More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3488 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3488  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  100 
 
 		 491 aa  1001    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3411  hypothetical protein  45.01 
 
 		 500 aa  386  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0735026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2856  hypothetical protein  46.14 
 
 		 493 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2900  hypothetical protein  46.14 
 
 		 493 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3165  hypothetical protein  45.02 
 
 		 525 aa  375  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0565388  normal  0.0860599 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2887  hypothetical protein  46.14 
 
 		 658 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4545  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  46.56 
 
 		 495 aa  372  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0296  hypothetical protein  47.49 
 
 		 493 aa  362  8e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11847  hypothetical protein  45.88 
 
 		 487 aa  354  2e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.81807e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1518  hypothetical protein  42.33 
 
 		 498 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0214659  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1659  hypothetical protein  41.34 
 
 		 493 aa  325  9e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.224804  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3339  hypothetical protein  42.37 
 
 		 488 aa  317  2e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3686  hypothetical protein  40.3 
 
 		 484 aa  311  1e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0316  hypothetical protein  39.67 
 
 		 487 aa  286  4e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.719492  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0326  hypothetical protein  39.67 
 
 		 487 aa  286  4e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.173098 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0307  hypothetical protein  39.47 
 
 		 487 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.681233  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3846  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  38.92 
 
 		 486 aa  270  2.9999999999999997e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4550  hypothetical protein  37.89 
 
 		 482 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.288577 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2890  hypothetical protein  38.87 
 
 		 486 aa  241  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.995147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3515  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  35.64 
 
 		 492 aa  223  4e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.395658  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0302  hypothetical protein  32.64 
 
 		 534 aa  196  7e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.947471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0312  hypothetical protein  32.64 
 
 		 534 aa  196  7e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.337711 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1005  hypothetical protein  31.45 
 
 		 555 aa  196  8.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0143655 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0293  hypothetical protein  32.23 
 
 		 529 aa  189  7e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.467949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1860  hypothetical protein  31.56 
 
 		 552 aa  189  9e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.903101 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4564  hypothetical protein  32.2 
 
 		 523 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00360175  normal  0.224392 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0773  hypothetical protein  31.54 
 
 		 542 aa  179  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000153715  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2675  hypothetical protein  30.45 
 
 		 528 aa  167  4e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0187257  normal  0.0233154 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2883  hypothetical protein  29.21 
 
 		 530 aa  156  9e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0393135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3721  hypothetical protein  27.91 
 
 		 587 aa  143  5e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3335  hypothetical protein  29.07 
 
 		 570 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248225 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  25.1 
 
 		 588 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  26.22 
 
 		 517 aa  120  6e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3784  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  26.06 
 
 		 593 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3857  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  26.06 
 
 		 593 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3788  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  26.06 
 
 		 593 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04200  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  26.19 
 
 		 481 aa  119  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.906237  normal  0.517886 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4243  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  25.98 
 
 		 601 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1624  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.4 
 
 		 524 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2432  flavocytochrome c  25.3 
 
 		 517 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77876  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0687  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.45 
 
 		 503 aa  114  4.0000000000000004e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2511  flavocytochrome c  27.25 
 
 		 507 aa  113  9e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.842513  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  25.49 
 
 		 517 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0508  putative dehydrogenase flavoprotein  27.72 
 
 		 560 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.890159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  24.37 
 
 		 519 aa  110  6e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3501  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.22 
 
 		 510 aa  109  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116635  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2629  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  31.11 
 
 		 549 aa  108  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1064  tricarballylate dehydrogenase  26.97 
 
 		 505 aa  108  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  27.25 
 
 		 457 aa  108  3e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2826  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  30.91 
 
 		 549 aa  108  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.156046  normal  0.069629 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  24.8 
 
 		 589 aa  107  5e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  25.6 
 
 		 582 aa  107  5e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  26.32 
 
 		 464 aa  107  7e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  23.94 
 
 		 519 aa  106  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0208  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.64 
 
 		 534 aa  105  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177  normal  0.616185 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  24.75 
 
 		 517 aa  105  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0182  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.29 
 
 		 588 aa  104  3e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  25.11 
 
 		 599 aa  103  7e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1037  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  28.37 
 
 		 463 aa  103  8e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.192722  normal  0.0849595 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0482  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  27.06 
 
 		 491 aa  103  8e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1218  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.28 
 
 		 500 aa  103  8e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.292447  normal  0.0459445 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  25.89 
 
 		 925 aa  103  9e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  24.55 
 
 		 519 aa  103  9e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2625  flavocytochrome c  26.61 
 
 		 957 aa  102  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809387  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1298  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.57 
 
 		 569 aa  101  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.306259  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  24.75 
 
 		 510 aa  102  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  25.93 
 
 		 493 aa  102  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000784469 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2933  flavocytochrome c  24.73 
 
 		 521 aa  102  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1580  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  25.99 
 
 		 550 aa  101  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  24.75 
 
 		 584 aa  101  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3789  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like protein  26.79 
 
 		 533 aa  101  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.270006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3862  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  26.79 
 
 		 533 aa  101  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0314999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0183  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.39 
 
 		 592 aa  101  4e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3818  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.94 
 
 		 545 aa  100  6e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0669548  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6400  tricarballylate dehydrogenase  26.68 
 
 		 502 aa  100  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.479436  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  26.25 
 
 		 591 aa  100  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3793  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  26.61 
 
 		 533 aa  100  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.445361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  26.6 
 
 		 582 aa  100  8e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2291  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.12 
 
 		 565 aa  100  8e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  23.55 
 
 		 598 aa  99.4  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4075  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  25.59 
 
 		 484 aa  99.8  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2731  putative flavoprotein subunit of a reductase  25.25 
 
 		 507 aa  99  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.620849  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  23.35 
 
 		 598 aa  99  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4248  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  26.64 
 
 		 537 aa  99  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.374366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1072  flavoprotein  23.56 
 
 		 598 aa  98.2  3e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.208394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2780  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  30.08 
 
 		 564 aa  98.2  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.386374  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2403  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  25.45 
 
 		 604 aa  98.2  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0172  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.23 
 
 		 560 aa  97.8  4e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.79854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4325  flavocytochrome c  26.01 
 
 		 582 aa  97.8  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4193  flavocytochrome c  26.01 
 
 		 582 aa  97.8  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  23.81 
 
 		 596 aa  97.1  6e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  24.94 
 
 		 597 aa  96.7  8e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30250  putative FAD-binding dehydrogenase  26.6 
 
 		 572 aa  96.7  9e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  25.34 
 
 		 596 aa  96.3  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4620  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  24.8 
 
 		 582 aa  96.3  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2834  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  26.7 
 
 		 488 aa  96.3  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2398  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  26.56 
 
 		 535 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2796  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.43 
 
 		 578 aa  95.1  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000175303 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3768  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  25.3 
 
 		 460 aa  95.1  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  23.32 
 
 		 515 aa  95.5  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>