280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1658 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1658  FMN-binding domain protein  100 
 
 
715 aa  1452    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0574  FMN-binding domain protein  26.16 
 
 
657 aa  131  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0945  Succinate dehydrogenase  28.4 
 
 
511 aa  126  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1365  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.27 
 
 
628 aa  117  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4075  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  25.54 
 
 
484 aa  116  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1029  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.3 
 
 
509 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3181  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.87 
 
 
523 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.357921  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  26.34 
 
 
609 aa  110  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0795  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.7 
 
 
509 aa  110  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.820864  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  25.2 
 
 
637 aa  110  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3252  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.87 
 
 
523 aa  110  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.556116  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  26.32 
 
 
591 aa  108  3e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.14 
 
 
519 aa  107  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0049  fumarate reductase flavoprotein subunit  25.34 
 
 
616 aa  106  1e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00375543  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22640  aspartate oxidase  25.12 
 
 
623 aa  105  4e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.73746 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26410  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  25.83 
 
 
546 aa  102  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.991458  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0682  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  51.33 
 
 
640 aa  101  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000305666  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  26.22 
 
 
608 aa  100  1e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13430  flavocytochrome c  26.08 
 
 
616 aa  99.8  2e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  25.37 
 
 
599 aa  99.4  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  24.6 
 
 
597 aa  98.6  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  26.72 
 
 
582 aa  97.8  7e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  24.68 
 
 
584 aa  97.1  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  25.08 
 
 
582 aa  97.1  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0208  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.07 
 
 
534 aa  95.9  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177  normal  0.616185 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4620  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  25.12 
 
 
582 aa  95.5  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1095  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25 
 
 
482 aa  95.5  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07260  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  25.4 
 
 
472 aa  94  8e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4325  flavocytochrome c  25.76 
 
 
582 aa  94  9e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4193  flavocytochrome c  25.76 
 
 
582 aa  94  9e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0405  FMN-binding domain protein  26.64 
 
 
626 aa  91.3  6e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.07228 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13640  flavocytochrome c  24.96 
 
 
650 aa  89  2e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13800  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  25.34 
 
 
547 aa  89.7  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.290223  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0298  putative flavoprotein subunit of a reductase  24.31 
 
 
508 aa  88.6  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000145919 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  25.29 
 
 
464 aa  89  3e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05539  oxidoreductase  23.93 
 
 
1004 aa  88.2  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  26.22 
 
 
598 aa  87.8  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2731  putative flavoprotein subunit of a reductase  25.7 
 
 
507 aa  87.8  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.620849  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4061  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  23.72 
 
 
476 aa  86.7  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0182  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.39 
 
 
588 aa  85.9  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12630  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  24.06 
 
 
545 aa  86.7  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.479032  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3768  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  23.33 
 
 
460 aa  85.5  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  25.7 
 
 
586 aa  85.9  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2204  FMN-binding domain protein  40.48 
 
 
138 aa  82.8  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  25.7 
 
 
586 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3694  twin-arginine translocation pathway signal  25.09 
 
 
559 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2653  flavocytochrome c  24.14 
 
 
631 aa  82.4  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.123058 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  23.51 
 
 
493 aa  82  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000784469 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1388  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.64 
 
 
581 aa  80.5  0.00000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0314977  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0172  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.41 
 
 
560 aa  79.7  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.79854  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01540  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  24.81 
 
 
501 aa  79.7  0.0000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0190007 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2796  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.02 
 
 
578 aa  79.3  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000175303 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3960  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.42 
 
 
577 aa  79  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000052594  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3021  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.1 
 
 
552 aa  78.6  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.867777  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0342  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.09 
 
 
557 aa  78.2  0.0000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0195755  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0652  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.09 
 
 
580 aa  77.8  0.0000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.200112  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2930  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.43 
 
 
512 aa  77.4  0.0000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07280  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  23.4 
 
 
575 aa  76.6  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1157  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  25 
 
 
556 aa  77  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13450  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  24.41 
 
 
600 aa  77  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  23.94 
 
 
502 aa  75.9  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2381  NADH:flavin oxidoreductase/fumarate reductase, flavoprotein subunit, putative  24.25 
 
 
1005 aa  75.1  0.000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0107  flavocytochrome c  23.73 
 
 
605 aa  75.1  0.000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0977  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.24 
 
 
561 aa  74.7  0.000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2291  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.33 
 
 
565 aa  74.3  0.000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  25.72 
 
 
591 aa  73.9  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03720  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  24.29 
 
 
558 aa  73.9  0.000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0071  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.45 
 
 
512 aa  74.3  0.000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  23.33 
 
 
925 aa  73.9  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0626  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.85 
 
 
562 aa  73.6  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.770057 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2625  flavocytochrome c  23.61 
 
 
957 aa  73.6  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809387  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2787  twin-arginine translocation pathway signal  23.88 
 
 
553 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0355  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like protein  24.3 
 
 
471 aa  72.4  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3181  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  24.9 
 
 
555 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.449651  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02608  conserved hypothetical protein  23.94 
 
 
508 aa  72  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.262389 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2533  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.19 
 
 
555 aa  71.6  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  26.11 
 
 
589 aa  72  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1003  FMN-binding domain-containing protein  31.8 
 
 
576 aa  71.2  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000126222  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  24.14 
 
 
598 aa  70.9  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3495  flavocytochrome c  22.78 
 
 
925 aa  70.5  0.00000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10160  flavocytochrome c  22.19 
 
 
603 aa  70.9  0.00000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  0.0211586 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  23.42 
 
 
596 aa  70.5  0.00000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1103  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.03 
 
 
598 aa  70.1  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1083  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  31.02 
 
 
368 aa  69.7  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0590058 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  23.33 
 
 
457 aa  68.9  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4077  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  24.23 
 
 
491 aa  69.3  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  23.37 
 
 
598 aa  68.2  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0025  FMN-binding domain protein  35.16 
 
 
517 aa  68.2  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01750  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  25.65 
 
 
597 aa  68.2  0.0000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000634922 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18790  FMN-binding domain protein  28.99 
 
 
251 aa  67.8  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000782843  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0688  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.55 
 
 
454 aa  67  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0793917  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1030  FMN-binding domain protein  39.84 
 
 
134 aa  66.6  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0519  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.88 
 
 
607 aa  67  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.220754 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2825  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.91 
 
 
498 aa  67  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2894  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  21.8 
 
 
529 aa  67  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0165292  hitchhiker  0.000448653 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0488  flavocytochrome c  26.47 
 
 
606 aa  65.9  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.203471 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3180  FMN-binding domain protein  37.84 
 
 
116 aa  66.2  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.321084  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0913  flavocytochrome c  23.68 
 
 
483 aa  65.9  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.387235  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00140  fumarate reductase (NADH), putative  24.6 
 
 
635 aa  65.1  0.000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0434389  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1102  FMN-binding domain protein  36.84 
 
 
126 aa  65.5  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>