More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11847 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2856  hypothetical protein  75.05 
 
 
493 aa  732    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4545  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  70.91 
 
 
495 aa  656    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0296  hypothetical protein  70.64 
 
 
493 aa  666    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2900  hypothetical protein  75.05 
 
 
493 aa  732    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3165  hypothetical protein  73.01 
 
 
525 aa  704    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0565388  normal  0.0860599 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11847  hypothetical protein  100 
 
 
487 aa  989    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.81807e-16  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2887  hypothetical protein  75.05 
 
 
658 aa  734    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3411  hypothetical protein  73.27 
 
 
500 aa  720    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0735026  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3488  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  46.47 
 
 
491 aa  402  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1518  hypothetical protein  43.15 
 
 
498 aa  336  5e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0214659  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1659  hypothetical protein  42.5 
 
 
493 aa  314  2.9999999999999996e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.224804  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3686  hypothetical protein  41.19 
 
 
484 aa  313  2.9999999999999996e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3339  hypothetical protein  38.43 
 
 
488 aa  299  7e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3846  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  41.51 
 
 
486 aa  295  1e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0307  hypothetical protein  40.81 
 
 
487 aa  295  1e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.681233  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0316  hypothetical protein  40.61 
 
 
487 aa  294  2e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.719492  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0326  hypothetical protein  40.61 
 
 
487 aa  294  2e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.173098 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3515  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  39.31 
 
 
492 aa  265  1e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.395658  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2890  hypothetical protein  40.33 
 
 
486 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.995147  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4550  hypothetical protein  38.68 
 
 
482 aa  256  7e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.288577 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0773  hypothetical protein  35.29 
 
 
542 aa  199  7e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000153715  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1005  hypothetical protein  30.81 
 
 
555 aa  182  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0143655 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4564  hypothetical protein  32.51 
 
 
523 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00360175  normal  0.224392 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2675  hypothetical protein  33.33 
 
 
528 aa  179  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0187257  normal  0.0233154 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0302  hypothetical protein  31.94 
 
 
534 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.947471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0312  hypothetical protein  31.94 
 
 
534 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.337711 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1860  hypothetical protein  30.21 
 
 
552 aa  171  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.903101 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2883  hypothetical protein  31.69 
 
 
530 aa  169  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0393135  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0293  hypothetical protein  30.81 
 
 
529 aa  163  6e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.467949  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  30.49 
 
 
589 aa  149  8e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3721  hypothetical protein  29.85 
 
 
587 aa  147  4.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  29.6 
 
 
591 aa  141  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1298  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.88 
 
 
569 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.306259  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  28.77 
 
 
596 aa  138  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2894  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.38 
 
 
529 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0165292  hitchhiker  0.000448653 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0208  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.1 
 
 
534 aa  136  9.999999999999999e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177  normal  0.616185 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  28.63 
 
 
598 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4243  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  28.08 
 
 
601 aa  134  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  28.16 
 
 
609 aa  134  5e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  27.51 
 
 
598 aa  133  7.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  29.11 
 
 
596 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  26.36 
 
 
464 aa  130  6e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0107  flavocytochrome c  28.48 
 
 
605 aa  129  1.0000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  26.25 
 
 
457 aa  129  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  29.75 
 
 
596 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3788  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  28.29 
 
 
593 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3784  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  28.29 
 
 
593 aa  128  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3857  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  28.29 
 
 
593 aa  128  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89705  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0405  FMN-binding domain protein  30.14 
 
 
626 aa  127  5e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.07228 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3335  hypothetical protein  29.17 
 
 
570 aa  126  9e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0248225 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4718  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  27.03 
 
 
564 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.329428 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  29.75 
 
 
596 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  29.55 
 
 
597 aa  125  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  29.25 
 
 
596 aa  125  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  29.25 
 
 
596 aa  125  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  29.75 
 
 
596 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  29.75 
 
 
596 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  29.75 
 
 
596 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1037  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  30.04 
 
 
463 aa  124  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.192722  normal  0.0849595 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  29.13 
 
 
596 aa  123  6e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0488  flavocytochrome c  30.26 
 
 
606 aa  123  6e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.203471 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8556  tricarballylate dehydrogenase  30.38 
 
 
462 aa  123  9e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.819008  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  26.99 
 
 
599 aa  122  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  28.94 
 
 
596 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  28.9 
 
 
596 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  26.71 
 
 
588 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  25.48 
 
 
608 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  30.41 
 
 
598 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0482  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  29.24 
 
 
491 aa  120  6e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4061  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  26.97 
 
 
476 aa  120  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2403  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  27.32 
 
 
604 aa  119  9e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  28.06 
 
 
596 aa  117  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0945  Succinate dehydrogenase  28.27 
 
 
511 aa  118  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2653  flavocytochrome c  27.36 
 
 
631 aa  117  3.9999999999999997e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.123058 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  27.43 
 
 
593 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1095  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.29 
 
 
482 aa  117  5e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10160  flavocytochrome c  28.54 
 
 
603 aa  117  5e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  0.0211586 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  26.75 
 
 
583 aa  117  5e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  27.57 
 
 
597 aa  116  6.9999999999999995e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  27.56 
 
 
925 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.3 
 
 
519 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  27.08 
 
 
589 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2727  putative succinate dehydrogenase  30.35 
 
 
569 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13640  flavocytochrome c  27.79 
 
 
650 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1003  putative succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  29.26 
 
 
485 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.415422  normal  0.433093 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  28.54 
 
 
493 aa  114  6e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000784469 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0519  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.82 
 
 
607 aa  113  7.000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.220754 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  25.72 
 
 
502 aa  112  1.0000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2825  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.82 
 
 
498 aa  112  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  27.49 
 
 
586 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3501  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.63 
 
 
510 aa  111  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116635  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1003  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.16 
 
 
522 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5986  putative fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  28.78 
 
 
459 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.253677 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2868  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  25.53 
 
 
558 aa  108  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.22099  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4658  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.49 
 
 
492 aa  107  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2826  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  27.41 
 
 
549 aa  108  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.156046  normal  0.069629 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2796  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.59 
 
 
578 aa  108  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000175303 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0325  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  25.68 
 
 
550 aa  107  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.681292  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  26.64 
 
 
591 aa  107  4e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0200  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  26.42 
 
 
488 aa  107  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>