More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_07260 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_13800  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  89.39 
 
 
547 aa  857    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.290223  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07260  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  100 
 
 
472 aa  966    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07280  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  48.74 
 
 
575 aa  447  1.0000000000000001e-124  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26410  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  34.41 
 
 
546 aa  233  4.0000000000000004e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.991458  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3181  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  32.03 
 
 
523 aa  227  4e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.357921  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3252  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  31.37 
 
 
523 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.556116  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1029  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.32 
 
 
509 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0795  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.32 
 
 
509 aa  217  4e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.820864  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0945  Succinate dehydrogenase  29.57 
 
 
511 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.32 
 
 
519 aa  194  3e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02520  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  30.02 
 
 
527 aa  181  2.9999999999999997e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.152988  normal  0.211132 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2930  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.2 
 
 
512 aa  176  7e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2731  putative flavoprotein subunit of a reductase  27.45 
 
 
507 aa  172  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.620849  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2826  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.72 
 
 
543 aa  169  8e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0298  putative flavoprotein subunit of a reductase  28.27 
 
 
508 aa  150  7e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000145919 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1365  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.95 
 
 
628 aa  143  5e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0172  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.6 
 
 
560 aa  137  4e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.79854  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  25.59 
 
 
608 aa  137  5e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2817  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.11 
 
 
582 aa  131  2.0000000000000002e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0130426 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2796  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.41 
 
 
578 aa  131  3e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000175303 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  26.36 
 
 
588 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3021  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.25 
 
 
552 aa  129  1.0000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.867777  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12630  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  27.9 
 
 
545 aa  127  6e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.479032  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  26.95 
 
 
597 aa  125  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4077  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  27.72 
 
 
491 aa  125  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  27.56 
 
 
598 aa  125  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  26.89 
 
 
464 aa  123  7e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0977  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.36 
 
 
561 aa  122  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  24.46 
 
 
925 aa  121  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0687  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.74 
 
 
503 aa  120  4.9999999999999996e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12470  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  26.75 
 
 
566 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.967758  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12690  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  26.58 
 
 
580 aa  118  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1103  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.43 
 
 
598 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0574  FMN-binding domain protein  25.55 
 
 
657 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03720  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  25.65 
 
 
558 aa  116  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  26.19 
 
 
599 aa  115  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  26.35 
 
 
465 aa  115  2.0000000000000002e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0288  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.53 
 
 
557 aa  114  3e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0486  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.81 
 
 
572 aa  113  7.000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.221964 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3495  flavocytochrome c  24.03 
 
 
925 aa  113  7.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0208  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.71 
 
 
534 aa  113  9e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177  normal  0.616185 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1095  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.27 
 
 
482 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2625  flavocytochrome c  23.94 
 
 
957 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809387  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  28.48 
 
 
470 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1037  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  26.94 
 
 
463 aa  110  6e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.192722  normal  0.0849595 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0182  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.04 
 
 
588 aa  110  7.000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3411  hypothetical protein  27.6 
 
 
500 aa  110  8.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0735026  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2558  flavocytochrome c  24.31 
 
 
926 aa  109  9.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30250  putative FAD-binding dehydrogenase  28.08 
 
 
572 aa  109  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  26.13 
 
 
609 aa  109  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1388  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.97 
 
 
581 aa  108  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0314977  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4075  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  26.74 
 
 
484 aa  108  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  26.23 
 
 
504 aa  108  2e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  25.45 
 
 
589 aa  108  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  27.55 
 
 
591 aa  107  3e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  25.34 
 
 
502 aa  107  4e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0342  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.37 
 
 
557 aa  107  4e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0195755  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0571  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28 
 
 
595 aa  107  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0125  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.05 
 
 
574 aa  107  5e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4545  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.56 
 
 
495 aa  106  9e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22640  aspartate oxidase  24.74 
 
 
623 aa  106  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.73746 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2893  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.1 
 
 
576 aa  105  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  25.87 
 
 
591 aa  105  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0049  fumarate reductase flavoprotein subunit  26.36 
 
 
616 aa  104  4e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00375543  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13430  flavocytochrome c  26.67 
 
 
616 aa  104  4e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  24.62 
 
 
596 aa  103  8e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1218  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.35 
 
 
500 aa  103  9e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.292447  normal  0.0459445 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  24.38 
 
 
457 aa  103  1e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3480  hypothetical protein  26.84 
 
 
623 aa  102  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10160  flavocytochrome c  27.21 
 
 
603 aa  102  2e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  0.0211586 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2698  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.19 
 
 
591 aa  101  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3618  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.68 
 
 
560 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0367  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.15 
 
 
589 aa  100  5e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.786243 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3684  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.68 
 
 
592 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.504489  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0616  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.12 
 
 
618 aa  100  5e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000733379  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  24.71 
 
 
596 aa  100  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7946  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.23 
 
 
456 aa  100  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513749  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  24.59 
 
 
519 aa  100  6e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1157  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  26.55 
 
 
556 aa  100  6e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  24.84 
 
 
596 aa  100  7e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  25.71 
 
 
589 aa  100  7e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  24.38 
 
 
598 aa  99.8  9e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1659  hypothetical protein  27.71 
 
 
493 aa  99.4  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.224804  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2778  Succinate dehydrogenase  26.39 
 
 
510 aa  99.4  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.961247  normal  0.792272 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16630  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  27.98 
 
 
600 aa  98.6  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.770903  normal  0.816981 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  24.78 
 
 
637 aa  98.2  3e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  24.38 
 
 
598 aa  98.2  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0488  flavocytochrome c  26.05 
 
 
606 aa  97.4  4e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.203471 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  25.53 
 
 
593 aa  97.4  5e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2887  hypothetical protein  28.05 
 
 
658 aa  97.1  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0107  flavocytochrome c  25.78 
 
 
605 aa  96.7  7e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2146  putative FAD-binding dehydrogenase  26.18 
 
 
570 aa  97.1  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.18708 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3243  putative FAD-binding dehydrogenase  26.38 
 
 
570 aa  96.7  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.650049 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2381  NADH:flavin oxidoreductase/fumarate reductase, flavoprotein subunit, putative  23.49 
 
 
1005 aa  96.7  9e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  24.84 
 
 
596 aa  96.3  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0183  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.61 
 
 
592 aa  95.9  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  24.5 
 
 
519 aa  95.9  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2856  hypothetical protein  28.1 
 
 
493 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  25.81 
 
 
596 aa  95.9  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05539  oxidoreductase  24.93 
 
 
1004 aa  95.5  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>