273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3668 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0670  putative FAD-binding dehydrogenase  67.18 
 
 		 551 aa  672    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2713  putative FAD-binding dehydrogenase  66.6 
 
 		 551 aa  662    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0401801  hitchhiker  0.00069854 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0883  putative FAD-binding dehydrogenase  67.23 
 
 		 552 aa  699    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.237453  normal  0.672197 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3745  putative FAD-binding dehydrogenase  65.62 
 
 		 549 aa  695    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1896  putative FAD-binding dehydrogenase  63.69 
 
 		 557 aa  655    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0163  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  65.87 
 
 		 548 aa  695    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06450  predicted oxidoreductase  63.69 
 
 		 559 aa  650    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5200  putative FAD-binding dehydrogenase  61.86 
 
 		 556 aa  637    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6214  putative FAD-binding dehydrogenase  60.95 
 
 		 551 aa  647    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0957  putative FAD-binding dehydrogenase  61.38 
 
 		 558 aa  645    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3223  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  65.47 
 
 		 550 aa  664    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1043  putative FAD-binding dehydrogenase  62.09 
 
 		 558 aa  660    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4333  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  62.36 
 
 		 597 aa  644    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3775  putative FAD-binding dehydrogenase  65.31 
 
 		 553 aa  682    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1140  putative FAD-binding dehydrogenase  67.57 
 
 		 573 aa  653    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.196555  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2085  putative FAD-binding dehydrogenase  65.81 
 
 		 558 aa  683    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.376668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1725  putative FAD-binding dehydrogenase  64.8 
 
 		 551 aa  665    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.64226  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10800  putative FAD-binding dehydrogenase  62.11 
 
 		 566 aa  645    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5288  putative FAD-binding dehydrogenase  61.86 
 
 		 556 aa  637    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.918325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0628  putative FAD-binding dehydrogenase  67.18 
 
 		 551 aa  671    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5132  putative FAD-binding dehydrogenase  62.94 
 
 		 555 aa  667    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2532  putative FAD-binding dehydrogenase  66.41 
 
 		 551 aa  662    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.608155 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08090  predicted oxidoreductase  67.25 
 
 		 549 aa  666    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0173464  normal  0.283602 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2248  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  66.48 
 
 		 555 aa  665    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.826896  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4560  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  62.77 
 
 		 557 aa  655    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.935324  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3668  putative FAD-binding dehydrogenase  100 
 
 		 552 aa  1121    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114123  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3994  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  62.8 
 
 		 571 aa  646    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.542255  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1621  putative FAD-binding dehydrogenase  62.75 
 
 		 545 aa  663    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0675  putative FAD-binding dehydrogenase  64.23 
 
 		 552 aa  633  1e-180  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.935742  normal  0.139475 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5580  putative FAD-binding dehydrogenase  61.31 
 
 		 556 aa  630  1e-179  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.684507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0741  putative FAD-binding dehydrogenase  60.81 
 
 		 555 aa  616  1e-175  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1100  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  58.5 
 
 		 551 aa  588  1e-167  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000939173 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0191  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  58.61 
 
 		 550 aa  561  1e-158  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1344  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  54.55 
 
 		 559 aa  540  9.999999999999999e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.543603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0214  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  50.74 
 
 		 558 aa  509  1e-143  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2414  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  51.75 
 
 		 571 aa  511  1e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0440095  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2343  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  37.52 
 
 		 552 aa  336  5e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3510  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  36.1 
 
 		 541 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4675  putative fumarate reductase flavoprotein  35.15 
 
 		 533 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.572233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0870  putative fumarate reductase flavoprotein  34.55 
 
 		 549 aa  303  8.000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  39.35 
 
 		 537 aa  302  1e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.223151  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2809  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  35.06 
 
 		 537 aa  288  2e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3486  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  34.94 
 
 		 537 aa  282  1e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.664087  normal  0.809041 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1003  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.49 
 
 		 522 aa  154  4e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1444  flavocytochrome c  25.61 
 
 		 512 aa  98.2  3e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03960  FAD dependent oxidoreductase  62.34 
 
 		 98 aa  92.4  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.933434  normal  0.205844 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0945  Succinate dehydrogenase  25.44 
 
 		 511 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  23.91 
 
 		 588 aa  77  0.0000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3301  flavocytochrome c flavin subunit  32.28 
 
 		 499 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  23.69 
 
 		 589 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13430  flavocytochrome c  25.99 
 
 		 616 aa  73.6  0.000000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  22.08 
 
 		 597 aa  73.6  0.000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  23.3 
 
 		 589 aa  70.9  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0003  flavocytochrome c flavin subunit  24.11 
 
 		 508 aa  69.7  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000666036  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  23.67 
 
 		 519 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  22.34 
 
 		 464 aa  67.8  0.0000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  22.5 
 
 		 502 aa  67.4  0.0000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  24.07 
 
 		 637 aa  63.9  0.000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  23.23 
 
 		 608 aa  63.9  0.000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1064  tricarballylate dehydrogenase  22.54 
 
 		 505 aa  63.5  0.000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4911  putative FAD-binding dehydrogenase  24.67 
 
 		 578 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.855718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1548  flavocytochrome c flavin subunit  23.27 
 
 		 501 aa  62.8  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00203617  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2933  flavocytochrome c  44 
 
 		 521 aa  62.4  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  21.93 
 
 		 519 aa  62  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1861  flavocytochrome c  22.41 
 
 		 515 aa  62  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2084  flavocytochrome c  41.77 
 
 		 520 aa  61.6  0.00000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_10064  predicted protein  42.17 
 
 		 561 aa  60.8  0.00000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.14351 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3826  hypothetical protein  40.26 
 
 		 91 aa  60.5  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  23.78 
 
 		 504 aa  60.5  0.00000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2600  putative FAD-binding dehydrogenase  24.72 
 
 		 570 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.742686  normal  0.0811196 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  23.14 
 
 		 598 aa  59.7  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2096  flavocytochrome c  21.79 
 
 		 515 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148795  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1782  flavocytochrome c  22.17 
 
 		 515 aa  60.1  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4061  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  23.02 
 
 		 476 aa  60.1  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  38.27 
 
 		 515 aa  59.7  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4620  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  35.45 
 
 		 582 aa  58.9  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  37.35 
 
 		 599 aa  58.9  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1218  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.95 
 
 		 500 aa  58.9  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.292447  normal  0.0459445 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1029  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.86 
 
 		 509 aa  59.3  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27122  predicted protein  32.56 
 
 		 587 aa  58.5  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0188056 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0795  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.94 
 
 		 509 aa  58.5  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.820864  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52061  predicted protein  32.56 
 
 		 587 aa  58.5  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3243  putative FAD-binding dehydrogenase  24.47 
 
 		 570 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.650049 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2146  putative FAD-binding dehydrogenase  25.7 
 
 		 570 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.18708 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  25.2 
 
 		 596 aa  58.2  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2702  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  39.29 
 
 		 489 aa  58.2  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0307  hypothetical protein  25.22 
 
 		 487 aa  58.2  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.681233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3125  putative FAD-binding dehydrogenase  24.44 
 
 		 570 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4077  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  26.39 
 
 		 491 aa  57.8  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3181  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.79 
 
 		 523 aa  57.8  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.357921  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  35.85 
 
 		 582 aa  57.4  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  24.13 
 
 		 596 aa  57.4  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01543  hypothetical fumarate reductase (Eurofung)  23.91 
 
 		 627 aa  57  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000554356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  39.02 
 
 		 510 aa  57  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2894  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.7 
 
 		 529 aa  57  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0165292  hitchhiker  0.000448653 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  39.77 
 
 		 582 aa  56.6  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4193  flavocytochrome c  36.45 
 
 		 582 aa  56.6  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0316  hypothetical protein  25 
 
 		 487 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.719492  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0326  hypothetical protein  25 
 
 		 487 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.173098 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4325  flavocytochrome c  36.45 
 
 		 582 aa  56.6  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>