67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2204 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2204  FMN-binding domain protein  100 
 
 
138 aa  271  2.0000000000000002e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3960  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  38.17 
 
 
577 aa  94.4  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000052594  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2653  flavocytochrome c  42.45 
 
 
631 aa  93.6  9e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.123058 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  39.47 
 
 
637 aa  80.5  0.000000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0574  FMN-binding domain protein  39.37 
 
 
657 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1658  FMN-binding domain protein  41.07 
 
 
715 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10160  flavocytochrome c  39.36 
 
 
603 aa  75.1  0.0000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  0.0211586 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  36.57 
 
 
609 aa  73.9  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13430  flavocytochrome c  43.18 
 
 
616 aa  72.8  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0107  flavocytochrome c  38.98 
 
 
605 aa  72.4  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05539  oxidoreductase  37.23 
 
 
1004 aa  71.2  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2340  FMN-binding domain-containing protein  34.11 
 
 
120 aa  70.9  0.000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0930241  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0405  FMN-binding domain protein  35.48 
 
 
626 aa  70.5  0.000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.07228 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13640  flavocytochrome c  36.29 
 
 
650 aa  70.1  0.00000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  32.77 
 
 
591 aa  68.6  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2381  NADH:flavin oxidoreductase/fumarate reductase, flavoprotein subunit, putative  32 
 
 
1005 aa  68.6  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  32.35 
 
 
597 aa  67  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0025  FMN-binding domain protein  30.23 
 
 
517 aa  66.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0049  fumarate reductase flavoprotein subunit  37.63 
 
 
616 aa  65.9  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00375543  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1780  FMN-binding domain protein  35.43 
 
 
127 aa  65.1  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1365  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  42.55 
 
 
628 aa  63.9  0.0000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  41.11 
 
 
608 aa  63.9  0.0000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0488  flavocytochrome c  32.37 
 
 
606 aa  63.5  0.0000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.203471 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4325  flavocytochrome c  41.03 
 
 
582 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4193  flavocytochrome c  41.03 
 
 
582 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4620  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  41.03 
 
 
582 aa  58.9  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0682  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  38.32 
 
 
640 aa  58.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000305666  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  39.74 
 
 
582 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  41.03 
 
 
582 aa  58.2  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2139  FMN-binding domain protein  37.01 
 
 
123 aa  57.4  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0137  FMN-binding domain protein  42.5 
 
 
127 aa  54.3  0.0000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000187811  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1083  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  39.76 
 
 
368 aa  54.3  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0590058 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  29.84 
 
 
599 aa  53.9  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  39.74 
 
 
586 aa  53.5  0.0000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22640  aspartate oxidase  36.84 
 
 
623 aa  53.1  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.73746 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1419  hypothetical protein  29.69 
 
 
450 aa  53.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1538  FMN-binding domain protein  37.36 
 
 
118 aa  53.5  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.628376  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1713  FMN-binding domain protein  41.67 
 
 
702 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2923  FMN-binding domain protein  32.03 
 
 
118 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  38.46 
 
 
586 aa  53.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1972  FMN-binding domain-containing protein  30.37 
 
 
449 aa  52.4  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.195856 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0652  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  32.93 
 
 
580 aa  52.4  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.200112  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24380  hypothetical protein  30.32 
 
 
177 aa  51.2  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2009  FMN-binding domain protein  29.82 
 
 
120 aa  51.6  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000039478  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2091  FMN-binding domain-containing protein  28.57 
 
 
447 aa  49.3  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.857142  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2682  FMN-binding domain protein  36.25 
 
 
725 aa  48.9  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000182081  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  33.33 
 
 
598 aa  47.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21270  hypothetical protein  34.35 
 
 
120 aa  47.8  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3782  FMN-binding domain protein  36.62 
 
 
715 aa  47.4  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00440346  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1102  FMN-binding domain protein  31.45 
 
 
126 aa  47.4  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2279  FMN-binding domain-containing protein  26.67 
 
 
448 aa  46.2  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.399623  normal  0.681232 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0505  succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  32.43 
 
 
597 aa  45.4  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0617  FMN-binding domain-containing protein  34.38 
 
 
97 aa  45.4  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0694  FMN-binding domain protein  30.19 
 
 
391 aa  45.1  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6145  FMN-binding domain protein  33.73 
 
 
185 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.662077  normal  0.0358485 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04000  FMN-binding domain protein  35.29 
 
 
127 aa  44.7  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000143856  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2117  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  35 
 
 
169 aa  45.1  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1003  FMN-binding domain-containing protein  28.46 
 
 
576 aa  44.7  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000126222  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0651  FMN-binding domain-containing protein  27.43 
 
 
203 aa  43.9  0.0008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.330764  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0904  succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  32.5 
 
 
603 aa  43.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000602214 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0697  FMN-binding domain protein  36.47 
 
 
201 aa  42.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.820437  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1030  FMN-binding domain protein  35.56 
 
 
134 aa  42.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1382  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  40.54 
 
 
190 aa  42.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000000652446  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1735  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  33 
 
 
190 aa  42.7  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  30.65 
 
 
584 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0796  FMN-binding domain protein  34.44 
 
 
130 aa  41.2  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1394  FMN-binding domain protein  24.5 
 
 
165 aa  40.8  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>