More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1064 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1064  tricarballylate dehydrogenase  100 
 
 		 505 aa  1040    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3133  tricarballylate dehydrogenase  51.05 
 
 		 524 aa  448  1e-125  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.262589  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6400  tricarballylate dehydrogenase  46.25 
 
 		 502 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.479436  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5093  tricarballylate dehydrogenase  44.68 
 
 		 498 aa  402  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496959 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06133  conserved hypothetical protein  42.44 
 
 		 530 aa  394  1e-108  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2808  tricarballylate dehydrogenase  44.91 
 
 		 503 aa  394  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2834  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  44.17 
 
 		 488 aa  377  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3056  tricarballylate dehydrogenase  43.63 
 
 		 482 aa  371  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0283  tricarballylate dehydrogenase  44.2 
 
 		 493 aa  363  4e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02608  conserved hypothetical protein  41.28 
 
 		 508 aa  361  2e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.262389 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2722  tricarballylate dehydrogenase  36.83 
 
 		 468 aa  278  1e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8556  tricarballylate dehydrogenase  35.99 
 
 		 462 aa  260  3e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.819008  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3133  tricarballylate dehydrogenase  36.6 
 
 		 476 aa  255  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.615879  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2502  tricarballylate dehydrogenase  36.9 
 
 		 472 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.927489  normal  0.370831 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2274  tricarballylate dehydrogenase  36.29 
 
 		 465 aa  251  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.579032  normal  0.274442 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4210  tricarballylate dehydrogenase  35.83 
 
 		 477 aa  247  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0798  tricarballylate dehydrogenase  36.09 
 
 		 467 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0811  tricarballylate dehydrogenase  35.89 
 
 		 467 aa  247  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.329314  normal  0.994664 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0847  tricarballylate dehydrogenase  35.89 
 
 		 467 aa  247  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.530072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0738  tricarballylate dehydrogenase  35.89 
 
 		 467 aa  247  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0182155  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0750  tricarballylate dehydrogenase  35.89 
 
 		 467 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0900786  normal  0.301353 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0639  tricarballylate dehydrogenase  35.91 
 
 		 479 aa  246  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6134  tricarballylate dehydrogenase  35.87 
 
 		 469 aa  238  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6301  tricarballylate dehydrogenase  35.54 
 
 		 468 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5878  tricarballylate dehydrogenase  35.52 
 
 		 469 aa  236  9e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6017  tricarballylate dehydrogenase  34.82 
 
 		 469 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.652214 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2086  tricarballylate dehydrogenase  35.13 
 
 		 471 aa  234  3e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.32911  normal  0.0400814 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3488  tricarballylate dehydrogenase  35.43 
 
 		 486 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5626  tricarballylate dehydrogenase  35.56 
 
 		 469 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4211  tricarballylate dehydrogenase  35.82 
 
 		 470 aa  230  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.287239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3815  tricarballylate dehydrogenase  35 
 
 		 469 aa  229  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.990462 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5148  tricarballylate dehydrogenase  34.58 
 
 		 469 aa  227  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.226548  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0794  tricarballylate dehydrogenase  34.47 
 
 		 474 aa  222  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4070  tricarballylate dehydrogenase  33.27 
 
 		 479 aa  217  5e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1003  putative succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  33.68 
 
 		 485 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.415422  normal  0.433093 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3858  tricarballylate dehydrogenase  33 
 
 		 474 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000815395 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3415  tricarballylate dehydrogenase  33.27 
 
 		 479 aa  214  3.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1893  tricarballylate dehydrogenase  33.88 
 
 		 457 aa  201  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.291034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0200  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  33.26 
 
 		 488 aa  195  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  29.48 
 
 		 588 aa  162  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  29.52 
 
 		 589 aa  156  9e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2323  tricarballylate dehydrogenase  27.74 
 
 		 432 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  28.37 
 
 		 493 aa  147  4.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000784469 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  30.08 
 
 		 597 aa  145  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  29.4 
 
 		 596 aa  145  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  27.88 
 
 		 583 aa  138  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  28.92 
 
 		 609 aa  137  5e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  28.32 
 
 		 464 aa  135  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  28.12 
 
 		 582 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3613  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  75.32 
 
 		 377 aa  133  9e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  27.85 
 
 		 598 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  26.79 
 
 		 596 aa  131  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  28.22 
 
 		 596 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  26.56 
 
 		 502 aa  130  5.0000000000000004e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2986  tricarballylate dehydrogenase  30.45 
 
 		 477 aa  130  6e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0071938  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2383  tricarballylate dehydrogenase  26.32 
 
 		 434 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.401613  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  28.43 
 
 		 596 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4620  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  27.73 
 
 		 582 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  27.44 
 
 		 598 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  27.16 
 
 		 596 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0462  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.79 
 
 		 536 aa  128  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  28.97 
 
 		 596 aa  127  5e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3768  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  29.47 
 
 		 460 aa  127  6e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  28.83 
 
 		 584 aa  125  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0232  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.44 
 
 		 523 aa  125  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0397857  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  28.86 
 
 		 596 aa  126  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  26.92 
 
 		 925 aa  126  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  28.03 
 
 		 596 aa  125  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4193  flavocytochrome c  28.09 
 
 		 582 aa  124  4e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4325  flavocytochrome c  28.09 
 
 		 582 aa  124  4e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  28.49 
 
 		 586 aa  124  6e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  27.17 
 
 		 582 aa  123  8e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  27.88 
 
 		 589 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0465  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.65 
 
 		 524 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  26.17 
 
 		 608 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  26.92 
 
 		 599 aa  122  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  28.06 
 
 		 593 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  28.74 
 
 		 586 aa  121  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  28.57 
 
 		 596 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05539  oxidoreductase  27.62 
 
 		 1004 aa  121  3.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  28.57 
 
 		 596 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  28.57 
 
 		 596 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  28.57 
 
 		 596 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0482  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  28.11 
 
 		 491 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  28.17 
 
 		 597 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  28.54 
 
 		 591 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  27.94 
 
 		 517 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3175  tricarballylate dehydrogenase  26.73 
 
 		 441 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0508  putative dehydrogenase flavoprotein  25.86 
 
 		 560 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.890159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3488  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  27.61 
 
 		 491 aa  117  6.9999999999999995e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  28.25 
 
 		 596 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  26.84 
 
 		 589 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2381  NADH:flavin oxidoreductase/fumarate reductase, flavoprotein subunit, putative  28.54 
 
 		 1005 aa  115  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2432  flavocytochrome c  27.52 
 
 		 517 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77876  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1095  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.73 
 
 		 482 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3495  flavocytochrome c  25.96 
 
 		 925 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2731  putative flavoprotein subunit of a reductase  26.8 
 
 		 507 aa  114  5e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.620849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13640  flavocytochrome c  28.28 
 
 		 650 aa  114  5e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  25.35 
 
 		 637 aa  113  6e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  26.6 
 
 		 504 aa  113  6e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>