More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4545 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4545  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  100 
 
 		 495 aa  1007    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11847  hypothetical protein  70.91 
 
 		 487 aa  640    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.81807e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2887  hypothetical protein  68.22 
 
 		 658 aa  637    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2856  hypothetical protein  67.89 
 
 		 493 aa  634  1e-180  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2900  hypothetical protein  67.89 
 
 		 493 aa  634  1e-180  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3411  hypothetical protein  64.86 
 
 		 500 aa  634  1e-180  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0735026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0296  hypothetical protein  66.03 
 
 		 493 aa  605  9.999999999999999e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3165  hypothetical protein  64.3 
 
 		 525 aa  601  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0565388  normal  0.0860599 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3488  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  47.34 
 
 		 491 aa  411  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1518  hypothetical protein  39.88 
 
 		 498 aa  325  1e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0214659  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1659  hypothetical protein  40.53 
 
 		 493 aa  309  8e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.224804  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0307  hypothetical protein  41.89 
 
 		 487 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.681233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0316  hypothetical protein  41.89 
 
 		 487 aa  300  3e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.719492  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0326  hypothetical protein  41.89 
 
 		 487 aa  300  3e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.173098 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3686  hypothetical protein  39.54 
 
 		 484 aa  298  2e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3339  hypothetical protein  39.18 
 
 		 488 aa  297  3e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3846  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  40.98 
 
 		 486 aa  284  2.0000000000000002e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2890  hypothetical protein  40.04 
 
 		 486 aa  259  9e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.995147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3515  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  39.31 
 
 		 492 aa  258  1e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.395658  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4550  hypothetical protein  39.63 
 
 		 482 aa  256  6e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.288577 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0773  hypothetical protein  33.69 
 
 		 542 aa  197  5.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000153715  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1860  hypothetical protein  31.26 
 
 		 552 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.903101 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0302  hypothetical protein  30.75 
 
 		 534 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.947471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0312  hypothetical protein  30.75 
 
 		 534 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.337711 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2675  hypothetical protein  33.02 
 
 		 528 aa  176  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0187257  normal  0.0233154 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4564  hypothetical protein  31.32 
 
 		 523 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00360175  normal  0.224392 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1005  hypothetical protein  30.37 
 
 		 555 aa  171  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0143655 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0293  hypothetical protein  29.94 
 
 		 529 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.467949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2883  hypothetical protein  31.61 
 
 		 530 aa  162  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0393135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1298  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.77 
 
 		 569 aa  140  7e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.306259  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  29.42 
 
 		 591 aa  139  8.999999999999999e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3721  hypothetical protein  28.48 
 
 		 587 aa  137  3.0000000000000003e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  29.28 
 
 		 588 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  30.6 
 
 		 609 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  29.7 
 
 		 599 aa  134  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0482  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  29.48 
 
 		 491 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0508  putative dehydrogenase flavoprotein  29.18 
 
 		 560 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.890159  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4658  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.32 
 
 		 492 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3320  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  28.37 
 
 		 564 aa  128  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  29.53 
 
 		 591 aa  127  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0107  flavocytochrome c  28.66 
 
 		 605 aa  126  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  30.46 
 
 		 470 aa  123  6e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  28.37 
 
 		 589 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10160  flavocytochrome c  30.31 
 
 		 603 aa  121  3e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  0.0211586 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  30.43 
 
 		 596 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0200  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  27.42 
 
 		 488 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  27.87 
 
 		 598 aa  120  6e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  27.18 
 
 		 457 aa  117  3e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  30.48 
 
 		 596 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  30.48 
 
 		 596 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  30.48 
 
 		 596 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  27.08 
 
 		 597 aa  117  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  30.48 
 
 		 596 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  29.67 
 
 		 596 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  29.96 
 
 		 596 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1095  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.63 
 
 		 482 aa  117  5e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  28.02 
 
 		 589 aa  117  5e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01540  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  28.07 
 
 		 501 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0190007 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0367  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.67 
 
 		 589 aa  115  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.786243 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4718  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  27.66 
 
 		 564 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.329428 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2796  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.17 
 
 		 578 aa  115  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000175303 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  27.78 
 
 		 596 aa  114  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  26.56 
 
 		 464 aa  114  3e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  27.25 
 
 		 598 aa  114  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2702  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.31 
 
 		 489 aa  114  5e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  27.64 
 
 		 582 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  29.27 
 
 		 597 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  28.12 
 
 		 925 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0049  fumarate reductase flavoprotein subunit  29.05 
 
 		 616 aa  112  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00375543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0488  flavocytochrome c  28.85 
 
 		 606 aa  111  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.203471 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2894  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.13 
 
 		 529 aa  111  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0165292  hitchhiker  0.000448653 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  27.79 
 
 		 586 aa  111  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07260  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  27.66 
 
 		 472 aa  111  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13640  flavocytochrome c  28.45 
 
 		 650 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  28.26 
 
 		 582 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1779  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.88 
 
 		 586 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4620  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  27.64 
 
 		 582 aa  110  5e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4753  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  28.8 
 
 		 554 aa  110  7.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.254581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3335  hypothetical protein  28.02 
 
 		 570 aa  110  8.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248225 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  27.68 
 
 		 504 aa  110  8.000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  29.18 
 
 		 596 aa  109  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2625  flavocytochrome c  28.31 
 
 		 957 aa  108  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809387  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  25.54 
 
 		 608 aa  109  1e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  25.96 
 
 		 517 aa  108  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0142  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.75 
 
 		 553 aa  108  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1037  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  27.16 
 
 		 463 aa  108  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.192722  normal  0.0849595 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4243  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  26.69 
 
 		 601 aa  107  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0945  Succinate dehydrogenase  26.58 
 
 		 511 aa  108  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2825  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.58 
 
 		 498 aa  108  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0405  FMN-binding domain protein  26.1 
 
 		 626 aa  108  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.07228 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5210  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  28.54 
 
 		 517 aa  107  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247495 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4671  putative 3-oxosteroid 1-dehydrogenase  27.59 
 
 		 577 aa  106  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1064  tricarballylate dehydrogenase  26.67 
 
 		 505 aa  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0208  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.43 
 
 		 534 aa  105  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177  normal  0.616185 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2653  flavocytochrome c  26.27 
 
 		 631 aa  105  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.123058 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4075  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  27.2 
 
 		 484 aa  105  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  25.4 
 
 		 519 aa  105  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  27.59 
 
 		 493 aa  104  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000784469 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0325  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  25.36 
 
 		 550 aa  104  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.681292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  27.24 
 
 		 584 aa  104  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>