More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0071 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0071  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  100 
 
 
512 aa  1044    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  30.87 
 
 
598 aa  159  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  31.06 
 
 
609 aa  154  4e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  28.33 
 
 
457 aa  144  4e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2796  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.41 
 
 
578 aa  139  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000175303 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  28.69 
 
 
588 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  28.11 
 
 
599 aa  135  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  28.38 
 
 
637 aa  130  5.0000000000000004e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  27.54 
 
 
591 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0208  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.21 
 
 
534 aa  129  9.000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177  normal  0.616185 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02520  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  27.24 
 
 
527 aa  129  1.0000000000000001e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.152988  normal  0.211132 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2930  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.12 
 
 
512 aa  128  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  26.45 
 
 
597 aa  127  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  28.26 
 
 
589 aa  126  7e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0795  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.65 
 
 
509 aa  125  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.820864  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1029  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.23 
 
 
509 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.91 
 
 
519 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  26.65 
 
 
502 aa  122  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0107  flavocytochrome c  29.67 
 
 
605 aa  120  7e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  28.01 
 
 
504 aa  120  9e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0913  flavocytochrome c  27.84 
 
 
483 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.387235  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3252  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.77 
 
 
523 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.556116  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1003  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.53 
 
 
522 aa  117  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  30.28 
 
 
591 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3181  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.18 
 
 
523 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.357921  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  27.19 
 
 
608 aa  117  6e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  26.22 
 
 
589 aa  115  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5492  putative succinate dehydrogenase  26.39 
 
 
567 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2826  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.77 
 
 
543 aa  114  3e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10160  flavocytochrome c  33.56 
 
 
603 aa  114  3e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  0.0211586 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2933  flavocytochrome c  25.7 
 
 
521 aa  114  6e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13430  flavocytochrome c  27.71 
 
 
616 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  28.95 
 
 
586 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5045  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  26.59 
 
 
563 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4662  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  26.42 
 
 
563 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3495  flavocytochrome c  28.28 
 
 
925 aa  111  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3501  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.29 
 
 
510 aa  111  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116635  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4750  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  26.42 
 
 
563 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.309954  normal  0.275452 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05539  oxidoreductase  27.25 
 
 
1004 aa  111  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3960  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  31.13 
 
 
577 aa  111  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000052594  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20240  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  30.99 
 
 
584 aa  110  6e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.613338  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  25.41 
 
 
517 aa  109  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  27.61 
 
 
596 aa  109  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  25.41 
 
 
519 aa  108  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0124  Succinate dehydrogenase  27.22 
 
 
497 aa  107  4e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  25.52 
 
 
464 aa  107  6e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  26.61 
 
 
589 aa  107  6e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  27.46 
 
 
925 aa  107  6e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0945  Succinate dehydrogenase  25.68 
 
 
511 aa  106  8e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01540  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  25.43 
 
 
501 aa  106  9e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0190007 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  28.29 
 
 
586 aa  106  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  27.21 
 
 
584 aa  105  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  30.23 
 
 
582 aa  105  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3021  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.33 
 
 
552 aa  104  3e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.867777  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0773  hypothetical protein  28.66 
 
 
542 aa  105  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000153715  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2690  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.63 
 
 
557 aa  104  4e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03720  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  23.47 
 
 
558 aa  104  4e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0086  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.07 
 
 
515 aa  104  4e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13640  flavocytochrome c  26.39 
 
 
650 aa  103  5e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4753  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  27.39 
 
 
554 aa  103  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.254581  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4075  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  27.47 
 
 
484 aa  103  8e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4620  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  30.23 
 
 
582 aa  103  9e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3848  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.37 
 
 
571 aa  102  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1365  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.93 
 
 
628 aa  102  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  28.25 
 
 
593 aa  103  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2432  flavocytochrome c  24.58 
 
 
517 aa  102  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77876  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0367  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.63 
 
 
589 aa  102  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.786243 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0049  fumarate reductase flavoprotein subunit  26.72 
 
 
616 aa  102  2e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00375543  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20340  putative succinate dehydrogenase  25.61 
 
 
581 aa  101  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.78266  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2825  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.95 
 
 
498 aa  101  3e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0977  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.42 
 
 
561 aa  101  3e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13570  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  25.05 
 
 
563 aa  100  4e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000282742 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07280  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  24.09 
 
 
575 aa  100  4e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0182  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.82 
 
 
588 aa  100  6e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0342  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.87 
 
 
557 aa  100  8e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0195755  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  25.34 
 
 
465 aa  100  8e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2381  NADH:flavin oxidoreductase/fumarate reductase, flavoprotein subunit, putative  25.63 
 
 
1005 aa  99.8  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12630  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  27.56 
 
 
545 aa  99.8  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.479032  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  25.05 
 
 
517 aa  99.8  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  26.74 
 
 
598 aa  99.4  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1103  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.17 
 
 
598 aa  99.4  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0687  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.94 
 
 
503 aa  99.8  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2291  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.85 
 
 
565 aa  98.6  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2625  flavocytochrome c  24.72 
 
 
957 aa  98.2  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809387  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  26.13 
 
 
519 aa  98.2  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  29.9 
 
 
582 aa  97.8  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2702  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.95 
 
 
489 aa  97.8  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4243  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  28.74 
 
 
601 aa  97.8  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  25.32 
 
 
596 aa  97.1  6e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12690  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  24.23 
 
 
580 aa  97.1  7e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13800  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  24.55 
 
 
547 aa  97.1  7e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.290223  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  24.82 
 
 
519 aa  97.1  8e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27122  predicted protein  26.69 
 
 
587 aa  96.7  8e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0188056 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52061  predicted protein  26.69 
 
 
587 aa  96.7  8e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  24.25 
 
 
596 aa  96.7  9e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  25.27 
 
 
596 aa  96.7  9e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  26.3 
 
 
598 aa  95.9  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0895  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.22 
 
 
578 aa  95.1  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4061  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  25.74 
 
 
476 aa  95.5  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04200  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  26.41 
 
 
481 aa  95.5  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.906237  normal  0.517886 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>