More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1365 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_1365  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  100 
 
 
628 aa  1276    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0795  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  35.77 
 
 
509 aa  270  5e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.820864  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1029  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  35.37 
 
 
509 aa  268  2e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3181  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  34.31 
 
 
523 aa  256  6e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.357921  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3252  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  34.56 
 
 
523 aa  256  8e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.556116  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0945  Succinate dehydrogenase  33.65 
 
 
511 aa  233  1e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0574  FMN-binding domain protein  26.91 
 
 
657 aa  181  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0298  putative flavoprotein subunit of a reductase  32 
 
 
508 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000145919 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.39 
 
 
519 aa  179  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13800  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  30.06 
 
 
547 aa  171  5e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.290223  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2731  putative flavoprotein subunit of a reductase  28.96 
 
 
507 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.620849  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3021  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  32.61 
 
 
552 aa  164  6e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.867777  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07260  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  27.29 
 
 
472 aa  155  2.9999999999999998e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0049  fumarate reductase flavoprotein subunit  28.12 
 
 
616 aa  154  4e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00375543  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0172  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.72 
 
 
560 aa  149  1.0000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.79854  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  27.94 
 
 
597 aa  146  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0486  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.52 
 
 
572 aa  143  9e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.221964 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  27.04 
 
 
637 aa  143  9.999999999999999e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02520  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  28.99 
 
 
527 aa  142  9.999999999999999e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.152988  normal  0.211132 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2796  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.62 
 
 
578 aa  141  3.9999999999999997e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000175303 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0682  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.55 
 
 
640 aa  140  7.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000305666  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1037  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  30.4 
 
 
463 aa  140  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.192722  normal  0.0849595 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1658  FMN-binding domain protein  27.14 
 
 
715 aa  138  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05539  oxidoreductase  26 
 
 
1004 aa  138  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2930  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.58 
 
 
512 aa  137  6.0000000000000005e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2826  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.92 
 
 
543 aa  136  9.999999999999999e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26410  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  27.17 
 
 
546 aa  135  1.9999999999999998e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.991458  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1103  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.48 
 
 
598 aa  135  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0288  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.11 
 
 
557 aa  133  7.999999999999999e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22640  aspartate oxidase  27.08 
 
 
623 aa  132  1.0000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.73746 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  26.98 
 
 
584 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  27.17 
 
 
591 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12470  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  27.21 
 
 
566 aa  128  3e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.967758  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1533  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  30.06 
 
 
485 aa  127  6e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.339209 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  26.85 
 
 
925 aa  126  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3387  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  28.74 
 
 
557 aa  125  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2787  twin-arginine translocation pathway signal  28.98 
 
 
553 aa  125  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12690  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  27.31 
 
 
580 aa  125  3e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  27.18 
 
 
609 aa  124  6e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2381  NADH:flavin oxidoreductase/fumarate reductase, flavoprotein subunit, putative  25.23 
 
 
1005 aa  124  7e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13430  flavocytochrome c  26.91 
 
 
616 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13560  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  26.92 
 
 
549 aa  121  3e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0519  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.8 
 
 
607 aa  121  3.9999999999999996e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.220754 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1157  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  29.41 
 
 
556 aa  120  7e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  26.95 
 
 
464 aa  120  9e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  27.7 
 
 
588 aa  118  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3960  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.45 
 
 
577 aa  118  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000052594  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04200  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  25.6 
 
 
481 aa  118  3e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.906237  normal  0.517886 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4325  flavocytochrome c  27.3 
 
 
582 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4193  flavocytochrome c  27.3 
 
 
582 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2625  flavocytochrome c  27.22 
 
 
957 aa  117  5e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809387  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07280  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  27.08 
 
 
575 aa  117  6e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  27.64 
 
 
582 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0208  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.44 
 
 
534 aa  116  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177  normal  0.616185 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0071  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.52 
 
 
512 aa  115  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1218  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.37 
 
 
500 aa  115  3e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.292447  normal  0.0459445 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2291  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.56 
 
 
565 aa  115  3e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1388  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.88 
 
 
581 aa  114  4.0000000000000004e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0314977  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4620  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  26.86 
 
 
582 aa  114  6e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  27.3 
 
 
582 aa  114  6e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10160  flavocytochrome c  27.6 
 
 
603 aa  114  7.000000000000001e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  0.0211586 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  26.35 
 
 
583 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  27.61 
 
 
589 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0977  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.56 
 
 
561 aa  112  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  26.9 
 
 
608 aa  111  3e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  26.49 
 
 
502 aa  111  4.0000000000000004e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  26.14 
 
 
596 aa  111  5e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13450  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  26.41 
 
 
600 aa  110  6e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  26.89 
 
 
586 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2107  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.92 
 
 
584 aa  109  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.107675  normal  0.0249042 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3181  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  28.03 
 
 
555 aa  110  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.449651  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  26.78 
 
 
586 aa  109  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  26.14 
 
 
596 aa  108  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3495  flavocytochrome c  26.31 
 
 
925 aa  109  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0801  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  26.43 
 
 
598 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2698  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.87 
 
 
591 aa  109  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4075  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  25.89 
 
 
484 aa  108  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0986  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.68 
 
 
567 aa  107  5e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01540  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  25.82 
 
 
501 aa  107  6e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0190007 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  25.73 
 
 
596 aa  107  9e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0183  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.09 
 
 
592 aa  106  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  24.7 
 
 
465 aa  106  1e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  25.91 
 
 
493 aa  106  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000784469 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4061  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  25 
 
 
476 aa  106  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2933  flavocytochrome c  26.56 
 
 
521 aa  106  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  25.1 
 
 
589 aa  105  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03720  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  23.66 
 
 
558 aa  105  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0687  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.42 
 
 
503 aa  105  3e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3694  twin-arginine translocation pathway signal  27.88 
 
 
559 aa  104  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  27.11 
 
 
591 aa  104  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2558  flavocytochrome c  25.48 
 
 
926 aa  104  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0367  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.59 
 
 
589 aa  104  5e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.786243 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1779  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.56 
 
 
586 aa  104  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3684  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.31 
 
 
592 aa  103  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.504489  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25020  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  24.49 
 
 
550 aa  103  8e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3618  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.57 
 
 
560 aa  103  9e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0405  FMN-binding domain protein  24.83 
 
 
626 aa  103  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.07228 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1095  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.95 
 
 
482 aa  103  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0107  flavocytochrome c  28.69 
 
 
605 aa  103  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  26.07 
 
 
596 aa  102  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>