More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0405 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0405  FMN-binding domain protein  100 
 
 
626 aa  1281    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.07228 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05539  oxidoreductase  28.13 
 
 
1004 aa  175  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  28.49 
 
 
599 aa  164  6e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  29.95 
 
 
597 aa  163  7e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  30.82 
 
 
589 aa  163  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0049  fumarate reductase flavoprotein subunit  28.07 
 
 
616 aa  159  2e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00375543  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0107  flavocytochrome c  29.59 
 
 
605 aa  157  7e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10160  flavocytochrome c  28.65 
 
 
603 aa  154  5e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  0.0211586 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  26.38 
 
 
608 aa  150  9e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3960  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.84 
 
 
577 aa  147  7.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000052594  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  27.92 
 
 
591 aa  146  1e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  28.17 
 
 
598 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0488  flavocytochrome c  27.63 
 
 
606 aa  140  7.999999999999999e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.203471 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2381  NADH:flavin oxidoreductase/fumarate reductase, flavoprotein subunit, putative  24.88 
 
 
1005 aa  139  1e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  28.19 
 
 
586 aa  136  9e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  27.91 
 
 
464 aa  136  9.999999999999999e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  28.06 
 
 
598 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  27.96 
 
 
586 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  27.17 
 
 
637 aa  136  9.999999999999999e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  27.64 
 
 
502 aa  135  1.9999999999999998e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13430  flavocytochrome c  26.56 
 
 
616 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  27.09 
 
 
596 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2653  flavocytochrome c  27.7 
 
 
631 aa  134  5e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.123058 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  25.98 
 
 
582 aa  134  5e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  27.46 
 
 
598 aa  134  6e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  27.56 
 
 
596 aa  133  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  28.69 
 
 
591 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22640  aspartate oxidase  25.63 
 
 
623 aa  132  2.0000000000000002e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.73746 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  27.56 
 
 
596 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  27.33 
 
 
596 aa  131  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  27.73 
 
 
596 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  27.73 
 
 
596 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4325  flavocytochrome c  26.92 
 
 
582 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  27.73 
 
 
596 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  27.73 
 
 
596 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4193  flavocytochrome c  26.92 
 
 
582 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4620  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  26.11 
 
 
582 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0945  Succinate dehydrogenase  26.68 
 
 
511 aa  128  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  26.83 
 
 
582 aa  128  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  27.05 
 
 
597 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  26.15 
 
 
609 aa  128  4.0000000000000003e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0574  FMN-binding domain protein  25.46 
 
 
657 aa  127  8.000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  27.32 
 
 
596 aa  127  9e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  26.97 
 
 
925 aa  126  9e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3495  flavocytochrome c  28.46 
 
 
925 aa  124  5e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  27.39 
 
 
457 aa  124  7e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  26.49 
 
 
584 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  25.78 
 
 
593 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13640  flavocytochrome c  24.88 
 
 
650 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11847  hypothetical protein  33.02 
 
 
487 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.81807e-16  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  26.65 
 
 
504 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2625  flavocytochrome c  26.88 
 
 
957 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809387  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2558  flavocytochrome c  25.32 
 
 
926 aa  108  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3411  hypothetical protein  29.22 
 
 
500 aa  108  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0735026  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  25.88 
 
 
596 aa  106  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1029  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.46 
 
 
509 aa  105  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  24.12 
 
 
596 aa  103  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4545  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.8 
 
 
495 aa  103  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  24.23 
 
 
596 aa  102  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  24.59 
 
 
583 aa  102  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2894  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.11 
 
 
529 aa  102  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0165292  hitchhiker  0.000448653 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4077  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  26.01 
 
 
491 aa  101  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  24.49 
 
 
588 aa  101  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0795  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.25 
 
 
509 aa  99.8  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.820864  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2702  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.97 
 
 
489 aa  100  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3165  hypothetical protein  28.83 
 
 
525 aa  99  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0565388  normal  0.0860599 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4061  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  25.55 
 
 
476 aa  98.6  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  23.98 
 
 
589 aa  98.2  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  25.61 
 
 
465 aa  97.4  7e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0208  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.83 
 
 
534 aa  97.1  9e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177  normal  0.616185 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  24.58 
 
 
596 aa  97.1  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_10064  predicted protein  24.79 
 
 
561 aa  96.7  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.14351 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4075  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  25.38 
 
 
484 aa  94.7  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1003  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.05 
 
 
522 aa  94.4  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3252  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.58 
 
 
523 aa  94  8e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.556116  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3181  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.84 
 
 
523 aa  92.4  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.357921  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13800  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  26.68 
 
 
547 aa  92  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.290223  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04200  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  25.71 
 
 
481 aa  91.7  4e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.906237  normal  0.517886 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1658  FMN-binding domain protein  26.52 
 
 
715 aa  90.9  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1365  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.83 
 
 
628 aa  90.5  7e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00140  fumarate reductase (NADH), putative  25.59 
 
 
635 aa  90.5  8e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0434389  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2887  hypothetical protein  28.83 
 
 
658 aa  90.1  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2778  Succinate dehydrogenase  26.79 
 
 
510 aa  89  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.961247  normal  0.792272 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2856  hypothetical protein  29.03 
 
 
493 aa  89.4  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2900  hypothetical protein  29.03 
 
 
493 aa  89.4  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0687  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.94 
 
 
503 aa  89.7  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.26 
 
 
519 aa  89.4  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0773  hypothetical protein  28.3 
 
 
542 aa  87  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000153715  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12470  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  23.17 
 
 
566 aa  86.3  0.000000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.967758  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51720  fumarate reductase flavoprotein  24.65 
 
 
668 aa  86.7  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.744935  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0682  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.77 
 
 
640 aa  87  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000305666  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2796  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.35 
 
 
578 aa  86.7  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000175303 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23180  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  27.93 
 
 
550 aa  85.9  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0317036 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0486  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.41 
 
 
572 aa  86.3  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.221964 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1095  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.48 
 
 
482 aa  85.1  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0124  Succinate dehydrogenase  25.64 
 
 
497 aa  84.7  0.000000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  23.15 
 
 
589 aa  84.3  0.000000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5790  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein, N-terminal:FAD dependent oxidoreductase  29 
 
 
523 aa  84.3  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.545575  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7946  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.57 
 
 
456 aa  84  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513749  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4658  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.97 
 
 
492 aa  83.2  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>