More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3165 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11847  hypothetical protein  73.01 
 
 
487 aa  684    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.81807e-16  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2856  hypothetical protein  88.14 
 
 
493 aa  842    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2900  hypothetical protein  88.14 
 
 
493 aa  842    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3165  hypothetical protein  100 
 
 
525 aa  1065    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0565388  normal  0.0860599 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3411  hypothetical protein  88.8 
 
 
500 aa  892    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0735026  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2887  hypothetical protein  87.53 
 
 
658 aa  838    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0296  hypothetical protein  67.9 
 
 
493 aa  611  1e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4545  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  64.3 
 
 
495 aa  595  1e-169  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3488  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  45.42 
 
 
491 aa  405  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1518  hypothetical protein  40.95 
 
 
498 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0214659  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1659  hypothetical protein  40.56 
 
 
493 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.224804  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3686  hypothetical protein  39.8 
 
 
484 aa  308  2.0000000000000002e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3339  hypothetical protein  37.34 
 
 
488 aa  300  3e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0316  hypothetical protein  40.85 
 
 
487 aa  291  2e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.719492  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0326  hypothetical protein  40.85 
 
 
487 aa  291  2e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.173098 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0307  hypothetical protein  40.85 
 
 
487 aa  291  2e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.681233  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3846  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  41.19 
 
 
486 aa  286  4e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4550  hypothetical protein  40.16 
 
 
482 aa  259  1e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.288577 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3515  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  37.73 
 
 
492 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.395658  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2890  hypothetical protein  38.4 
 
 
486 aa  246  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.995147  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0773  hypothetical protein  34.46 
 
 
542 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000153715  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0302  hypothetical protein  33.02 
 
 
534 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.947471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0312  hypothetical protein  33.02 
 
 
534 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.337711 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1860  hypothetical protein  31.08 
 
 
552 aa  190  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.903101 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1005  hypothetical protein  31.05 
 
 
555 aa  187  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0143655 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0293  hypothetical protein  32.44 
 
 
529 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.467949  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4564  hypothetical protein  32.1 
 
 
523 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00360175  normal  0.224392 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2675  hypothetical protein  33.03 
 
 
528 aa  184  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0187257  normal  0.0233154 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2883  hypothetical protein  32.33 
 
 
530 aa  178  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0393135  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  29.53 
 
 
598 aa  155  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  28.63 
 
 
598 aa  151  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  29.78 
 
 
589 aa  150  7e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  30.42 
 
 
591 aa  147  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0208  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.32 
 
 
534 aa  145  1e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177  normal  0.616185 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3721  hypothetical protein  28.81 
 
 
587 aa  145  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  28.74 
 
 
596 aa  144  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  29.41 
 
 
589 aa  139  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  28.71 
 
 
588 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  27.42 
 
 
457 aa  137  5e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  29.23 
 
 
591 aa  136  8e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1037  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  30.04 
 
 
463 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.192722  normal  0.0849595 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  27.41 
 
 
608 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  27.93 
 
 
925 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  30.22 
 
 
596 aa  127  5e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  25.71 
 
 
464 aa  127  6e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1298  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.69 
 
 
569 aa  127  6e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.306259  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  29.82 
 
 
596 aa  126  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  30.02 
 
 
596 aa  126  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  29.82 
 
 
596 aa  126  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0945  Succinate dehydrogenase  28.69 
 
 
511 aa  125  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  29.42 
 
 
597 aa  125  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  29.9 
 
 
596 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3320  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  27.5 
 
 
564 aa  124  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  29.9 
 
 
596 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4061  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  28.65 
 
 
476 aa  124  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  29.9 
 
 
596 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  29.9 
 
 
596 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  29.55 
 
 
598 aa  124  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  26.86 
 
 
599 aa  124  5e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  28.22 
 
 
596 aa  124  5e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  27.27 
 
 
504 aa  123  8e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4718  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  27.86 
 
 
564 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.329428 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3335  hypothetical protein  28.67 
 
 
570 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0248225 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  27.54 
 
 
517 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  26.56 
 
 
465 aa  120  3.9999999999999996e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1095  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.05 
 
 
482 aa  121  3.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  27.5 
 
 
582 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2432  flavocytochrome c  27.92 
 
 
517 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77876  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  27.95 
 
 
596 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  25.56 
 
 
502 aa  117  3.9999999999999997e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  28.33 
 
 
493 aa  117  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000784469 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2825  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.31 
 
 
498 aa  117  5e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  27.4 
 
 
517 aa  117  5e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0488  flavocytochrome c  29.27 
 
 
606 aa  117  5e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.203471 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  27.12 
 
 
583 aa  117  6e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  28.77 
 
 
609 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2778  Succinate dehydrogenase  29.36 
 
 
510 aa  115  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.961247  normal  0.792272 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0355  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like protein  31.19 
 
 
471 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0482  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  25.58 
 
 
491 aa  115  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2894  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.62 
 
 
529 aa  114  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0165292  hitchhiker  0.000448653 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4075  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  28.79 
 
 
484 aa  114  5e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2653  flavocytochrome c  28.85 
 
 
631 aa  114  5e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.123058 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2558  flavocytochrome c  26.68 
 
 
926 aa  114  6e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3501  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.7 
 
 
510 aa  114  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116635  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  25.75 
 
 
637 aa  114  6e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3495  flavocytochrome c  27.31 
 
 
925 aa  113  8.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  28.24 
 
 
582 aa  113  9e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  26.19 
 
 
519 aa  113  9e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4620  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  27.08 
 
 
582 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  27.44 
 
 
596 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4658  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.61 
 
 
492 aa  113  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  28.34 
 
 
593 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0687  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.94 
 
 
503 aa  112  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  26.07 
 
 
597 aa  111  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0124  Succinate dehydrogenase  25.87 
 
 
497 aa  111  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  27.5 
 
 
596 aa  111  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2398  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  27.54 
 
 
535 aa  111  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401615  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01540  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  28.84 
 
 
501 aa  111  4.0000000000000004e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0190007 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.42 
 
 
519 aa  110  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0405  FMN-binding domain protein  28.83 
 
 
626 aa  109  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.07228 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>