.4  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.933434  normal  0.205844 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1029  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.18 
 
 		 509 aa  78.6  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27122  predicted protein  24 
 
 		 587 aa  77.4  0.0000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0188056 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52061  predicted protein  24 
 
 		 587 aa  77.4  0.0000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  20.77 
 
 		 608 aa  77.4  0.0000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3301  flavocytochrome c flavin subunit  30.29 
 
 		 499 aa  77  0.0000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0795  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.45 
 
 		 509 aa  76.6  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.820864  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  23.05 
 
 		 597 aa  75.1  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_10064  predicted protein  24.47 
 
 		 561 aa  74.3  0.000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.14351 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0945  Succinate dehydrogenase  21.25 
 
 		 511 aa  73.9  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22640  aspartate oxidase  28.7 
 
 		 623 aa  72.4  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.73746 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  22.91 
 
 		 465 aa  71.2  0.00000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  22.03 
 
 		 504 aa  68.9  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4061  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  23.22 
 
 		 476 aa  66.2  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  22.3 
 
 		 464 aa  65.1  0.000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51720  fumarate reductase flavoprotein  22.9 
 
 		 668 aa  65.1  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.744935  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  23.38 
 
 		 593 aa  64.3  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  22.99 
 
 		 637 aa  62.8  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  23.01 
 
 		 457 aa  61.6  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2825  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  21.33 
 
 		 498 aa  61.2  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  22.84 
 
 		 589 aa  61.6  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0208  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.79 
 
 		 534 aa  60.5  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177  normal  0.616185 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3252  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.36 
 
 		 523 aa  60.5  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.556116  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3181  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.67 
 
 		 523 aa  60.1  0.00000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.357921  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  22.68 
 
 		 517 aa  60.1  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04200  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  27.57 
 
 		 481 aa  59.7  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.906237  normal  0.517886 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  23.16 
 
 		 598 aa  59.7  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2930  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.71 
 
 		 512 aa  58.2  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4075  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  24.34 
 
 		 484 aa  58.2  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  24.24 
 
 		 596 aa  54.7  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02520  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  24.54 
 
 		 527 aa  55.1  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.152988  normal  0.211132 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4658  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.49 
 
 		 492 aa  54.7  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  23.36 
 
 		 519 aa  54.3  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3056  tricarballylate dehydrogenase  23.78 
 
 		 482 aa  54.3  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01540  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  22.4 
 
 		 501 aa  53.9  0.000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0190007 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13430  flavocytochrome c  23.98 
 
 		 616 aa  53.5  0.000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  27.69 
 
 		 598 aa  53.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  25.79 
 
 		 589 aa  52.8  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  29.11 
 
 		 515 aa  53.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2933  flavocytochrome c  35.42 
 
 		 521 aa  52.4  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  29.96 
 
 		 517 aa  52.4  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0275  flavocytochrome c  32.31 
 
 		 506 aa  52  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000326146 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  27.69 
 
 		 598 aa  51.6  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16630  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  22.14 
 
 		 600 aa  51.6  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.770903  normal  0.816981 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6873  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  33.06 
 
 		 569 aa  51.6  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.901911  normal  0.6243 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1803  FAD binding domain-containing protein  27.24 
 
 		 521 aa  51.2  0.00005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000300511  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  23.55 
 
 		 519 aa  51.2  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3939  flavocytochrome c  32.31 
 
 		 506 aa  51.2  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2827  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  21.55 
 
 		 511 aa  50.8  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  26.01 
 
 		 591 aa  50.8  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3897  flavocytochrome c  23.29 
 
 		 506 aa  50.8  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.513243  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4077  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  27.56 
 
 		 491 aa  49.7  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2653  flavocytochrome c  28.81 
 
 		 631 aa  50.1  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.123058 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0270  flavocytochrome c flavin subunit  27.98 
 
 		 511 aa  50.1  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4178  flavocytochrome c flavin subunit  27.01 
 
 		 500 aa  49.7  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.630459 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1365  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.92 
 
 		 628 aa  48.9  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>