More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_23180 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_23180  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  100 
 
 		 550 aa  1124    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0317036 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2381  NADH:flavin oxidoreductase/fumarate reductase, flavoprotein subunit, putative  29.39 
 
 		 1005 aa  203  6e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0049  fumarate reductase flavoprotein subunit  29.2 
 
 		 616 aa  179  1e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00375543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05539  oxidoreductase  28.85 
 
 		 1004 aa  170  7e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  28.99 
 
 		 609 aa  144  4e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  27.88 
 
 		 584 aa  143  7e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10160  flavocytochrome c  33.69 
 
 		 603 aa  140  7.999999999999999e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  0.0211586 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  31.1 
 
 		 598 aa  128  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  30.62 
 
 		 596 aa  127  6e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4325  flavocytochrome c  32.93 
 
 		 582 aa  124  7e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4193  flavocytochrome c  32.93 
 
 		 582 aa  124  7e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  32.63 
 
 		 582 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  31.63 
 
 		 582 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4620  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  31.33 
 
 		 582 aa  121  3e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  27.74 
 
 		 599 aa  121  3.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  31.72 
 
 		 591 aa  121  3.9999999999999996e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  29.41 
 
 		 596 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  29.97 
 
 		 597 aa  120  6e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3501  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.21 
 
 		 510 aa  120  7e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116635  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0107  flavocytochrome c  29.7 
 
 		 605 aa  120  7.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  29.21 
 
 		 596 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  24.78 
 
 		 510 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  29.69 
 
 		 596 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0488  flavocytochrome c  30.75 
 
 		 606 aa  119  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.203471 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  28.57 
 
 		 596 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  29.13 
 
 		 596 aa  118  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  29.41 
 
 		 596 aa  117  6e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  29.41 
 
 		 596 aa  117  6e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  29.41 
 
 		 596 aa  117  6e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  29.41 
 
 		 596 aa  117  6e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  28.93 
 
 		 596 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  29.33 
 
 		 589 aa  117  7.999999999999999e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  27.2 
 
 		 589 aa  117  7.999999999999999e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  29.49 
 
 		 583 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  29.13 
 
 		 596 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1851  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  26.45 
 
 		 532 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2096  flavocytochrome c  27.4 
 
 		 515 aa  113  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148795  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1782  flavocytochrome c  26.62 
 
 		 515 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2287  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  31.09 
 
 		 558 aa  112  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.558415  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1861  flavocytochrome c  26.66 
 
 		 515 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0325  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  25.82 
 
 		 550 aa  111  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.681292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  27.18 
 
 		 608 aa  111  4.0000000000000004e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3495  flavocytochrome c  28.34 
 
 		 925 aa  109  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  27.81 
 
 		 591 aa  109  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  28.61 
 
 		 593 aa  108  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2933  flavocytochrome c  26.96 
 
 		 521 aa  108  4e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  29.05 
 
 		 589 aa  107  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2653  flavocytochrome c  27.27 
 
 		 631 aa  107  7e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.123058 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  30.72 
 
 		 586 aa  106  9e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2558  flavocytochrome c  27.86 
 
 		 926 aa  105  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5210  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  26.67 
 
 		 517 aa  105  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247495 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  28.79 
 
 		 504 aa  105  2e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2894  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.81 
 
 		 529 aa  104  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0165292  hitchhiker  0.000448653 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  28.02 
 
 		 925 aa  105  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0945  Succinate dehydrogenase  25.39 
 
 		 511 aa  104  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1547  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  25.41 
 
 		 530 aa  104  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13640  flavocytochrome c  25.15 
 
 		 650 aa  104  5e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3960  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.65 
 
 		 577 aa  103  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000052594  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  28.48 
 
 		 588 aa  102  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  24.57 
 
 		 465 aa  102  3e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0278  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  26.26 
 
 		 514 aa  101  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.198959  normal  0.93633 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0287  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  25.64 
 
 		 514 aa  101  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205707  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0297  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  25.64 
 
 		 514 aa  101  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.374229 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  29.94 
 
 		 586 aa  100  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3411  hypothetical protein  27.02 
 
 		 500 aa  100  9e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0735026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2865  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  27.39 
 
 		 513 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0071  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.5 
 
 		 512 aa  99  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  28.23 
 
 		 597 aa  99  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04280  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  28.48 
 
 		 584 aa  98.2  3e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.517079  normal  0.225555 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2731  putative flavoprotein subunit of a reductase  23.19 
 
 		 507 aa  96.7  9e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.620849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22640  aspartate oxidase  25.57 
 
 		 623 aa  96.3  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.73746 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2625  flavocytochrome c  25.57 
 
 		 957 aa  95.5  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809387  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  26.63 
 
 		 515 aa  94.7  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0270  flavocytochrome c flavin subunit  24.31 
 
 		 511 aa  93.6  8e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13430  flavocytochrome c  26.32 
 
 		 616 aa  92.8  1e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  28.72 
 
 		 470 aa  92.8  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3165  hypothetical protein  27.35 
 
 		 525 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0565388  normal  0.0860599 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  24.51 
 
 		 596 aa  92.4  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0208  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.84 
 
 		 534 aa  91.7  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177  normal  0.616185 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  26.61 
 
 		 517 aa  91.7  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  26.01 
 
 		 464 aa  92  3e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04200  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  25.82 
 
 		 481 aa  91.7  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.906237  normal  0.517886 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0768  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.72 
 
 		 550 aa  90.9  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13800  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  26.94 
 
 		 547 aa  90.5  6e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.290223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2893  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.21 
 
 		 576 aa  90.1  8e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.07 
 
 		 519 aa  90.1  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2930  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.49 
 
 		 512 aa  90.1  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2150  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  24.1 
 
 		 563 aa  89  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.357931 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1444  flavocytochrome c  23.43 
 
 		 512 aa  88.2  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26990  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  26.92 
 
 		 551 aa  88.6  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0687  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.7 
 
 		 503 aa  87.4  6e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02520  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  27.99 
 
 		 527 aa  87.4  6e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.152988  normal  0.211132 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1580  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  25.46 
 
 		 550 aa  87.4  7e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4718  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  28.31 
 
 		 564 aa  87  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.329428 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  27.49 
 
 		 519 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0405  FMN-binding domain protein  27.93 
 
 		 626 aa  86.3  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.07228 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2046  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.27 
 
 		 571 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.302213  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  27.51 
 
 		 519 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3320  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  28.9 
 
 		 564 aa  85.9  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2817  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.53 
 
 		 582 aa  85.1  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0130426 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>