More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2675 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2675  hypothetical protein  100 
 
 		 528 aa  1035    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0187257  normal  0.0233154 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2883  hypothetical protein  87.3 
 
 		 530 aa  828    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0393135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0302  hypothetical protein  49.71 
 
 		 534 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.947471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0312  hypothetical protein  49.71 
 
 		 534 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.337711 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0293  hypothetical protein  49.42 
 
 		 529 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.467949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4564  hypothetical protein  48 
 
 		 523 aa  387  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00360175  normal  0.224392 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3721  hypothetical protein  42.22 
 
 		 587 aa  326  7e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1860  hypothetical protein  41.89 
 
 		 552 aa  322  8e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.903101 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1005  hypothetical protein  42.57 
 
 		 555 aa  317  3e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0143655 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3335  hypothetical protein  40.87 
 
 		 570 aa  295  1e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248225 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0316  hypothetical protein  34.65 
 
 		 487 aa  207  5e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.719492  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0326  hypothetical protein  34.65 
 
 		 487 aa  207  5e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.173098 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0307  hypothetical protein  34.46 
 
 		 487 aa  205  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.681233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3488  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  30.45 
 
 		 491 aa  201  3e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3411  hypothetical protein  32.54 
 
 		 500 aa  199  7.999999999999999e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0735026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3339  hypothetical protein  34.35 
 
 		 488 aa  197  5.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1518  hypothetical protein  35.32 
 
 		 498 aa  196  9e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0214659  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3846  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  34.15 
 
 		 486 aa  191  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3686  hypothetical protein  33.52 
 
 		 484 aa  190  5.999999999999999e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2887  hypothetical protein  33.27 
 
 		 658 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3165  hypothetical protein  32.64 
 
 		 525 aa  184  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0565388  normal  0.0860599 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2856  hypothetical protein  33.27 
 
 		 493 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2900  hypothetical protein  33.27 
 
 		 493 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3515  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  34.48 
 
 		 492 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.395658  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1659  hypothetical protein  34.33 
 
 		 493 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.224804  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0296  hypothetical protein  33.6 
 
 		 493 aa  176  9e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4550  hypothetical protein  32.45 
 
 		 482 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.288577 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4545  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  32.06 
 
 		 495 aa  169  9e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2890  hypothetical protein  32.5 
 
 		 486 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.995147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11847  hypothetical protein  32.76 
 
 		 487 aa  162  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.81807e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0773  hypothetical protein  25.97 
 
 		 542 aa  143  7e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000153715  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1037  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  30.92 
 
 		 463 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.192722  normal  0.0849595 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  25.57 
 
 		 596 aa  128  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  25.61 
 
 		 598 aa  127  7e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  25.47 
 
 		 598 aa  125  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  25.6 
 
 		 517 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  24.95 
 
 		 598 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  25.52 
 
 		 588 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  26.12 
 
 		 589 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  23.01 
 
 		 464 aa  118  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  25.68 
 
 		 519 aa  117  5e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1095  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.5 
 
 		 482 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0687  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.16 
 
 		 503 aa  115  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3768  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  27.61 
 
 		 460 aa  114  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  24.72 
 
 		 589 aa  115  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  25.51 
 
 		 517 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2432  flavocytochrome c  25.65 
 
 		 517 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77876  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  22.87 
 
 		 608 aa  113  7.000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  25.66 
 
 		 591 aa  113  8.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  21.99 
 
 		 502 aa  112  1.0000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  24.38 
 
 		 925 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  25.19 
 
 		 517 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  24.03 
 
 		 519 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  26.28 
 
 		 596 aa  109  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  23.23 
 
 		 457 aa  108  3e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3495  flavocytochrome c  24.24 
 
 		 925 aa  107  7e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1298  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.36 
 
 		 569 aa  105  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.306259  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1029  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.03 
 
 		 509 aa  105  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0795  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.56 
 
 		 509 aa  105  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.820864  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  24.21 
 
 		 597 aa  105  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  24.18 
 
 		 510 aa  104  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  25.47 
 
 		 596 aa  105  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  25.28 
 
 		 597 aa  105  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04200  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  26.86 
 
 		 481 aa  104  4e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.906237  normal  0.517886 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0355  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like protein  30.54 
 
 		 471 aa  103  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  24.35 
 
 		 519 aa  103  7e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  26.18 
 
 		 596 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0124  Succinate dehydrogenase  25.55 
 
 		 497 aa  102  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  26.18 
 
 		 596 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  26.18 
 
 		 596 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  26.18 
 
 		 596 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  24.72 
 
 		 596 aa  101  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  22.45 
 
 		 465 aa  100  6e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2727  putative succinate dehydrogenase  26.86 
 
 		 569 aa  100  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3784  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  25.88 
 
 		 593 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0482  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  25.72 
 
 		 491 aa  99.8  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52061  predicted protein  26.04 
 
 		 587 aa  99.4  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3857  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  25.88 
 
 		 593 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4243  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  25.55 
 
 		 601 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3788  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  25.83 
 
 		 593 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27122  predicted protein  26.04 
 
 		 587 aa  99.4  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0188056 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  24.44 
 
 		 599 aa  99  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0688  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.13 
 
 		 454 aa  97.1  7e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0793917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1937  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  29.51 
 
 		 464 aa  96.7  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  22.37 
 
 		 504 aa  95.5  2e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1533  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  28.01 
 
 		 485 aa  95.1  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.339209 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  22.85 
 
 		 591 aa  93.6  8e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  21.98 
 
 		 596 aa  92.8  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0325  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  26.06 
 
 		 550 aa  92  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.681292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3181  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.33 
 
 		 523 aa  92.4  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.357921  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3252  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.51 
 
 		 523 aa  92.4  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.556116  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2558  flavocytochrome c  22.74 
 
 		 926 aa  91.7  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0945  Succinate dehydrogenase  23.64 
 
 		 511 aa  91.3  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  26.86 
 
 		 593 aa  91.3  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20340  putative succinate dehydrogenase  25.81 
 
 		 581 aa  91.3  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.78266  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3848  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.9 
 
 		 571 aa  90.5  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13570  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  25.09 
 
 		 563 aa  90.5  7e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000282742 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0768  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.6 
 
 		 550 aa  90.1  8e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2778  Succinate dehydrogenase  25 
 
 		 510 aa  90.1  9e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.961247  normal  0.792272 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1218  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.81 
 
 		 500 aa  88.6  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.292447  normal  0.0459445 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>