More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_22640 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_22640  aspartate oxidase  100 
 
 
623 aa  1262    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.73746 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13430  flavocytochrome c  27.42 
 
 
616 aa  150  9e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0488  flavocytochrome c  27.69 
 
 
606 aa  147  7.0000000000000006e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.203471 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  26.17 
 
 
584 aa  146  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  28.73 
 
 
609 aa  144  5e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0405  FMN-binding domain protein  25.88 
 
 
626 aa  142  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.07228 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  27.39 
 
 
599 aa  141  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10160  flavocytochrome c  26.48 
 
 
603 aa  141  4.999999999999999e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  0.0211586 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  28.76 
 
 
597 aa  140  8.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  26.47 
 
 
637 aa  139  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  26.48 
 
 
586 aa  138  4e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  26.35 
 
 
586 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  28.06 
 
 
591 aa  135  3e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0049  fumarate reductase flavoprotein subunit  26.46 
 
 
616 aa  135  3e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00375543  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4077  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  27.37 
 
 
491 aa  133  7.999999999999999e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  25.76 
 
 
608 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2653  flavocytochrome c  28.1 
 
 
631 aa  127  5e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.123058 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  25.88 
 
 
582 aa  125  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  24.42 
 
 
582 aa  124  6e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0107  flavocytochrome c  25.7 
 
 
605 aa  123  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4193  flavocytochrome c  24.61 
 
 
582 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4075  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  28.98 
 
 
484 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4325  flavocytochrome c  24.61 
 
 
582 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4620  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  24.17 
 
 
582 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3960  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.94 
 
 
577 aa  118  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000052594  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  28.93 
 
 
598 aa  118  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2381  NADH:flavin oxidoreductase/fumarate reductase, flavoprotein subunit, putative  23.94 
 
 
1005 aa  117  6e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13800  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  26.68 
 
 
547 aa  117  6e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.290223  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0574  FMN-binding domain protein  24.86 
 
 
657 aa  117  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1365  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.55 
 
 
628 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  26.76 
 
 
588 aa  114  5e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.43 
 
 
519 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13640  flavocytochrome c  25.95 
 
 
650 aa  110  6e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00140  fumarate reductase (NADH), putative  27.23 
 
 
635 aa  108  3e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0434389  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1658  FMN-binding domain protein  25.28 
 
 
715 aa  108  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  28.4 
 
 
591 aa  107  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  25.88 
 
 
502 aa  107  6e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04200  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  25.65 
 
 
481 aa  107  9e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.906237  normal  0.517886 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3181  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.98 
 
 
523 aa  107  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.357921  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07260  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  24.74 
 
 
472 aa  105  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3252  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.09 
 
 
523 aa  104  5e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.556116  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1029  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.2 
 
 
509 aa  104  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  25.11 
 
 
517 aa  103  7e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  26.59 
 
 
596 aa  103  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05539  oxidoreductase  24.22 
 
 
1004 aa  101  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2427  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  24.87 
 
 
599 aa  100  7e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.250716 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0795  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  21.99 
 
 
509 aa  100  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.820864  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0208  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.75 
 
 
534 aa  99.4  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177  normal  0.616185 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2558  flavocytochrome c  25.13 
 
 
926 aa  99.4  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2827  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.8 
 
 
511 aa  99.4  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30250  putative FAD-binding dehydrogenase  25.94 
 
 
572 aa  98.6  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  25.21 
 
 
598 aa  97.8  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  25.86 
 
 
457 aa  97.8  5e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  25.88 
 
 
464 aa  97.1  9e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0482  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  24.44 
 
 
491 aa  96.7  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  26.56 
 
 
589 aa  96.3  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  25.67 
 
 
598 aa  96.7  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  24.34 
 
 
465 aa  96.7  1e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2702  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.69 
 
 
489 aa  95.9  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0945  Succinate dehydrogenase  23.48 
 
 
511 aa  95.9  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27122  predicted protein  27.61 
 
 
587 aa  95.9  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0188056 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52061  predicted protein  27.61 
 
 
587 aa  95.9  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  26.68 
 
 
593 aa  92.8  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01540  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  24 
 
 
501 aa  90.9  7e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0190007 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  27.18 
 
 
596 aa  90.5  8e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  25.79 
 
 
589 aa  90.5  8e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2778  Succinate dehydrogenase  27.57 
 
 
510 aa  90.5  9e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.961247  normal  0.792272 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2894  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.69 
 
 
529 aa  90.5  9e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0165292  hitchhiker  0.000448653 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_10064  predicted protein  26.58 
 
 
561 aa  90.5  9e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.14351 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  25 
 
 
493 aa  89.7  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000784469 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  25.41 
 
 
925 aa  89.7  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  23.44 
 
 
589 aa  89.4  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0508  putative dehydrogenase flavoprotein  25.41 
 
 
560 aa  89  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.890159  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0682  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.99 
 
 
640 aa  89.4  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000305666  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0626  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.88 
 
 
562 aa  89.4  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.770057 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1003  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.92 
 
 
522 aa  89  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4911  putative FAD-binding dehydrogenase  24.39 
 
 
578 aa  88.2  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.855718  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0124  Succinate dehydrogenase  23.59 
 
 
497 aa  87.8  5e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2825  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.07 
 
 
498 aa  87.8  6e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  26.98 
 
 
596 aa  87.4  8e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26410  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  24.47 
 
 
546 aa  87  8e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.991458  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2287  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  25.9 
 
 
558 aa  86.7  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.558415  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3480  hypothetical protein  27.59 
 
 
623 aa  86.7  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1218  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.35 
 
 
500 aa  85.9  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.292447  normal  0.0459445 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2731  putative flavoprotein subunit of a reductase  24.89 
 
 
507 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.620849  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  23.91 
 
 
504 aa  85.5  0.000000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  26.29 
 
 
597 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3495  flavocytochrome c  25.38 
 
 
925 aa  85.1  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23180  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  27.08 
 
 
550 aa  84.3  0.000000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0317036 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  26.4 
 
 
596 aa  84  0.000000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2796  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.28 
 
 
578 aa  83.2  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000175303 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0275  flavocytochrome c  27.1 
 
 
506 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000326146 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2930  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.52 
 
 
512 aa  83.6  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3540  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  28.21 
 
 
580 aa  82.4  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  25.74 
 
 
583 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0687  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.85 
 
 
503 aa  82  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2150  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  22.7 
 
 
563 aa  82  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.357931 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4658  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.84 
 
 
492 aa  81.6  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4061  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  25.05 
 
 
476 aa  81.6  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3521  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.57 
 
 
559 aa  81.6  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>